202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1239 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



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Replicon accession
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% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1239  VacJ family lipoprotein  100 
 
 		 256 aa  525  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1620  hypothetical protein  69.96 
 
 		 270 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3760  VacJ-like lipoprotein  69.14 
 
 		 270 aa  362  3e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.364095  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1602  VacJ-like lipoprotein  68.67 
 
 		 262 aa  351  7e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.4421  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3982  VacJ family lipoprotein  71.98 
 
 		 275 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0949858  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1737  VacJ family lipoprotein  71.55 
 
 		 248 aa  348  7e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.577648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1287  VacJ family lipoprotein  69.83 
 
 		 274 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.616959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1329  VacJ family lipoprotein  69.83 
 
 		 274 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1886  hypothetical protein  69.75 
 
 		 270 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22290  hypothetical protein  70.21 
 
 		 267 aa  340  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128414  hitchhiker  1.919e-20 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35090  VacJ-like lipoprotein  61.6 
 
 		 257 aa  310  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.807776  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0977  VacJ-like lipoprotein  51.98 
 
 		 255 aa  218  6e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1775  surface lipoprotein  49.52 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0149793  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2657  VacJ family lipoprotein  42.52 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0995  VacJ-like lipoprotein  44.17 
 
 		 747 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.4612 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0227  VacJ family lipoprotein  47.03 
 
 		 295 aa  182  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.806934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2690  hypothetical protein  48.29 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1855  VacJ family lipoprotein  43.41 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2363  VacJ family lipoprotein  43.41 
 
 		 262 aa  169  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2132  VacJ family lipoprotein  39.13 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000157354  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  44.95 
 
 		 249 aa  160  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  45.96 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1589  VacJ family lipoprotein  43.06 
 
 		 220 aa  158  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  45.96 
 
 		 234 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  43.48 
 
 		 235 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  42.51 
 
 		 235 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  47.25 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  43.43 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  42.51 
 
 		 235 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  42.93 
 
 		 233 aa  151  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  47.9 
 
 		 336 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  43.43 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  47.9 
 
 		 319 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  44.44 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  47.9 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  42.93 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  42.29 
 
 		 340 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  47.9 
 
 		 319 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  43.43 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  47.9 
 
 		 319 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  47.9 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  47.9 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  47.9 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  52.99 
 
 		 290 aa  149  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  41.92 
 
 		 233 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  42.42 
 
 		 229 aa  149  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  41.92 
 
 		 260 aa  149  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  48.3 
 
 		 338 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  46.71 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  52.99 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  52.59 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  52.59 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  52.59 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  46.71 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  46.11 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  54.48 
 
 		 303 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  53.33 
 
 		 340 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  46.11 
 
 		 267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  51.85 
 
 		 318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  43.5 
 
 		 347 aa  145  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  50 
 
 		 336 aa  145  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  41.92 
 
 		 325 aa  145  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  51.85 
 
 		 321 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  51.85 
 
 		 321 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  46.39 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  45.51 
 
 		 281 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  40.89 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  45.51 
 
 		 277 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  44.31 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  40.76 
 
 		 267 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1157  VacJ family lipoprotein  44 
 
 		 248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  50 
 
 		 315 aa  139  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2280  VacJ family lipoprotein  40.78 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.920871  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  50 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  44.16 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  44.16 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  44.16 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  45.51 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  44.16 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  44.16 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  44.16 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  44.16 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  44.81 
 
 		 337 aa  136  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  48.51 
 
 		 249 aa  136  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  44.81 
 
 		 329 aa  135  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1970  VacJ family lipoprotein  51.82 
 
 		 260 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  0.0740313 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0319  VacJ family lipoprotein  43.45 
 
 		 230 aa  135  5e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2351  lipoprotein VacJ  44.16 
 
 		 321 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  41.42 
 
 		 266 aa  135  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  44.91 
 
 		 250 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  44.16 
 
 		 334 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  44.16 
 
 		 334 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  44.16 
 
 		 347 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  44.16 
 
 		 347 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  44.16 
 
 		 347 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205363 
 
 
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NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  45.61 
 
 		 271 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  46.94 
 
 		 291 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.258271 
 
 
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NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  38.69 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_0450  VacJ lipoprotein  38.46 
 
 		 290 aa  129  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.48332e-16  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  37.13 
 
 		 336 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
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