More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0755 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0755  hypothetical protein  100 
 
 		 514 aa  1044    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921366 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2090  hypothetical protein  65.56 
 
 		 518 aa  678    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2070  hypothetical protein  65.18 
 
 		 518 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2212  hypothetical protein  65.95 
 
 		 518 aa  676    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.976757  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1895  hypothetical protein  60.58 
 
 		 514 aa  625  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1554  hypothetical protein  59.81 
 
 		 513 aa  590  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.872181 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0899  hypothetical protein  56.12 
 
 		 537 aa  548  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.146101 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2852  hypothetical protein  56.31 
 
 		 515 aa  525  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0107  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  55.81 
 
 		 519 aa  523  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3384  hypothetical protein  56.76 
 
 		 515 aa  521  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.549431  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30230  hypothetical protein  54.86 
 
 		 519 aa  518  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2345  hypothetical protein  53.68 
 
 		 552 aa  518  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4676  hypothetical protein  51.84 
 
 		 553 aa  511  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  0.637803 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3896  hypothetical protein  54.28 
 
 		 513 aa  510  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1545  hypothetical protein  53.89 
 
 		 531 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2811  hypothetical protein  53.01 
 
 		 551 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.193818  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6653  hypothetical protein  55.9 
 
 		 516 aa  508  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.895478  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3510  hypothetical protein  54.26 
 
 		 531 aa  503  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2713  hypothetical protein  55.53 
 
 		 515 aa  504  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3488  hypothetical protein  52.99 
 
 		 555 aa  503  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104539  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4260  hypothetical protein  54.47 
 
 		 512 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3016  hypothetical protein  53.1 
 
 		 514 aa  497  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1808  hypothetical protein  54.47 
 
 		 514 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.62822  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3930  hypothetical protein  55.25 
 
 		 514 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12121  normal  0.390263 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3688  hypothetical protein  55.06 
 
 		 515 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4594  hypothetical protein  53.2 
 
 		 514 aa  493  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.456101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1143  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  52.04 
 
 		 516 aa  486  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3003  hypothetical protein  51.36 
 
 		 512 aa  479  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2118  hypothetical protein  52.83 
 
 		 517 aa  479  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5213  hypothetical protein  55.02 
 
 		 519 aa  481  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.72595  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13543  hypothetical protein  51.46 
 
 		 515 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.26797e-96  hitchhiker  0.000000374579 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4353  hypothetical protein  50.19 
 
 		 513 aa  455  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2570  hypothetical protein  48.38 
 
 		 529 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1933  hypothetical protein  51.07 
 
 		 513 aa  432  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3134  hypothetical protein  47.88 
 
 		 527 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.673748  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3491  hypothetical protein  46.54 
 
 		 529 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.704588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2860  hypothetical protein  47.56 
 
 		 508 aa  382  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6728  hypothetical protein  46.12 
 
 		 526 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1601  hypothetical protein  34.36 
 
 		 506 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4704  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.36 
 
 		 568 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0820  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  28.85 
 
 		 589 aa  190  4e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.155153  unclonable  0.0000131955 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89681  predicted protein  34.76 
 
 		 652 aa  171  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.574847 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2867  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.98 
 
 		 542 aa  168  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6666  benzoylformate decarboxylase  27 
 
 		 540 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1644  putative thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  26.17 
 
 		 554 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1191  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  28.99 
 
 		 545 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0944  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  28.11 
 
 		 527 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0743  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.44 
 
 		 551 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341364 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1679  benzoylformate decarboxylase  27.54 
 
 		 518 aa  136  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1023  benzoylformate decarboxylase  26.55 
 
 		 529 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3699  benzoylformate decarboxylase  27 
 
 		 540 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1896  benzoylformate decarboxylase  25.71 
 
 		 529 aa  133  9e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3938  benzoylformate decarboxylase  26.43 
 
 		 540 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2607  benzoylformate decarboxylase  26.84 
 
 		 535 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2583  benzoylformate decarboxylase  26.65 
 
 		 535 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.380504  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5047  benzoylformate decarboxylase  27.99 
 
 		 533 aa  128  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2941  benzoylformate decarboxylase  28.06 
 
 		 528 aa  127  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0705  benzoylformate decarboxylase  26.92 
 
 		 539 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214381  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5624  benzoylformate decarboxylase  28.03 
 
 		 549 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  26.01 
 
 		 552 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0714  benzoylformate decarboxylase  26.21 
 
 		 536 aa  125  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.331157 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0308  benzoylformate decarboxylase  26.45 
 
 		 528 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0935953  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.59 
 
 		 499 aa  123  6e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232472 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64770  benzoylformate decarboxylase  27.81 
 
 		 528 aa  123  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.819611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0887  benzoylformate decarboxylase  25.95 
 
 		 539 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152058  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0093  benzoylformate decarboxylase  25.95 
 
 		 539 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2480  benzoylformate decarboxylase  25.95 
 
 		 539 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.20481  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0346  benzoylformate decarboxylase  25.95 
 
 		 539 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1048  benzoylformate decarboxylase  25.95 
 
 		 539 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0092  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  26.58 
 
 		 561 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.554485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0645  benzoylformate decarboxylase  25.95 
 
 		 539 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0521172  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0890  benzoylformate decarboxylase  25.95 
 
 		 539 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1999  benzoylformate decarboxylase  27.21 
 
 		 529 aa  120  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  25.5 
 
 		 552 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38200  thiamine pyrophosphate protein  25.23 
 
 		 552 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112999 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1705  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  26.46 
 
 		 540 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4284  hypothetical protein  27.16 
 
 		 541 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1424  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  24.82 
 
 		 536 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2758  thiamine pyrophosphate protein central region  25.37 
 
 		 540 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3594  hypothetical protein  27.62 
 
 		 541 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234761  normal  0.928094 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5548  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  25.27 
 
 		 568 aa  111  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2521  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  24.69 
 
 		 547 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.948829  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1088  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.19 
 
 		 533 aa  107  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.703546  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1921  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.56 
 
 		 576 aa  107  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.299558 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1557  acetolactate synthase large subunit  26.71 
 
 		 564 aa  105  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0137  thiamine pyrophosphate protein  27.21 
 
 		 538 aa  104  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3397  acetolactate synthase  25.54 
 
 		 556 aa  103  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2037  thiamine pyrophosphate protein  25.31 
 
 		 549 aa  103  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2862  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.29 
 
 		 564 aa  100  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1932  acetolactate synthase, large subunit  23.54 
 
 		 570 aa  100  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0639  acetolactate synthase  24.77 
 
 		 548 aa  98.6  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237163  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1062  acetolactate synthase, large subunit  23.66 
 
 		 556 aa  99  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1893  pyruvate oxidase or other thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  24.46 
 
 		 602 aa  99  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.68622e-18 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1851  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.31 
 
 		 566 aa  98.2  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0174  acetolactate synthase, large subunit  23.77 
 
 		 544 aa  97.8  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.936487  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1620  thiamine pyrophosphate protein  26.52 
 
 		 567 aa  97.8  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.738779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3419  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.21 
 
 		 579 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.130634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4942  thiamine pyrophosphate protein  23.64 
 
 		 567 aa  95.1  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4459  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  23.33 
 
 		 566 aa  94.4  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.325037  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1497  thiamine pyrophosphate protein  24.18 
 
 		 582 aa  94  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>