243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0822 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0799  outer membrane porin  99.55 
 
 		 444 aa  909    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0822  outer membrane porin  100 
 
 		 444 aa  912    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43059  normal  0.142629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4394  outer membrane porin  94.59 
 
 		 444 aa  849    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0833  outer membrane porin  98.87 
 
 		 444 aa  905    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4665  outer membrane porin  67.19 
 
 		 438 aa  565  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109112  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02020  putative outer membrane porin  61.38 
 
 		 444 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.485691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0242  porin  60.71 
 
 		 444 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2839  porin  43.55 
 
 		 467 aa  342  8e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3618  outer membrane porin  43.26 
 
 		 441 aa  333  4e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33410  porin  44.01 
 
 		 472 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0650483  normal  0.0333404 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2214  outer membrane porin  42.38 
 
 		 440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1171  outer membrane porin  43.2 
 
 		 446 aa  326  5e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00378662  normal  0.540471 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0060  outer membrane porin  40.83 
 
 		 447 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360119  hitchhiker  0.00983666 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0046  porin, putative  40.83 
 
 		 447 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0060  outer membrane porin  40.83 
 
 		 447 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0063  outer membrane porin  40.83 
 
 		 447 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166078 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3290  outer membrane porin, OprD family  40.72 
 
 		 441 aa  316  6e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2103  outer membrane porin  41.71 
 
 		 447 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2286  outer membrane porin  41.14 
 
 		 447 aa  309  8e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197845  normal  0.381133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3630  porin, putative  41.47 
 
 		 447 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.563573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4807  outer membrane porin  39.46 
 
 		 441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0369  outer membrane porin, OprD family  38.22 
 
 		 441 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2734  putative porin  40.9 
 
 		 455 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34191  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32270  putative porin  41.11 
 
 		 448 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2999  outer membrane porin  39.47 
 
 		 449 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489331  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2754  porin, putative  39.52 
 
 		 479 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4550  basic amino acid/basic peptide/imipenem outer membrane porin OprD  40.23 
 
 		 441 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1097  outer membrane porin  38.18 
 
 		 446 aa  276  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000158939  normal  0.0454814 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4419  outer membrane porin  40.05 
 
 		 448 aa  273  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51880  basic amino acid, basic peptide and imipenem outer membrane porin OprD precursor  40.51 
 
 		 443 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286241  normal  0.0103947 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40060  OprD family outer membrane porin  37.42 
 
 		 454 aa  266  7e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29220  putative porin  37.02 
 
 		 435 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.655739 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3977  putative porin  37.02 
 
 		 435 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3987  porin D  38.19 
 
 		 448 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286909  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1400  outer membrane porin  38.86 
 
 		 447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2708  outer membrane porin  35.94 
 
 		 431 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2054  outer membrane porin  35.47 
 
 		 445 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43830  OprD family outer membrane porin  36.58 
 
 		 444 aa  249  8e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1925  outer membrane porin  34.77 
 
 		 445 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  35.89 
 
 		 427 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4009  outer membrane porin  37.36 
 
 		 422 aa  246  8e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0224  outer membrane porin  35.78 
 
 		 420 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.79572 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1206  outer membrane porin  36.67 
 
 		 421 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1235  outer membrane porin  36.81 
 
 		 421 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188174  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0268  putative porin  37.47 
 
 		 452 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7753  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40000  OprD family outer membrane porin  34.66 
 
 		 452 aa  237  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0644019  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02370  putative porin  36.78 
 
 		 452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000471352  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5250  porin, putative  36.23 
 
 		 420 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  34.82 
 
 		 421 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5160  outer membrane porin  36.23 
 
 		 420 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  34.6 
 
 		 421 aa  232  9e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1367  outer membrane porin  33.96 
 
 		 468 aa  229  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  34.52 
 
 		 427 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  34.31 
 
 		 411 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  33.94 
 
 		 417 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  34.17 
 
 		 417 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  34.28 
 
 		 427 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  32.58 
 
 		 412 aa  223  7e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4940  outer membrane porin  35.46 
 
 		 439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.849665  hitchhiker  0.000000184372 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  35.01 
 
 		 415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  33.49 
 
 		 413 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  34.67 
 
 		 429 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  35.83 
 
 		 409 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2190  outer membrane porin  32.89 
 
 		 417 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0522869  hitchhiker  0.0043507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  34.82 
 
 		 416 aa  217  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  33.1 
 
 		 417 aa  217  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3212  outer membrane porin  34.91 
 
 		 414 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  33.89 
 
 		 418 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  34.58 
 
 		 421 aa  216  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  35.04 
 
 		 416 aa  216  9e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0295  outer membrane porin  34.59 
 
 		 428 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.258921  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  32.21 
 
 		 416 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  32.87 
 
 		 417 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0268  outer membrane porin  34.58 
 
 		 439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0284  outer membrane porin  34.58 
 
 		 439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  33.89 
 
 		 418 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  34.51 
 
 		 422 aa  213  7e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  35.13 
 
 		 409 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  33.04 
 
 		 426 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28400  outer membrane OprD family porin  33.63 
 
 		 425 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00818285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0294  outer membrane porin  34.36 
 
 		 439 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5115  putative porin  33.33 
 
 		 478 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2476  outer membrane protein  33.41 
 
 		 425 aa  209  9e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  34.69 
 
 		 429 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1260  outer membrane porin  32.97 
 
 		 425 aa  209  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000749415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38140  outer membrane porin, OprD family  30.94 
 
 		 420 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35855  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58410  putative porin  32.91 
 
 		 484 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  34.45 
 
 		 429 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  33.33 
 
 		 416 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  34.45 
 
 		 429 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  33.81 
 
 		 416 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  33.81 
 
 		 416 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2730  outer membrane porin  31.38 
 
 		 440 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  31.47 
 
 		 440 aa  203  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  33.57 
 
 		 416 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  32.31 
 
 		 423 aa  202  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2563  outer membrane porin  31.78 
 
 		 427 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0910723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  33.73 
 
 		 421 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2946  outer membrane porin, OprD family  31.02 
 
 		 440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153867  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1339  outer membrane porin  31.52 
 
 		 422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.868317  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>