More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1715 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  51.14 
 
 		 650 aa  671    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0219  lytic transglycosylase, catalytic  56.14 
 
 		 653 aa  698    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1715  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 652 aa  1341    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.728382  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3339  Lytic transglycosylase catalytic  50.46 
 
 		 650 aa  660    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  53.74 
 
 		 655 aa  687    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3662  Lytic transglycosylase catalytic  50.31 
 
 		 650 aa  660    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.874549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  90.61 
 
 		 628 aa  1197    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  49.92 
 
 		 651 aa  586  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  49.44 
 
 		 651 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  49.44 
 
 		 651 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  49.44 
 
 		 651 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  49.44 
 
 		 651 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  49.44 
 
 		 651 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  49.44 
 
 		 651 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  49.44 
 
 		 651 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  49.19 
 
 		 650 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  48.87 
 
 		 650 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  47.93 
 
 		 655 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3738  Lytic transglycosylase catalytic  47.93 
 
 		 655 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0927783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2900  lytic transglycosylase catalytic  47.77 
 
 		 657 aa  569  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  48.87 
 
 		 650 aa  571  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  48.06 
 
 		 650 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  48.06 
 
 		 650 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  48.05 
 
 		 607 aa  566  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  47.9 
 
 		 650 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  37.6 
 
 		 642 aa  382  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  38.44 
 
 		 660 aa  368  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  36.6 
 
 		 659 aa  362  9e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2449  lytic transglycosylase, catalytic  35.61 
 
 		 644 aa  361  2e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  36.64 
 
 		 678 aa  360  6e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  35.1 
 
 		 657 aa  351  3e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0992  Lytic transglycosylase catalytic  36.34 
 
 		 676 aa  348  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0652  lytic transglycosylase, catalytic  33.19 
 
 		 707 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  34.48 
 
 		 693 aa  336  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  35.1 
 
 		 657 aa  333  6e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  34.42 
 
 		 654 aa  331  3e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  34.19 
 
 		 671 aa  325  1e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  42.15 
 
 		 653 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  46.11 
 
 		 647 aa  291  3e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  42.71 
 
 		 663 aa  286  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  47.18 
 
 		 690 aa  275  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1874  lytic transglycosylase, catalytic  28.09 
 
 		 706 aa  215  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.331721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  27.02 
 
 		 663 aa  206  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2046  lytic transglycosylase, catalytic  31.36 
 
 		 735 aa  190  5.999999999999999e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.490447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  27.71 
 
 		 686 aa  188  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1765  soluble lytic murein transglycosylase  26 
 
 		 739 aa  187  6e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1892  Lytic transglycosylase catalytic  28.35 
 
 		 643 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2236  lytic transglycosylase, catalytic  27.2 
 
 		 641 aa  182  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0654901  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1863  lytic transglycosylase, catalytic  27.11 
 
 		 641 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.646597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2111  lytic transglycosylase, catalytic  27.04 
 
 		 641 aa  180  7e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396511  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2040  soluble lytic murein transglycosylase, putative  27.32 
 
 		 641 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004401  soluble lytic murein transglycosylase precursor  27.69 
 
 		 645 aa  171  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  27.36 
 
 		 650 aa  171  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2053  lytic transglycosylase catalytic  27.33 
 
 		 641 aa  170  9e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00204351  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  26.13 
 
 		 660 aa  170  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2100  lytic transglycosylase catalytic  27.33 
 
 		 641 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.254828  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  25.62 
 
 		 643 aa  168  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4559  hypothetical protein  27.24 
 
 		 641 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2273  lytic transglycosylase catalytic  27.24 
 
 		 641 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2285  Lytic transglycosylase catalytic  27.17 
 
 		 641 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2105  lytic transglycosylase, catalytic  26.87 
 
 		 641 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.828929  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  26.62 
 
 		 642 aa  164  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  26.85 
 
 		 643 aa  164  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 661 aa  163  8.000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  27.55 
 
 		 645 aa  162  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  31.61 
 
 		 716 aa  162  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  27.19 
 
 		 642 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  25.79 
 
 		 641 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  26.67 
 
 		 661 aa  157  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  25.45 
 
 		 648 aa  157  5.0000000000000005e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  26.79 
 
 		 649 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  25.99 
 
 		 642 aa  156  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  24.92 
 
 		 637 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  25.92 
 
 		 649 aa  154  5e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00998  soluble lytic murein transglycosylase  25.86 
 
 		 648 aa  153  8.999999999999999e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  26.04 
 
 		 649 aa  153  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  27.78 
 
 		 642 aa  153  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.74 
 
 		 669 aa  153  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  27.54 
 
 		 642 aa  153  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  26.75 
 
 		 657 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  25.79 
 
 		 647 aa  151  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03735  putative soluble lytic murein transglycosylase  25.39 
 
 		 576 aa  151  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1059  Lytic transglycosylase catalytic  32.84 
 
 		 658 aa  150  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.210137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0941  murein transglycosylase, putative  32.84 
 
 		 639 aa  150  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0658  soluble lytic murein transglycosylase precursor  25.27 
 
 		 644 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597018  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  25.72 
 
 		 593 aa  145  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4994  lytic murein transglycosylase  24.56 
 
 		 645 aa  145  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4833  lytic murein transglycosylase  24.56 
 
 		 645 aa  144  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4940  lytic murein transglycosylase  24.56 
 
 		 645 aa  144  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.183926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4906  lytic murein transglycosylase  24.56 
 
 		 645 aa  143  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  25.23 
 
 		 593 aa  143  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4992  lytic murein transglycosylase  24.4 
 
 		 645 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.971097 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  24.75 
 
 		 639 aa  141  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  24.75 
 
 		 639 aa  141  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  25.82 
 
 		 639 aa  140  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  25.58 
 
 		 642 aa  139  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0293  lytic transglycosylase, catalytic  25.38 
 
 		 637 aa  138  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  24.84 
 
 		 645 aa  136  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  23.4 
 
 		 645 aa  134  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  25.76 
 
 		 650 aa  134  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>