More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0479 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0479  inner-membrane translocator  100 
 
 		 294 aa  567  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1683  inner-membrane translocator  79.59 
 
 		 294 aa  462  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00416283  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2180  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  62.09 
 
 		 277 aa  321  7e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1698  inner-membrane translocator  62.37 
 
 		 292 aa  316  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0299512  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1769  inner-membrane translocator  62.37 
 
 		 292 aa  316  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125196  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1797  inner-membrane translocator  48.25 
 
 		 290 aa  242  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.160989 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3707  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  47.92 
 
 		 291 aa  241  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0914  inner-membrane translocator  47.57 
 
 		 291 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1163  inner-membrane translocator  47.9 
 
 		 290 aa  239  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0356  inner-membrane translocator  47.06 
 
 		 292 aa  235  8e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0298  inner-membrane translocator  46.53 
 
 		 290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.474045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1837  inner-membrane translocator  44.67 
 
 		 296 aa  226  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000968352  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4054  inner-membrane translocator  44.93 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3520  inner-membrane translocator  45.83 
 
 		 291 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0611  inner-membrane translocator  45.1 
 
 		 304 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  36.77 
 
 		 290 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3768  inner-membrane translocator  36.71 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.179629 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3499  inner-membrane translocator  35.49 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2082  inner-membrane translocator  34.17 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3836  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 289 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3367  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2164  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4940  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 291 aa  135  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3304  inner-membrane translocator  32.29 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  32.64 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1258  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 291 aa  132  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241594  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  32.19 
 
 		 295 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  34.49 
 
 		 290 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4061  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  34.13 
 
 		 292 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  30.56 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2739  inner-membrane translocator  32.18 
 
 		 290 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4852  inner-membrane translocator  33.09 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  30.96 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  31.67 
 
 		 287 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2753  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.56 
 
 		 290 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110353  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5339  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 289 aa  122  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13292  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4820  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 290 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0225289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  31.82 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  31.21 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0290  inner-membrane translocator  32.57 
 
 		 306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  31.97 
 
 		 290 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2500  inner-membrane translocator  30.63 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1833  inner-membrane translocator  29.24 
 
 		 297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2177  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids NatD  31.74 
 
 		 296 aa  115  6e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.801545 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  32.54 
 
 		 293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0945  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  29.35 
 
 		 294 aa  115  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3500  inner-membrane translocator  32.85 
 
 		 291 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_816  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.35 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.648564  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  34.14 
 
 		 294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2609  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  32.05 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  32.05 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7078  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livH  30.66 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0834  inner-membrane translocator  31.99 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000998369  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1967  inner-membrane translocator  33.09 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.207347  normal  0.0517862 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4095  inner-membrane translocator  35.43 
 
 		 294 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1003  inner-membrane translocator  29.29 
 
 		 290 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  30.82 
 
 		 292 aa  114  3e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000402  High-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein LivH  29.51 
 
 		 297 aa  113  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.721803  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2039  inner-membrane translocator  30.85 
 
 		 294 aa  112  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000380808 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  29.45 
 
 		 293 aa  112  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  31.51 
 
 		 308 aa  112  7.000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3508  inner-membrane translocator  29.33 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0829  inner-membrane translocator  28.67 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5975  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0998  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.31 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301783  normal  0.758902 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3135  inner-membrane translocator  28.24 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  31.85 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3415  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.24 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  31.8 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4242  inner-membrane translocator  29.58 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1596  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1672  inner-membrane translocator  31.47 
 
 		 299 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0528  inner-membrane translocator  29.43 
 
 		 292 aa  109  5e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00118598  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0478  inner-membrane translocator  30.66 
 
 		 290 aa  108  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164888  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3687  inner-membrane translocator  29.55 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2272  inner-membrane translocator  32.53 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.711778 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3841  inner-membrane translocator  29.05 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00122547  normal  0.924093 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1533  inner-membrane translocator  31.06 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575934  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  30.17 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3010  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000508141  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  27.74 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1781  ABC transporter permease  30.94 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0603975  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1438  inner-membrane translocator  30.72 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0550  inner-membrane translocator  29.76 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  31.38 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 290 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1680  inner-membrane translocator  31.52 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 289 aa  106  6e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3104  inner-membrane translocator  32.63 
 
 		 293 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1733  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.29 
 
 		 294 aa  105  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.293981  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0350  inner-membrane translocator  29.58 
 
 		 292 aa  105  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.018915  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.43 
 
 		 291 aa  105  7e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1943  inner-membrane translocator  31.83 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2425  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  30.38 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674149  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1651  inner-membrane translocator  29.02 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4070  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>