206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6400 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6400  protein of unknown function UPF0066  100 
 
 		 174 aa  357  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  80.49 
 
 		 163 aa  268  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2452  hypothetical protein  67.68 
 
 		 163 aa  234  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  65.1 
 
 		 173 aa  205  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  61.21 
 
 		 162 aa  202  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2481  hypothetical protein  60.84 
 
 		 182 aa  201  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  68.31 
 
 		 153 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1984  hypothetical protein  59.76 
 
 		 164 aa  193  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  62.67 
 
 		 153 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2403  hypothetical protein  60 
 
 		 153 aa  185  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0181895  normal  0.750924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  60.27 
 
 		 153 aa  184  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0867  hypothetical protein  59.29 
 
 		 153 aa  165  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4390  hypothetical protein  58.16 
 
 		 176 aa  164  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  57.86 
 
 		 145 aa  159  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  51.39 
 
 		 167 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  50.69 
 
 		 168 aa  141  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  50.69 
 
 		 178 aa  141  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  51.77 
 
 		 165 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  49.31 
 
 		 162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  48.61 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  53.39 
 
 		 151 aa  119  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  45.26 
 
 		 145 aa  117  7e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  48.31 
 
 		 143 aa  108  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  48.31 
 
 		 143 aa  108  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2198  hypothetical protein  45.8 
 
 		 163 aa  104  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  43.22 
 
 		 151 aa  99  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  42.62 
 
 		 145 aa  97.4  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  46.03 
 
 		 183 aa  96.3  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  40.16 
 
 		 181 aa  91.3  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  36.09 
 
 		 138 aa  91.3  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  42.02 
 
 		 311 aa  90.9  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  38.14 
 
 		 150 aa  88.2  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  41.18 
 
 		 167 aa  87.8  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  42.86 
 
 		 131 aa  85.5  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  42.62 
 
 		 162 aa  85.5  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  34.17 
 
 		 144 aa  85.5  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  38.58 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  40.65 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  40 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  40 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  39.46 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  37.82 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  36.13 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  37.9 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  36.13 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  35.83 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  37.9 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  36.13 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  36.36 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0993  hypothetical protein  36.36 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  38.71 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  35.07 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  39.17 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  38.93 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  36.13 
 
 		 294 aa  74.3  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  36.67 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  35.42 
 
 		 175 aa  73.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  38 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  38.58 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1048  protein of unknown function UPF0066  36.36 
 
 		 140 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177831  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  37.1 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2822  heat shock protein DnaJ-like  37.98 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000736424 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1254  hypothetical protein  45 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  36.3 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  32.26 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  37.8 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  37.4 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1052  protein of unknown function UPF0066  35.54 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  35.43 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2751  hypothetical protein  38.4 
 
 		 262 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  37.19 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  36 
 
 		 272 aa  70.9  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1965  class II aldolase/adducin family protein  35.37 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  34.65 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  37.69 
 
 		 142 aa  70.5  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  34.06 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  37.5 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  41.18 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  37.29 
 
 		 162 aa  67.4  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  43.62 
 
 		 182 aa  67  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  37.5 
 
 		 231 aa  67  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1839  protein of unknown function UPF0066  37.76 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000981628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  36.51 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  36.64 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  36.64 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1630  hypothetical protein  32.71 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00729863  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2516  hypothetical protein  34.85 
 
 		 244 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.507921  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  35.77 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  34.88 
 
 		 246 aa  64.7  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  34.88 
 
 		 246 aa  64.7  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  34.88 
 
 		 246 aa  64.7  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  34.88 
 
 		 246 aa  64.7  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  34.88 
 
 		 235 aa  64.7  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1505  protein of unknown function UPF0066  34.09 
 
 		 244 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.410529  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2854  hypothetical protein  34.09 
 
 		 244 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.762122  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2871  hypothetical protein  34.09 
 
 		 244 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.867889  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3000  hypothetical protein  34.09 
 
 		 244 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  34.4 
 
 		 240 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  31.01 
 
 		 251 aa  64.3  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  34.13 
 
 		 235 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>