More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1851 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1851  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 262 aa  538  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467917  normal  0.53175 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  82.68 
 
 		 292 aa  432  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  74.89 
 
 		 230 aa  358  5e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149636  normal  0.0443917 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1772  two component transcriptional regulator, LuxR family  67.89 
 
 		 262 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3380  two component LuxR family transcriptional regulator  65.38 
 
 		 259 aa  323  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277634 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3199  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.03 
 
 		 262 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.68 
 
 		 211 aa  135  9e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 231 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3373  two component LuxR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 262 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.492418  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 229 aa  125  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4986  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  123  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170484  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3952  two component LuxR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 222 aa  122  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3161  two component response regulator transcription regulator protein  32.72 
 
 		 231 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.51 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0447  two component LuxR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.013193  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.7 
 
 		 213 aa  118  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  33.02 
 
 		 207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4084  two component LuxR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3237  response regulator  31.7 
 
 		 219 aa  116  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  31.8 
 
 		 234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 234 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4304  response regulator receiver  33.8 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.894661  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.781509  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  30.66 
 
 		 242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3592  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.49 
 
 		 235 aa  112  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.56 
 
 		 206 aa  112  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3437  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.33 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39912  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3579  two component LuxR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.393396  normal  0.0540104 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.1 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0163  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.09 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.107009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0939  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.58 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.224899  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0377  two component LuxR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 245 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.7 
 
 		 224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  31.8 
 
 		 213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3515  two component LuxR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 214 aa  109  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150532  hitchhiker  0.00248481 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2754  two component LuxR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 215 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221671  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2938  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.8 
 
 		 215 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2846  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.8 
 
 		 215 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.243379  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2233  LuxR response regulator receiver  29.33 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  29.03 
 
 		 221 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 228 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  28.31 
 
 		 219 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.28 
 
 		 219 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.02 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1249  response regulator  30.49 
 
 		 245 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0947405  normal  0.0892263 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2743  two component LuxR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 215 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231043  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.95 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0097  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.94 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142871  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.7 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25060  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  30.99 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.444591  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.13 
 
 		 218 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  28.31 
 
 		 219 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1651  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.11 
 
 		 218 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000163278  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 		 228 aa  105  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.82 
 
 		 226 aa  105  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.99 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1255  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.65 
 
 		 219 aa  105  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.490147  normal  0.40644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 214 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 216 aa  105  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  29.28 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.3 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0612  two component LuxR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 231 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.82 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3668  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.53 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0615  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.56 
 
 		 216 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2836  two component LuxR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  32.56 
 
 		 213 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  31.16 
 
 		 228 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4735  two component LuxR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 209 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.545478  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.27 
 
 		 218 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0373  response regulator receiver  35.09 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3621  response regulatory protein  30.13 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0192509  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.11 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.95 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  30.14 
 
 		 210 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  30.14 
 
 		 210 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  30.14 
 
 		 210 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  30.14 
 
 		 210 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  32.41 
 
 		 217 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 210 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.49 
 
 		 222 aa  103  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  30.14 
 
 		 210 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  29.28 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.87 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2295  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.91 
 
 		 222 aa  102  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.031577  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.58 
 
 		 217 aa  102  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  30.28 
 
 		 230 aa  102  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 207 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0279  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 216 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 222 aa  102  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3030  two component LuxR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 218 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 215 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 218 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109155  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>