245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2620 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  631  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  94.03 
 
 		 318 aa  599  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  93.71 
 
 		 318 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  93.71 
 
 		 318 aa  598  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  93.71 
 
 		 318 aa  594  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  88.99 
 
 		 318 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  88.36 
 
 		 318 aa  564  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  88.36 
 
 		 318 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  88.36 
 
 		 318 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  67.3 
 
 		 318 aa  439  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  65.09 
 
 		 330 aa  431  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  59.43 
 
 		 318 aa  396  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  59.12 
 
 		 318 aa  390  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  56.05 
 
 		 316 aa  332  4e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  46.86 
 
 		 318 aa  261  8e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  39.56 
 
 		 319 aa  246  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  37.97 
 
 		 319 aa  242  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  41.88 
 
 		 315 aa  229  4e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  45.6 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  43.81 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  41.59 
 
 		 318 aa  227  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  43.81 
 
 		 318 aa  226  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  43.81 
 
 		 318 aa  226  4e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  40.38 
 
 		 313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  42.21 
 
 		 313 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  42.01 
 
 		 319 aa  215  8e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  40.89 
 
 		 313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  40.89 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  40.85 
 
 		 313 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  40.39 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  40.58 
 
 		 313 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  40.58 
 
 		 316 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0732  permease  40.69 
 
 		 319 aa  203  3e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  43.62 
 
 		 295 aa  202  8e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  37.74 
 
 		 316 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  40.26 
 
 		 316 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1780  auxin efflux carrier  42.14 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0290107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  37.87 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  36.21 
 
 		 313 aa  159  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  30.48 
 
 		 315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  31.35 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  31.89 
 
 		 307 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  33.21 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  31.35 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  29.12 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  30.13 
 
 		 307 aa  103  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  31.38 
 
 		 308 aa  102  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  28.04 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  29.9 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  31.16 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  29.9 
 
 		 303 aa  98.2  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  33.12 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  28.42 
 
 		 336 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  28.42 
 
 		 336 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  27.7 
 
 		 339 aa  95.9  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  28.98 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  25.99 
 
 		 305 aa  94.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  27.54 
 
 		 310 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  27.54 
 
 		 336 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  26.46 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  27.89 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  30.24 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  27.74 
 
 		 306 aa  90.9  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  30.04 
 
 		 312 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  32.53 
 
 		 314 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  31.1 
 
 		 315 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  32.41 
 
 		 304 aa  89  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  26.5 
 
 		 362 aa  89  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  26.71 
 
 		 306 aa  89  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  26.23 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  25.74 
 
 		 305 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  26.99 
 
 		 297 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  25.77 
 
 		 312 aa  87.4  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  26.54 
 
 		 317 aa  85.9  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  28.19 
 
 		 304 aa  85.9  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  32.4 
 
 		 301 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  27.86 
 
 		 330 aa  85.9  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  30.43 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  25.85 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  28.91 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  28.24 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  28.2 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  29.27 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  27.74 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  27.74 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3460  Auxin Efflux Carrier  28.38 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  30.43 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.74 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  27.04 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  26.77 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  22.98 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  26.67 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  27.69 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  25.67 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  27.16 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  28.01 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  27.68 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  31.19 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  24.49 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  26.98 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>