98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4929 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4929  putative periplasmic chaperone protein  100 
 
 		 235 aa  474  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4981  putative periplasmic chaperone protein  99.57 
 
 		 235 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4895  putative periplasmic chaperone protein  99.15 
 
 		 235 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0492  Pili assembly chaperone, N-terminal  50.46 
 
 		 224 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1132  pili assembly chaperone  42.74 
 
 		 237 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1678  putative periplasmic chaperone protein  41.06 
 
 		 245 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2407  putative periplasmic chaperone protein  42.01 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1754  putative periplasmic chaperone protein  38.65 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6325  putative periplasmic chaperone protein  38.65 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.997215  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4477  pili assembly chaperone  37.39 
 
 		 282 aa  151  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.287547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0164  putative periplasmic chaperone protein  29.36 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1632  putative periplasmic chaperone protein  29.36 
 
 		 236 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0992283  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3781  putative periplasmic chaperone protein  30.84 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0671  putative periplasmic chaperone protein  30.84 
 
 		 247 aa  97.1  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00513818  normal  0.436881 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3869  putative periplasmic chaperone protein  30.84 
 
 		 247 aa  97.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  25.89 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  28.4 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  26.87 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  25.89 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  25.89 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  25.89 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  25.89 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  26.2 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0499  pili assembly chaperone  33.16 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298988  decreased coverage  0.000379472 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0167  pili assembly chaperone  33.16 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4046  pili assembly chaperone  33.16 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  29.45 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  29.45 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  29.45 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  29.45 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  27.78 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.29 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  27.88 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  26.8 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  28.02 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4845  pili assembly chaperone  24.53 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5004  pili assembly chaperone  25.95 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5007  pili assembly chaperone  25.95 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4952  pili assembly chaperone  25.95 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59760  putative pili assembly chaperone  27.67 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000219223  hitchhiker  1.4963800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4918  pili assembly chaperone  25.95 
 
 		 227 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.458934  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37000  chaperone CupA5  29.75 
 
 		 237 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.883088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0060  periplasmic pilus chaperone CS3-1  26.12 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  30.07 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2677  pili assembly chaperone  24.74 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0736658  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  28.49 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1530  chaperone protein PsaB precursor  24.74 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000277957  normal  0.0151187 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2631  periplasmic pilus chaperone family protein  31.37 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2758  pili assembly chaperone  24.74 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  25.12 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  30.07 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  24.86 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  30.07 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  25.24 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0337  pilus assembly chaperone  27.62 
 
 		 245 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0839363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0337  periplasmic fimbrial chaperone protein  26.52 
 
 		 246 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.963877  normal  0.0114031 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3183  chaperone protein PapD  23.08 
 
 		 247 aa  48.9  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2282  Pili assembly chaperone, N-terminal  24.41 
 
 		 234 aa  48.5  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  26.2 
 
 		 253 aa  48.5  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  26.97 
 
 		 234 aa  48.5  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  26.64 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2488  periplasmic pilus chaperone family protein  30.72 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1316  pili assembly chaperone  30.72 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2495  fimbrial chaperone protein  31.25 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0727302  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1320  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.72 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  26.19 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0330  gram-negative pili assembly chaperone  26.67 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.580697  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  23.44 
 
 		 227 aa  46.2  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3246  pili assembly chaperone protein  22.49 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150608 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3197  pili assembly chaperone protein  22.49 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  24.03 
 
 		 246 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  29.12 
 
 		 248 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3260  pili assembly chaperone protein  22.49 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3362  pili assembly chaperone protein  22.49 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0478294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  25.39 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02261  predicted periplasmic pilus chaperone  29.41 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  26.53 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2716  fimbrial chaperone protein  30.12 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.435606  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02221  hypothetical protein  29.41 
 
 		 230 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  25.99 
 
 		 244 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1663  pili assembly chaperone  24.72 
 
 		 275 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.44583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  26.39 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3479  chaperone protein PapD  28.89 
 
 		 252 aa  43.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  27.06 
 
 		 241 aa  42.7  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  23.7 
 
 		 250 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3392  pili assembly chaperone  21.58 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4194  long polar fimbrial operon protein LpfB  27.1 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0696  pili assembly chaperone  26.82 
 
 		 239 aa  42.4  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0251  fimbrial chaperone protein  26.82 
 
 		 239 aa  42.4  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0319296  hitchhiker  0.0000992715 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  26.82 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0615  chaperone protein PapD  26.67 
 
 		 239 aa  42  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4722  pili assembly chaperone  27.63 
 
 		 252 aa  42.4  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.570892  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00481  pilin chaperone, periplasmic  24.68 
 
 		 230 aa  42  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00486  hypothetical protein  24.68 
 
 		 230 aa  42  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3082  Pili assembly chaperone, N-terminal  24.68 
 
 		 230 aa  42  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3091  pili assembly chaperone  24.68 
 
 		 230 aa  42  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.554326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0824  Pili assembly chaperone, N-terminal  26.19 
 
 		 249 aa  42  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0576  chaperone protein FimC-like protein  24.68 
 
 		 230 aa  42  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.128277  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>