113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1590 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  100 
 
 		 253 aa  529  1e-149  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  80.48 
 
 		 252 aa  410  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  74.9 
 
 		 256 aa  391  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  59.76 
 
 		 257 aa  299  3e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  59.84 
 
 		 254 aa  291  6e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  59.84 
 
 		 252 aa  286  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  57.43 
 
 		 255 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  55.33 
 
 		 255 aa  280  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  57.44 
 
 		 252 aa  280  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  54.13 
 
 		 249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  51.77 
 
 		 253 aa  232  5e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  49.36 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  46.09 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  50.22 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  44.4 
 
 		 246 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  48.51 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  43.44 
 
 		 236 aa  204  1e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  49.26 
 
 		 203 aa  200  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  44.44 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  47.56 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  41.9 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  37.23 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  36.36 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  37.16 
 
 		 382 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  35.98 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  37.5 
 
 		 244 aa  123  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  34.09 
 
 		 242 aa  122  6e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  42.2 
 
 		 242 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  33.97 
 
 		 225 aa  117  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  32.02 
 
 		 207 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  30.58 
 
 		 202 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  33.84 
 
 		 274 aa  107  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  33.85 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  34 
 
 		 235 aa  103  4e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  33.17 
 
 		 234 aa  102  9e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  30.2 
 
 		 356 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  31.67 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  30.6 
 
 		 371 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.29 
 
 		 207 aa  99  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  32.83 
 
 		 237 aa  97.8  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  31.79 
 
 		 189 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  31.52 
 
 		 214 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  30.56 
 
 		 205 aa  93.2  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  30.19 
 
 		 375 aa  86.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  32.47 
 
 		 391 aa  85.9  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  30.69 
 
 		 508 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  30.69 
 
 		 508 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  28.02 
 
 		 474 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  32.65 
 
 		 510 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  29.26 
 
 		 510 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  30.18 
 
 		 475 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0997  SagB-type dehydrogenase domain protein  28.57 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  25.76 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  27.27 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  28.72 
 
 		 509 aa  72.8  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  29.33 
 
 		 491 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  28.82 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  31.33 
 
 		 523 aa  69.3  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  29.21 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5913  hypothetical protein  26.34 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0250235  normal  0.770563 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  28.88 
 
 		 503 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  27.39 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2273  nitroreductase  27.37 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0878  hypothetical protein  27.1 
 
 		 471 aa  65.9  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.263268  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6188  hypothetical protein  26.54 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876994  normal  0.335719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  27.57 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  28.87 
 
 		 473 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  27.08 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4677  nitroreductase  30.39 
 
 		 492 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  28.57 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1109  hypothetical protein  28.22 
 
 		 249 aa  62  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  27.37 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  29.21 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  29.25 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  27.01 
 
 		 656 aa  60.1  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  27.87 
 
 		 518 aa  58.9  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0818  nitroreductase  28.93 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133971  hitchhiker  0.000000468643 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  29.07 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  28.57 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  31.62 
 
 		 529 aa  57.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0637  SagB-type dehydrogenase domain protein  28.24 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2709  nitroreductase  25.74 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3866  hypothetical protein  26.64 
 
 		 518 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000713597  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5819  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  30.26 
 
 		 232 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0914692 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  29.41 
 
 		 530 aa  56.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  26.49 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  25.82 
 
 		 547 aa  56.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0382  hypothetical protein  26.09 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  30.26 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4414  hypothetical protein  27.37 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.790049 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4547  nitroreductase  27.37 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00573594 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1228  hypothetical protein  29.68 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  27.42 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0146  hypothetical protein  25.28 
 
 		 556 aa  53.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5837  hypothetical protein  23.24 
 
 		 502 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4422  hypothetical protein  30.15 
 
 		 532 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0248  nitroreductase  27.42 
 
 		 193 aa  52.8  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.167027  normal  0.791658 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5587  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  30.4 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3308  hypothetical protein  28.65 
 
 		 602 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0405208 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  27.27 
 
 		 538 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>