139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0784 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0784  transglutaminase domain protein  100 
 
 		 525 aa  1071    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4224  transglutaminase domain protein  33.83 
 
 		 515 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849724  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  35.06 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4199  transglutaminase domain protein  33.08 
 
 		 515 aa  73.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148466  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4178  transglutaminase domain-containing protein  23 
 
 		 485 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00683366  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  33.77 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3887  transglutaminase domain protein  32.35 
 
 		 478 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.978849 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  28.74 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4075  transglutaminase-like  31.03 
 
 		 515 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3803  transglutaminase domain protein  33.96 
 
 		 478 aa  63.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  25.6 
 
 		 269 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  32.73 
 
 		 266 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  33.62 
 
 		 263 aa  62.4  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  31.75 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  27.41 
 
 		 276 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0148  transglutaminase domain-containing protein  22.41 
 
 		 495 aa  60.1  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  33.94 
 
 		 260 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0053  transglutaminase-like  27.81 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.538035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  32.73 
 
 		 271 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3240  transglutaminase domain-containing protein  31.07 
 
 		 492 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  32.73 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  24.4 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0348  transglutaminase domain-containing protein  45.45 
 
 		 510 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.024702  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  34.38 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  26.14 
 
 		 259 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  28.19 
 
 		 290 aa  56.6  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 264 aa  56.6  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2845  transglutaminase domain protein  32.61 
 
 		 243 aa  55.8  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  30.41 
 
 		 273 aa  55.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  25.31 
 
 		 279 aa  56.2  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  26.49 
 
 		 259 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  29.76 
 
 		 292 aa  55.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  28.26 
 
 		 267 aa  54.7  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  40.54 
 
 		 327 aa  53.9  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  26.21 
 
 		 259 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  35.56 
 
 		 264 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  29.63 
 
 		 281 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  28.28 
 
 		 259 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3361  transglutaminase domain-containing protein  26.63 
 
 		 515 aa  51.6  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3615  transglutaminase domain protein  38.46 
 
 		 485 aa  51.2  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.859951  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  36.47 
 
 		 266 aa  50.8  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  28.57 
 
 		 314 aa  50.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0731  transglutaminase-like  27.32 
 
 		 281 aa  50.4  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.149665  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  28.68 
 
 		 268 aa  50.4  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15691  transglutaminase-like superfamily protein  29.29 
 
 		 281 aa  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.798972  normal  0.306347 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  27.35 
 
 		 631 aa  50.1  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  29.41 
 
 		 276 aa  50.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  32.61 
 
 		 273 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  34.09 
 
 		 261 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  29.63 
 
 		 298 aa  50.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  31.13 
 
 		 295 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  25.82 
 
 		 291 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  27.81 
 
 		 281 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  26.83 
 
 		 276 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  30.09 
 
 		 293 aa  48.5  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2396  transglutaminase-like  31.93 
 
 		 328 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  38.67 
 
 		 321 aa  48.5  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  30.71 
 
 		 286 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  30.99 
 
 		 268 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  30.91 
 
 		 279 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  30.48 
 
 		 271 aa  48.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  28.8 
 
 		 272 aa  48.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  31.46 
 
 		 265 aa  48.1  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  28.86 
 
 		 280 aa  47.8  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0089  transglutaminase-like domain-containing protein  28.12 
 
 		 559 aa  47.8  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.890892  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  28.69 
 
 		 275 aa  47.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  26.34 
 
 		 275 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  37.21 
 
 		 268 aa  47.4  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  22.75 
 
 		 257 aa  47.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  35.56 
 
 		 298 aa  47.4  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  29.79 
 
 		 271 aa  47.4  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  28.21 
 
 		 282 aa  47  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  31.03 
 
 		 274 aa  47  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  27.47 
 
 		 280 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0705  hypothetical protein  28.8 
 
 		 211 aa  47  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.255488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  31.82 
 
 		 260 aa  46.6  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  30.7 
 
 		 277 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  31.9 
 
 		 279 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  30 
 
 		 272 aa  46.6  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  31.9 
 
 		 279 aa  47  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  29.2 
 
 		 266 aa  46.6  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0645  transglutaminase domain protein  27.82 
 
 		 288 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  28.46 
 
 		 280 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5370  transglutaminase domain protein  29.77 
 
 		 1081 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  26.52 
 
 		 273 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  27.94 
 
 		 266 aa  46.2  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  33.33 
 
 		 272 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  29.75 
 
 		 273 aa  45.8  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 272 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  26.17 
 
 		 284 aa  45.8  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 272 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  29.92 
 
 		 286 aa  45.8  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2571  transglutaminase domain protein  30.71 
 
 		 1559 aa  46.2  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0223142  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  30.15 
 
 		 275 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  29.89 
 
 		 274 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  32.61 
 
 		 279 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  30.86 
 
 		 286 aa  45.8  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  26.89 
 
 		 285 aa  45.8  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  26.67 
 
 		 273 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>