More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1148 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  100 
 
 		 921 aa  1865    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  30.26 
 
 		 896 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  30.29 
 
 		 933 aa  300  7e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  29.54 
 
 		 947 aa  277  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  27.85 
 
 		 905 aa  272  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 904 aa  269  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  27.83 
 
 		 913 aa  268  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  28.32 
 
 		 901 aa  250  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  26.85 
 
 		 913 aa  249  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.54 
 
 		 914 aa  243  7.999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.32 
 
 		 924 aa  242  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 921 aa  238  4e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 914 aa  230  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.11 
 
 		 930 aa  219  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.13 
 
 		 932 aa  204  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  26.03 
 
 		 924 aa  204  9e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  23.56 
 
 		 887 aa  203  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.55 
 
 		 889 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.31 
 
 		 922 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41810  putative transcriptional regulator  25.62 
 
 		 901 aa  196  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.14 
 
 		 913 aa  195  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.62 
 
 		 876 aa  190  9e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.78 
 
 		 880 aa  189  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.9 
 
 		 1021 aa  189  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.42 
 
 		 894 aa  188  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  27.59 
 
 		 824 aa  186  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  25.25 
 
 		 878 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  25.62 
 
 		 916 aa  182  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  25.93 
 
 		 900 aa  182  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.28 
 
 		 910 aa  181  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.03 
 
 		 921 aa  170  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.03 
 
 		 921 aa  170  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.08 
 
 		 921 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 947 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2722  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.19 
 
 		 947 aa  163  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0601  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  24.12 
 
 		 901 aa  163  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000493174 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  24.84 
 
 		 903 aa  162  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  24.84 
 
 		 903 aa  162  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3832  regulatory protein, LuxR  24.8 
 
 		 1336 aa  160  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196603  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  30.48 
 
 		 899 aa  159  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2742  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.04 
 
 		 930 aa  157  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.649414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  26.1 
 
 		 919 aa  156  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.87 
 
 		 925 aa  154  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  23.61 
 
 		 921 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.41 
 
 		 867 aa  147  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  29.1 
 
 		 766 aa  144  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  30.6 
 
 		 897 aa  144  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7173  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.81 
 
 		 928 aa  144  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.43 
 
 		 877 aa  140  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  26.7 
 
 		 904 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  30.09 
 
 		 907 aa  140  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.14 
 
 		 1003 aa  138  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  25.88 
 
 		 1110 aa  136  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 905 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  28.06 
 
 		 905 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  26.87 
 
 		 907 aa  131  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4133  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  26.08 
 
 		 749 aa  128  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2523  regulatory protein, LuxR  25.66 
 
 		 879 aa  126  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.59 
 
 		 905 aa  126  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1583  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.11 
 
 		 955 aa  125  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.559531  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0037  transcriptional regulator MalT  24.69 
 
 		 901 aa  125  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.61 
 
 		 905 aa  125  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  28.17 
 
 		 902 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  28.42 
 
 		 901 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  28.17 
 
 		 901 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  28.17 
 
 		 901 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  28.17 
 
 		 901 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.77 
 
 		 1019 aa  122  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  23.65 
 
 		 902 aa  121  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1602  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.11 
 
 		 897 aa  120  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  24.6 
 
 		 906 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4031  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.92 
 
 		 896 aa  119  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.924331  normal  0.36139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  25.54 
 
 		 910 aa  118  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  24.14 
 
 		 906 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3827  transcriptional regulator domain-containing protein  32.49 
 
 		 1102 aa  117  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0262799 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  28.64 
 
 		 917 aa  115  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  26.02 
 
 		 920 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  27.84 
 
 		 960 aa  110  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5812  transcriptional regulator LuxR family  26.8 
 
 		 894 aa  110  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4082  regulatory protein, LuxR  28.61 
 
 		 888 aa  108  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.566011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2281  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  28.98 
 
 		 730 aa  108  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5475  regulatory protein, LuxR  24.33 
 
 		 911 aa  107  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450601  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3129  transcriptional regulator MalT  25.76 
 
 		 914 aa  106  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535917  decreased coverage  0.00386402 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  25 
 
 		 896 aa  105  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.24 
 
 		 911 aa  105  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5436  ATP-dependent transcription regulator LuxR  21.64 
 
 		 891 aa  105  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  27.49 
 
 		 1204 aa  105  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  25.26 
 
 		 1097 aa  103  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  26.37 
 
 		 1145 aa  102  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  24.23 
 
 		 914 aa  102  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5308  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.64 
 
 		 397 aa  102  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.418046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3844  regulatory protein, LuxR  27.33 
 
 		 944 aa  101  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  25.92 
 
 		 758 aa  101  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3097  LuxR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 898 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0989415  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1436  GerE family regulatory protein  27.71 
 
 		 921 aa  99.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2039  LuxR family transcriptional regulator  27.58 
 
 		 917 aa  99  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1063  LuxR family transcriptional regulator  27.58 
 
 		 917 aa  99  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1348  LuxR family transcriptional regulator  27.58 
 
 		 917 aa  99  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.554665  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2330  LuxR family transcriptional regulator  27.58 
 
 		 917 aa  99  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1911  transcriptional regulator domain protein  30.2 
 
 		 990 aa  97.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.345318  decreased coverage  0.000588756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>