281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6252 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6252  inner-membrane translocator  100 
 
 		 339 aa  657    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.7968 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2123  inner-membrane translocator  41.14 
 
 		 352 aa  149  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  29.27 
 
 		 360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  31.75 
 
 		 391 aa  140  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0917  inner-membrane translocator  29.9 
 
 		 351 aa  139  8.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  31.51 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  29.5 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  31.51 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  30.86 
 
 		 357 aa  134  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  33.63 
 
 		 365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2115  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 353 aa  127  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  32.33 
 
 		 357 aa  126  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  29.91 
 
 		 373 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  30.58 
 
 		 338 aa  123  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  29.71 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  32.52 
 
 		 365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  28.48 
 
 		 365 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  30.67 
 
 		 343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  30.75 
 
 		 365 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  29.91 
 
 		 362 aa  119  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  32.35 
 
 		 371 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  31.4 
 
 		 365 aa  116  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  29.63 
 
 		 371 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  27.33 
 
 		 344 aa  113  5e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  30.79 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0008  ABC transporter, permease protein, putative  30 
 
 		 359 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451732  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  28.27 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4443  inner-membrane translocator  30.34 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  28.97 
 
 		 344 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  28.97 
 
 		 344 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  29.14 
 
 		 364 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  28.52 
 
 		 388 aa  106  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  30.84 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  26.55 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  29.07 
 
 		 364 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  28.24 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1499  membrane protein  29.25 
 
 		 345 aa  103  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.700858  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  26.84 
 
 		 365 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  29.38 
 
 		 356 aa  102  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  29.39 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.1 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  27.83 
 
 		 442 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5418  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  27.11 
 
 		 348 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748326  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  29.94 
 
 		 340 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  27.79 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  28.21 
 
 		 348 aa  97.1  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  30.69 
 
 		 471 aa  94.7  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  29.12 
 
 		 368 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  30.21 
 
 		 365 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  28.99 
 
 		 368 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  28.7 
 
 		 338 aa  93.6  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3150  inner-membrane translocator  30.41 
 
 		 361 aa  92.8  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.35673 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  26.69 
 
 		 359 aa  92.8  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  26.2 
 
 		 349 aa  92.8  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  28.2 
 
 		 350 aa  92.8  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  28.1 
 
 		 352 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 370 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  28.1 
 
 		 352 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  30.5 
 
 		 426 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1592  inner-membrane translocator  26.33 
 
 		 334 aa  92.4  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0005  putative ABC transporter, permease protein  27.1 
 
 		 336 aa  92  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.226328  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  27.85 
 
 		 347 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  28.81 
 
 		 347 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2284  inner-membrane translocator  28.44 
 
 		 364 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332581  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4193  inner-membrane translocator  29.48 
 
 		 375 aa  90.5  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  26.95 
 
 		 366 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  26.95 
 
 		 366 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2078  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 350 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0200136 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  26.91 
 
 		 358 aa  89.7  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  27.18 
 
 		 349 aa  89.7  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  27.85 
 
 		 347 aa  89.7  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  27.87 
 
 		 349 aa  89.4  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  30.49 
 
 		 363 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  23.46 
 
 		 400 aa  89  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1646  inner-membrane translocator  29.15 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.12829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4621  putative ABC transporter (permease protein)  30.15 
 
 		 369 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  26.61 
 
 		 352 aa  87.8  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0474  inner-membrane translocator  26.58 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000000132511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  27.46 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  26.83 
 
 		 373 aa  87  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0271  inner-membrane translocator  31.63 
 
 		 353 aa  86.7  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0872978  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  29.1 
 
 		 350 aa  86.7  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  25.83 
 
 		 403 aa  86.7  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  28.7 
 
 		 347 aa  86.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  26.65 
 
 		 364 aa  86.7  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  27.84 
 
 		 371 aa  86.3  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1245  inner-membrane translocator  29.64 
 
 		 350 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.138626 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  27.54 
 
 		 363 aa  85.9  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2209  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  28.61 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  29.84 
 
 		 363 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  28.4 
 
 		 352 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  26.79 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5657  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  29.94 
 
 		 392 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.348277  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  24.85 
 
 		 364 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0766  inner-membrane translocator  23.62 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.286695  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1530  inner-membrane translocator  28.18 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  27.07 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0884  inner-membrane translocator  28.32 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758855  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3653  inner-membrane translocator  28.66 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.483101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>