139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3305 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3533  glycosyl transferase, group 1 family protein PslF  89.54 
 
 		 392 aa  686    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0609585  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3305  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 392 aa  790    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0317499  normal  0.753589 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35680  hypothetical protein  63.64 
 
 		 395 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000110612 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4283  glycosyl transferase, group 1  67.27 
 
 		 396 aa  501  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3005  hypothetical protein  63.38 
 
 		 395 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.036404  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  22.82 
 
 		 759 aa  92.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 		 763 aa  89.7  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0360  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  23.1 
 
 		 759 aa  83.2  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 		 774 aa  82  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  20.92 
 
 		 797 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  22.93 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  26.08 
 
 		 765 aa  77.4  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  24.42 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  24.22 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  23.17 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  22.49 
 
 		 747 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5289  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  26.07 
 
 		 761 aa  73.2  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  22.88 
 
 		 780 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 		 789 aa  70.9  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1786  glycosyl transferase, group 1  22.08 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  25.43 
 
 		 767 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  23.13 
 
 		 823 aa  65.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3376  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000624508  hitchhiker  0.000924483 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0782  glycosyl transferase group 1  22.41 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  18.61 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3438  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1916  glycosyltransferase  23.23 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5216  glycosyl transferase, group 1  24.24 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.088872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1052  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0723  glycosyltransferase-like protein  30.41 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4512  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  21.75 
 
 		 790 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 		 774 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  25.29 
 
 		 412 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 433 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 		 374 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  19.33 
 
 		 756 aa  54.7  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7428  glycosyl transferase group 1  22.86 
 
 		 388 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 		 366 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 		 375 aa  53.9  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0790  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 		 393 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0804  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 		 393 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  normal  0.0900137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0785  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 		 393 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.967061 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2282  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 		 381 aa  53.5  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.823032  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  24.71 
 
 		 382 aa  52.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0566  glycosyl transferase, group 1  21.64 
 
 		 361 aa  52.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 		 410 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1032  glycosyl transferase group 1  24.02 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 		 375 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3591  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1432  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.96 
 
 		 427 aa  51.6  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.285066  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 		 415 aa  51.2  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 		 419 aa  51.6  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1176  glycosyl transferase, group 1  25.9 
 
 		 349 aa  51.2  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 396 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3120  glycosyl transferase, group 1  25.13 
 
 		 366 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017817  unclonable  0.0000176244 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 422 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  28.19 
 
 		 407 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 		 381 aa  48.9  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 		 392 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  25.07 
 
 		 375 aa  48.9  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  24.72 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 		 421 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3427  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000419175  normal  0.0303582 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2958  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 		 366 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.298871  hitchhiker  0.000213048 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 		 382 aa  48.9  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  26.38 
 
 		 654 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  23.22 
 
 		 429 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 		 359 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 		 367 aa  47.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  24.71 
 
 		 370 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 		 426 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0542  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 		 414 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 376 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3532  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 		 428 aa  47.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00173558  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  27.69 
 
 		 364 aa  47.4  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  26.44 
 
 		 431 aa  47.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  27.14 
 
 		 557 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 		 353 aa  47.4  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  27.8 
 
 		 598 aa  47  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 		 387 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 		 379 aa  47  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  23.36 
 
 		 348 aa  46.6  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 		 762 aa  46.6  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 		 404 aa  46.6  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1106  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 382 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5459  glycosyl transferase group 1  36.73 
 
 		 660 aa  46.6  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  26.12 
 
 		 383 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1744  glycosyl transferase, group 1  23.27 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0590  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.248802  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3384  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320283  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4956  glycosyl transferase group 1  22.18 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>