More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2396 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2396  putative FecR  100 
 
 		 331 aa  615  1e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0170576  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0884  putative FecR  45.33 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  34.78 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  33.75 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  33.44 
 
 		 335 aa  132  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  36.76 
 
 		 328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  35.29 
 
 		 377 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  33.89 
 
 		 339 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1733  FecR protein  33.65 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.204897 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  33.23 
 
 		 319 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  31.92 
 
 		 331 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  33.22 
 
 		 327 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  35.42 
 
 		 320 aa  125  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  31.53 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0895  FecR protein  29.15 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.281234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  31.33 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  32.38 
 
 		 337 aa  123  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  33.12 
 
 		 327 aa  123  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  32.33 
 
 		 342 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  32.76 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  33.64 
 
 		 324 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  35.02 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  30.5 
 
 		 336 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  29.72 
 
 		 335 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  28.81 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  29.45 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  25.59 
 
 		 350 aa  116  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  31.38 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  33.68 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  33.46 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1630  putative FecR  38.65 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  33.33 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  34.08 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  30.18 
 
 		 320 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  29.47 
 
 		 320 aa  110  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0641  anti-FecI sigma factor, FecR  31.25 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0804567 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  32.55 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  31.68 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1718  putative transmembrane sensor  35.43 
 
 		 329 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  32.98 
 
 		 309 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  30.79 
 
 		 342 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  29.85 
 
 		 318 aa  106  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  27.76 
 
 		 333 aa  106  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  32.57 
 
 		 320 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  31.61 
 
 		 328 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  36.28 
 
 		 331 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  27.92 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  32.41 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1833  FecR protein  30.89 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  30.33 
 
 		 320 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  34.52 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  31.99 
 
 		 326 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  30.03 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6087  anti-FecI sigma factor, FecR  33.04 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.223277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25400  Anti-sigma factor, FecR family  36.31 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  34.29 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  34.68 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2374  anti-FecI sigma factor, FecR  29.53 
 
 		 351 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  30.63 
 
 		 315 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  35.47 
 
 		 327 aa  98.6  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  32.09 
 
 		 345 aa  98.6  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  33.68 
 
 		 336 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  28.62 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  31.63 
 
 		 329 aa  96.7  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  28.75 
 
 		 314 aa  96.7  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01110  Anti-sigma factor, FecR family  32.3 
 
 		 313 aa  96.3  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  29.49 
 
 		 321 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  32.91 
 
 		 374 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  27.61 
 
 		 301 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  32.48 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  37.37 
 
 		 444 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468182  normal  0.167582 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  29.47 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4193  anti-FecI sigma factor, FecR  27.74 
 
 		 329 aa  94  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2978  putative FecR  37.37 
 
 		 328 aa  93.6  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651501  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2623  anti-FecI sigma factor, FecR  33.44 
 
 		 329 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.539768  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  38.04 
 
 		 280 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  28.48 
 
 		 329 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0701  anti-FecI sigma factor, FecR  26.1 
 
 		 359 aa  92.4  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  33 
 
 		 328 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  33.23 
 
 		 345 aa  92.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02240  anti-sigma factor, FecR family  32.12 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  33.75 
 
 		 324 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3323  anti-FecI sigma factor, FecR  30.34 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  31.42 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1006  anti-FecI sigma factor, FecR  29.97 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  33.75 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1816  anti-FecI sigma factor, FecR  32.68 
 
 		 374 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  37.5 
 
 		 268 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37980  putative Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  33.64 
 
 		 317 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00265184  normal  0.0208679 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4378  putative FecR  27.55 
 
 		 321 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.620498  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  34.44 
 
 		 331 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  32.79 
 
 		 326 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2817  putative regulatory protein  23.21 
 
 		 373 aa  89.4  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00787345  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  29.21 
 
 		 330 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5659  anti-FecI sigma factor, FecR  24.59 
 
 		 329 aa  89.4  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  29.11 
 
 		 311 aa  89.4  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3327  anti-FecI sigma factor, FecR  29.01 
 
 		 327 aa  89.4  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4160  anti-FecI sigma factor, FecR  26.67 
 
 		 329 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4790  anti-FecI sigma factor, FecR  24.52 
 
 		 324 aa  89  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0252158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>