247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3183 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  828    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  80.67 
 
 		 419 aa  625  1e-178  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1880  conserved repeat domain protein  33.64 
 
 		 652 aa  178  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  36.9 
 
 		 391 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2039  protein of unknown function DUF58  32.2 
 
 		 528 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0034  conserved repeat domain protein  28.3 
 
 		 451 aa  139  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.559435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  30.02 
 
 		 448 aa  139  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1173  conserved repeat domain protein  31.03 
 
 		 469 aa  138  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2415  conserved repeat domain protein  31.58 
 
 		 638 aa  137  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.470241  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0108  conserved repeat domain protein  32.1 
 
 		 641 aa  134  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1093  conserved repeat domain protein  30.7 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.396809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2108  protein of unknown function DUF58  29.57 
 
 		 436 aa  122  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0520788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2419  protein of unknown function DUF58  30.87 
 
 		 638 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2955  conserved repeat domain protein  30.27 
 
 		 546 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0418  conserved repeat domain protein  30.95 
 
 		 684 aa  117  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239514  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3550  conserved repeat domain protein  27.53 
 
 		 530 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1944  protein of unknown function DUF58  27.93 
 
 		 445 aa  107  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0400  protein of unknown function DUF58  27.62 
 
 		 505 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  26.71 
 
 		 410 aa  102  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3946  conserved repeat domain protein  27.91 
 
 		 828 aa  95.9  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884871  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  28.43 
 
 		 444 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  24.9 
 
 		 443 aa  88.2  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1691  protein of unknown function DUF58  30.18 
 
 		 487 aa  84.7  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.425885  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  28.62 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  24.42 
 
 		 446 aa  83.6  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0254  hypothetical protein  26.95 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  24.91 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3075  protein of unknown function DUF58  32.64 
 
 		 520 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107582 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  23.28 
 
 		 428 aa  80.1  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  26.41 
 
 		 444 aa  78.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  25 
 
 		 436 aa  76.6  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  25.68 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  27.41 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  27.4 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  30.54 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  27.84 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  28.69 
 
 		 443 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  26.74 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  29.52 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  31.6 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  24.9 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  23.72 
 
 		 448 aa  71.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  24.36 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  24.52 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  28.09 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  25.94 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  31.84 
 
 		 296 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  26.83 
 
 		 442 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0911  hypothetical protein  28.34 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  27.49 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  23.86 
 
 		 404 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  29.68 
 
 		 412 aa  67  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  27.24 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  25.78 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  36 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  25.56 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  24.81 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  23.86 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  23.86 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0475  hypothetical protein  25.86 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.916788  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  24.24 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  23.86 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  23.86 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0181  hypothetical protein  28.09 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0686  protein of unknown function DUF58  28.85 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  29.76 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  24.32 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  23.5 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  33.15 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  29.09 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1118  protein of unknown function DUF58  24.35 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0586  hypothetical protein  29.86 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370904 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  27.65 
 
 		 430 aa  63.2  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  25.41 
 
 		 444 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  26.23 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  27.63 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  31.97 
 
 		 449 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  31.97 
 
 		 449 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  28.46 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3922  hypothetical protein  28.07 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  22.22 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  31.97 
 
 		 449 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0155  hypothetical protein  28.09 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0164  hypothetical protein  28.09 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.136882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1282  protein of unknown function DUF58  28.09 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0117849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  24.75 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0145  hypothetical protein  27.66 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13184  hypothetical protein  26.64 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  25.91 
 
 		 436 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  32.31 
 
 		 575 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  26.34 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  24.91 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  30.24 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  24.89 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  27.91 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  28.57 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  28.57 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  30.73 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  31.45 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>