202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0055 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0055  VacJ-like lipoprotein  100 
 
 		 290 aa  600  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.743056  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2399  VacJ family lipoprotein  44.7 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106738 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3199  VacJ family lipoprotein  43.01 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  41.71 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  41.15 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0450  VacJ lipoprotein  33.11 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.48332e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0319  VacJ family lipoprotein  37.07 
 
 		 230 aa  138  8.999999999999999e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_0856  VacJ family lipoprotein  40.1 
 
 		 259 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.164494 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0559  VacJ family lipoprotein  35.27 
 
 		 284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00034836  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3002  VacJ family lipoprotein  37.13 
 
 		 253 aa  136  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1283  VacJ-like lipoprotein  34.98 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.148714  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  41.38 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0532  VacJ family lipoprotein  36.89 
 
 		 282 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  37.71 
 
 		 291 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0357  VacJ family lipoprotein  40.49 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.32783 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2301  surface lipoprotein-like  35.31 
 
 		 282 aa  132  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000223311  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  36.79 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  37.85 
 
 		 336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1574  VacJ family lipoprotein  40 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.729669 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2594  VacJ family lipoprotein  37.93 
 
 		 270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.123162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  38.53 
 
 		 325 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0405  VacJ family lipoprotein  34.06 
 
 		 242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008751  Dvul_1820  VacJ family lipoprotein  35.06 
 
 		 273 aa  129  6e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.571303 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  37 
 
 		 267 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  37 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  37.33 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  37.33 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  37.33 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  38.05 
 
 		 269 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  36.87 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
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NC_007650  BTH_II2351  lipoprotein VacJ  39.17 
 
 		 321 aa  126  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  37.76 
 
 		 283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
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NC_009715  CCV52592_0586  S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase MraW  34.08 
 
 		 233 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  40.3 
 
 		 234 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  37.04 
 
 		 321 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  40.3 
 
 		 234 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  35.89 
 
 		 241 aa  125  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  39.29 
 
 		 321 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  38.76 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  38.76 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
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NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  40.8 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  40.93 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  38.76 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  38.76 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  40.93 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  40.93 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
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NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  39.6 
 
 		 338 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  37.38 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  36.04 
 
 		 249 aa  123  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  39.39 
 
 		 315 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  40.09 
 
 		 258 aa  122  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  36.48 
 
 		 303 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  39.11 
 
 		 340 aa  122  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2202  ABC transporter ATPase  38.89 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2280  VacJ family lipoprotein  37.02 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.920871  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_1332  VacJ family lipoprotein  37.5 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154136  normal  1 
 
 
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NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  36.53 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3098  putative lipoprotein  35.41 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.633351  normal  0.297241 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1970  VacJ family lipoprotein  38.34 
 
 		 260 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  0.0740313 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  38.14 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  38.14 
 
 		 347 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  38.14 
 
 		 347 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  38.14 
 
 		 347 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  35.92 
 
 		 336 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  39.58 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  48.59 
 
 		 295 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  36.36 
 
 		 229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2035  VacJ family lipoprotein  37.44 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74121  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  37.63 
 
 		 334 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  36.11 
 
 		 233 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  37.63 
 
 		 334 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  35.78 
 
 		 284 aa  119  7e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  38.14 
 
 		 336 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  38.14 
 
 		 336 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0977  VacJ-like lipoprotein  33.19 
 
 		 255 aa  119  9e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  38.14 
 
 		 311 aa  118  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  37.75 
 
 		 234 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  38.14 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  38.38 
 
 		 245 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2690  hypothetical protein  39.06 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  36.59 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  35.71 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  36.77 
 
 		 347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  36.23 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
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NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  37.14 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.265642 
 
 
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NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  37.63 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  37.63 
 
 		 336 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
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NC_003296  RS01688  lipoprotein  33.18 
 
 		 296 aa  115  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  37.63 
 
 		 319 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  37.63 
 
 		 319 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  37.63 
 
 		 319 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
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NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  36.11 
 
 		 249 aa  115  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_1154  VacJ family lipoprotein  35.1 
 
 		 273 aa  115  8.999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  36.28 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250163 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  48.12 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  35.81 
 
 		 235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal  1 
 
 
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NC_007498  Pcar_1775  surface lipoprotein  37.91 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0149793  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_1005  VacJ family lipoprotein  33.33 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18106  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_3015  VacJ family lipoprotein  33.17 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00574462  normal  1 
 
 
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NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  38.12 
 
 		 263 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
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