More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0881 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0881  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 168 aa  332  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  43.97 
 
 		 157 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  42.18 
 
 		 149 aa  114  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  41.14 
 
 		 154 aa  104  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  38.04 
 
 		 161 aa  97.4  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2098  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 155 aa  91.3  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0688139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3523  transcriptional regulator, TrmB  33.99 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0643  transcriptional regulator, MarR family  31.16 
 
 		 151 aa  86.3  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0797969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2959  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000427838 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  35.76 
 
 		 165 aa  85.1  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  39.01 
 
 		 153 aa  84.7  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1841  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100194  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1519  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0826678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3355  MarR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496446  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3128  regulatory protein, MarR  33.54 
 
 		 204 aa  64.3  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 139 aa  63.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  35.38 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  34.56 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  48.1 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 148 aa  62  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 137 aa  60.5  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7578  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  34.02 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  28.28 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  43.42 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 139 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  30.22 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  37.62 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  35.16 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  26.77 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37340  transcriptional regulator  35 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.186615 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  40.28 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  34.62 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  36.25 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  28.18 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  28.18 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3064  transcriptional regulator  33.01 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  28.7 
 
 		 140 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  44.44 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 149 aa  52  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 140 aa  52  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 150 aa  52  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>