More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4936 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  76.24 
 
 		 209 aa  305  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0816  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 221 aa  125  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3570  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649978  decreased coverage  0.00133713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0444  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5414  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5042  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 225 aa  95.5  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  0.617447 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0432  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 222 aa  95.5  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  hitchhiker  0.000000839635 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4696  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3666  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3855  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 213 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.898863  normal  0.650046 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2442  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 218 aa  92  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0102  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 216 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1073  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0405  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0121  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 216 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1263  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 216 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1540  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 221 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608661  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2819  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2672  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 224 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 224 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 224 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5407  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 211 aa  85.5  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.924589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0957  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0975  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0353361 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0978  TetR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4846  regulatory protein TetR  41.04 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3563  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1682  putative transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5084  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0436  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3378  regulatory protein TetR  29.59 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5109  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313188  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4594  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4630  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10840  hypothetical protein  45.59 
 
 		 213 aa  62  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.96162e-38  hitchhiker  0.00000829572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 248 aa  62  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0313  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4510  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576125  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22680  transcriptional regulator  35.04 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4893  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0909608  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  33.85 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4597  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.908107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1283  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4918  transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1669  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2901  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781877  normal  0.0527686 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4885  putative transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0329972  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4521  hypothetical protein  31.21 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  30.47 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4631  TetR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1526  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0367  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0377  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  24.63 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 310 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0356  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  21.74 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  36.14 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5172  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.369972  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 238 aa  52  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0607  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.174677  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  22.91 
 
 		 189 aa  51.6  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0203  regulatory protein TetR  41.54 
 
 		 186 aa  51.6  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.041689  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2337  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 199 aa  51.6  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 269 aa  51.6  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10279  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004651  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4611  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>