168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1206 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1206  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  424  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3267  transcriptional regulator, MarR family  59.9 
 
 		 207 aa  237  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4421  transcriptional regulator, MarR family  38.07 
 
 		 197 aa  111  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.636596  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 		 208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2109  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 145 aa  95.1  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4139  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1858  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.642234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0003  MarR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3929  transcriptional regulator, MarR family  27.81 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000837661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3063  MarR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565179  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0658  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 191 aa  72  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0504  transcriptional regulator, TrmB  34.27 
 
 		 176 aa  64.7  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.21026 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0210  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.133838 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2985  MarR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0529502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0070  MarR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0088  MarR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  27.35 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2911  transcriptional regulator, MarR family  24.55 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.233066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0070  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0228  MarR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0061  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0069  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1088  MarR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3251  MarR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2690  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 157 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 154 aa  49.3  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1696  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 163 aa  49.3  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4492  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.57372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  41.43 
 
 		 154 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1921  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 140 aa  48.5  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  26.89 
 
 		 141 aa  48.1  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 177 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 148 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 148 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 160 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  28.99 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 148 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 174 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  26.17 
 
 		 148 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 148 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  26.17 
 
 		 148 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  26.17 
 
 		 148 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  26.17 
 
 		 148 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 157 aa  46.6  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0803  transcriptional regulator, MarR family  39.24 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  25.95 
 
 		 177 aa  45.8  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0844  regulatory protein MarR  39.24 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0324688  normal  0.429878 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 160 aa  45.4  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 165 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 165 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 165 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 165 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 165 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0768  transcriptional regulator, MarR family  39.24 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.012772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 174 aa  45.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 142 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  32.79 
 
 		 161 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 159 aa  45.4  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 176 aa  45.4  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 141 aa  45.1  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 160 aa  45.1  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 166 aa  45.1  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0324  transcriptional regulator, MarR family  35.62 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 160 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 163 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0154  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 324 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372672  normal  0.054252 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3747  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 181 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0512718  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 165 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 158 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  27.53 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 165 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 164 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  32.31 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 156 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 160 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 160 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 156 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 160 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0629  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 160 aa  43.5  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0229428  normal  0.101426 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4560  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000343036 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 160 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 160 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 147 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>