More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2539 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  100 
 
 		 578 aa  1148    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  91.72 
 
 		 588 aa  980    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  62.65 
 
 		 528 aa  597  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2014  protease Do  60.31 
 
 		 502 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  57.33 
 
 		 524 aa  569  1e-161  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  57.52 
 
 		 524 aa  571  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  55.42 
 
 		 520 aa  560  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  57.17 
 
 		 471 aa  535  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  49.18 
 
 		 500 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  50.49 
 
 		 522 aa  483  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  51.46 
 
 		 511 aa  480  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  52.8 
 
 		 498 aa  480  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  51.08 
 
 		 523 aa  480  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  49.81 
 
 		 501 aa  475  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0922  protease Do family protein  49.8 
 
 		 496 aa  473  1e-132  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.726985  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  51.27 
 
 		 516 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  50.88 
 
 		 511 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  50.68 
 
 		 511 aa  465  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  50.99 
 
 		 496 aa  463  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  50.5 
 
 		 497 aa  462  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  50.69 
 
 		 498 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  52.47 
 
 		 501 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  50.1 
 
 		 497 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  51.38 
 
 		 499 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  51.08 
 
 		 498 aa  445  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  48.73 
 
 		 487 aa  437  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  49.1 
 
 		 508 aa  428  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  47.7 
 
 		 501 aa  423  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  46.88 
 
 		 506 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  46.88 
 
 		 493 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  47.66 
 
 		 515 aa  410  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  45.23 
 
 		 514 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  46.26 
 
 		 493 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  45.4 
 
 		 499 aa  392  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  54.94 
 
 		 535 aa  364  2e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  39.93 
 
 		 491 aa  357  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  41.75 
 
 		 459 aa  355  1e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  39.56 
 
 		 524 aa  351  3e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  38.93 
 
 		 518 aa  342  7e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  43.38 
 
 		 476 aa  342  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  39.47 
 
 		 529 aa  339  9e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  41.86 
 
 		 513 aa  338  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  41.86 
 
 		 513 aa  338  1.9999999999999998e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  40.15 
 
 		 502 aa  334  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  37.96 
 
 		 497 aa  331  2e-89  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  40.04 
 
 		 464 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  38.43 
 
 		 500 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  43.36 
 
 		 496 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  38.34 
 
 		 528 aa  326  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  42.03 
 
 		 523 aa  326  9e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  36.18 
 
 		 517 aa  325  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  40.12 
 
 		 489 aa  325  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  39.39 
 
 		 508 aa  325  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  37.69 
 
 		 527 aa  323  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  49.27 
 
 		 457 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  40.09 
 
 		 509 aa  322  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  42.89 
 
 		 496 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  39.24 
 
 		 504 aa  321  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  38.48 
 
 		 501 aa  319  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  41.4 
 
 		 473 aa  318  2e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  40.73 
 
 		 466 aa  318  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  38.35 
 
 		 506 aa  318  2e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  43.05 
 
 		 464 aa  316  7e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  40.77 
 
 		 503 aa  316  8e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  38.68 
 
 		 501 aa  316  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  40.77 
 
 		 503 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  39.08 
 
 		 483 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  39.29 
 
 		 483 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  38.23 
 
 		 520 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  36.43 
 
 		 526 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  37.46 
 
 		 523 aa  313  6.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  42.23 
 
 		 496 aa  313  7.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  39.48 
 
 		 485 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  39.33 
 
 		 527 aa  310  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  39.39 
 
 		 474 aa  309  9e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  39.76 
 
 		 482 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  38.51 
 
 		 528 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  38.46 
 
 		 476 aa  307  3e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  39.04 
 
 		 516 aa  307  3e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  38.36 
 
 		 527 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  41.69 
 
 		 458 aa  306  7e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  46.02 
 
 		 483 aa  306  7e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  38.96 
 
 		 474 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  38.37 
 
 		 475 aa  305  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  40.51 
 
 		 479 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  48.21 
 
 		 520 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  38.81 
 
 		 481 aa  303  6.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  38.21 
 
 		 475 aa  302  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  39.39 
 
 		 474 aa  301  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  38.38 
 
 		 501 aa  300  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  38.82 
 
 		 472 aa  300  4e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  38.68 
 
 		 481 aa  300  4e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  38.18 
 
 		 473 aa  300  6e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  36.33 
 
 		 485 aa  298  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  41.07 
 
 		 491 aa  296  6e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  39.96 
 
 		 479 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  39.14 
 
 		 477 aa  296  9e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  39.53 
 
 		 481 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  38.17 
 
 		 477 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  49.35 
 
 		 505 aa  295  1e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>