More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2805 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  764    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  47.41 
 
 		 376 aa  342  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  47.41 
 
 		 393 aa  341  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  48.04 
 
 		 379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  47.52 
 
 		 379 aa  335  7e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0767  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  36.32 
 
 		 380 aa  249  8e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.016013  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0429  hydrogenase 4 membrane subunit  35.7 
 
 		 380 aa  241  2e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100883  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1166  ABC transporter, permease protein  32.54 
 
 		 371 aa  209  5e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0446  integral membrane protein-permease component  32.28 
 
 		 373 aa  209  9e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0528  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  32.19 
 
 		 376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.284767  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1834  ABC transporter, permease protein  31.76 
 
 		 372 aa  195  1e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1653  ABC transporter, permease protein  31.23 
 
 		 372 aa  194  3e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2022  ABC transporter, permease protein  31.5 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1515  permease domain protein  28.83 
 
 		 373 aa  177  3e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000964832  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1869  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.35 
 
 		 418 aa  155  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1514  permease domain protein  27.52 
 
 		 425 aa  150  4e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1251  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  29.61 
 
 		 407 aa  150  5e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.430375  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  29.26 
 
 		 429 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  29.03 
 
 		 429 aa  143  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  29.13 
 
 		 430 aa  142  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  29.13 
 
 		 430 aa  142  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3550  protein of unknown function DUF214  29.3 
 
 		 408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1868  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.23 
 
 		 370 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0527  ABC transport permease protein  24.07 
 
 		 414 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0117375  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  25.06 
 
 		 430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  24.88 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3549  protein of unknown function DUF214  28.5 
 
 		 386 aa  126  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1252  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  25.6 
 
 		 434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.888586  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2021  ABC transporter, permease protein  21.79 
 
 		 429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1652  ABC transporter, permease protein  21.56 
 
 		 429 aa  113  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  26.56 
 
 		 386 aa  113  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  25.14 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1167  ABC transporter, permease protein  23.91 
 
 		 430 aa  111  3e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1833  ABC transporter, permease protein  21.53 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0163  efflux ABC transporter, permease protein  23.54 
 
 		 444 aa  107  3e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2806  hypothetical protein  28.29 
 
 		 429 aa  107  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.398602  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0164  efflux ABC transporter, permease protein  24.73 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  24.93 
 
 		 386 aa  99.8  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  24.84 
 
 		 386 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0447  ABC transport permease protein  22.94 
 
 		 426 aa  98.6  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  25.16 
 
 		 386 aa  95.1  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  23.24 
 
 		 386 aa  94  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  23.9 
 
 		 386 aa  93.2  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  24.87 
 
 		 389 aa  92.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  25.06 
 
 		 386 aa  92  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  23.93 
 
 		 385 aa  87  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  24.92 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2135  lipoprotein ABC transporter permease  29.79 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.142253 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  26.96 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  24.82 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  32.09 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  32.31 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  27.38 
 
 		 794 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  32.11 
 
 		 848 aa  72  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  31.71 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  27 
 
 		 850 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  33.08 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  26.16 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  32.56 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2040  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.23 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.489126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  21.99 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  30 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  23.86 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2729  protein of unknown function DUF214  29.49 
 
 		 796 aa  66.6  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  25.81 
 
 		 399 aa  66.2  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  28.2 
 
 		 835 aa  66.2  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  23.85 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24 
 
 		 386 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  32.06 
 
 		 394 aa  66.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.98 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  25 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.57 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  37.61 
 
 		 421 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  23.25 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  29.63 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  28.47 
 
 		 852 aa  64.3  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  36.7 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  25.98 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  22.68 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  26.33 
 
 		 406 aa  62.8  0.000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  27.67 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  21.85 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  25.7 
 
 		 803 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  27.86 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  27.04 
 
 		 838 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  26.81 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  25.58 
 
 		 849 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  28.5 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  24.38 
 
 		 640 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1650  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  26.59 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.45 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  29.03 
 
 		 841 aa  62  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  23.28 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  35.78 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2475  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  26.95 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.566414  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  23.15 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  32.58 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  27.08 
 
 		 851 aa  60.8  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  32.85 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  25.19 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>