More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1859 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1859  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 259 aa  525  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200968 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  93.75 
 
 		 257 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  89.15 
 
 		 266 aa  464  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  89.84 
 
 		 262 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  86.21 
 
 		 266 aa  457  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1794  ABC transporter related  69.41 
 
 		 269 aa  364  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2931  ABC transporter-related protein  72.33 
 
 		 264 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2575  ABC transporter related  69.05 
 
 		 258 aa  360  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1840  ABC transporter related  68.25 
 
 		 266 aa  357  9.999999999999999e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2022  ABC transporter related  67.97 
 
 		 260 aa  355  5.999999999999999e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0830509  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1682  ABC transporter related  67.97 
 
 		 260 aa  355  5.999999999999999e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2927  ABC transporter related  68.25 
 
 		 258 aa  354  7.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0722568  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2388  ABC transporter related  66.14 
 
 		 259 aa  351  5.9999999999999994e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0199374  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  68.67 
 
 		 249 aa  346  3e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1773  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  68.16 
 
 		 257 aa  346  3e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.547469  normal  0.0486237 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  67.87 
 
 		 249 aa  345  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1852  ABC transporter-related protein  67.35 
 
 		 253 aa  343  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3311  ABC transporter related  70.87 
 
 		 275 aa  342  2.9999999999999997e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00410965  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  65.86 
 
 		 249 aa  340  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  66.26 
 
 		 250 aa  328  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  64.66 
 
 		 253 aa  327  8e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  63.82 
 
 		 249 aa  323  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  58.13 
 
 		 250 aa  289  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  56.79 
 
 		 250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.69 
 
 		 250 aa  280  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2815  ABC transporter related  56.79 
 
 		 250 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.28 
 
 		 250 aa  278  7e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  56.28 
 
 		 256 aa  275  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1394  ABC transporter related  52.44 
 
 		 250 aa  254  7e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.665987 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1826  ABC-transporter  51.01 
 
 		 758 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.256194  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1650  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  51.01 
 
 		 752 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0934  ABC transporter related  52.44 
 
 		 250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00957205  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1416  ABC transporter related  52.44 
 
 		 250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1672  ABC-transporter  51.01 
 
 		 746 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0908  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  50.61 
 
 		 761 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0721  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  50.61 
 
 		 746 aa  252  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1899  ABC transporter related  50.81 
 
 		 250 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.200717 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0441  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein  50.61 
 
 		 749 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721247  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1439  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  50.61 
 
 		 755 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2652  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  50.81 
 
 		 741 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4560  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.22 
 
 		 250 aa  248  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0886359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1296  ABC transporter related  50 
 
 		 249 aa  245  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1335  ABC transporter related  50 
 
 		 249 aa  244  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0569483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  46.15 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  42.34 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  42.34 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  42.74 
 
 		 256 aa  210  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  44.53 
 
 		 263 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  42.02 
 
 		 258 aa  209  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  42 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  41.6 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3487  ABC transporter related  43.02 
 
 		 256 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  41.46 
 
 		 252 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1514  ABC transporter related  41.7 
 
 		 251 aa  205  7e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.168064  normal  0.658577 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  43.09 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  45.75 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2314  ABC transporter related  41.53 
 
 		 249 aa  202  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  46.74 
 
 		 264 aa  202  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  41.47 
 
 		 256 aa  202  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  41.47 
 
 		 256 aa  201  7e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  39.67 
 
 		 840 aa  201  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  42.91 
 
 		 252 aa  201  7e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2305  ABC transporter related protein  41.08 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  41.18 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.13 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  42.23 
 
 		 254 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  41.86 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  40.7 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  43.5 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  42.63 
 
 		 256 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  41.39 
 
 		 852 aa  199  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  42.63 
 
 		 256 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  41.5 
 
 		 258 aa  198  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  43.5 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0546  ABC transporter related  44.03 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.747453 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6436  ABC transporter related  39.92 
 
 		 261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  41.41 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  41.83 
 
 		 257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  42.63 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  41.11 
 
 		 258 aa  195  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  43.59 
 
 		 250 aa  195  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  39.59 
 
 		 249 aa  194  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  42.04 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  43.15 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  41.9 
 
 		 277 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  41.08 
 
 		 256 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  40.91 
 
 		 263 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1384  ABC transporter related  39.18 
 
 		 252 aa  192  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0904717 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  41.11 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  41.2 
 
 		 251 aa  192  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  42.52 
 
 		 278 aa  191  7e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5956  ABC transporter related  40.31 
 
 		 256 aa  191  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00448247  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2329  ABC transporter related  40.66 
 
 		 251 aa  191  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  41.3 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3331  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.15 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  42.32 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  41.6 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  42.13 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1822  ABC transporter related  43.85 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  41.32 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>