More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0317 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0317  inner-membrane translocator  100 
 
 		 323 aa  624  1e-178  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1804  inner-membrane translocator  75.54 
 
 		 323 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.68636 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1504  inner-membrane translocator  49.53 
 
 		 321 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.163157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0826  inner-membrane translocator  52.24 
 
 		 318 aa  257  2e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1582  inner-membrane translocator  34.92 
 
 		 322 aa  159  9e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0591  inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 318 aa  155  7e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000340346 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1761  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.328925  hitchhiker  0.000752559 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0600  inner-membrane translocator  32.88 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0445  inner-membrane translocator  34 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4249  inner-membrane translocator  33 
 
 		 287 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00770361  hitchhiker  0.0000029415 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2158  inner-membrane translocator  35.11 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2201  inner-membrane translocator  32.68 
 
 		 289 aa  106  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.796899  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1604  inner-membrane translocator  32.31 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1579  inner-membrane translocator  32.31 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0657  inner-membrane translocator  30.07 
 
 		 338 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3929  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1275  inner-membrane translocator  32.22 
 
 		 336 aa  100  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.732042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3203  inner-membrane translocator  29.5 
 
 		 422 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1518  hypothetical protein  31.74 
 
 		 336 aa  98.2  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.442526 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3008  inner-membrane translocator  30.2 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0507  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  27.81 
 
 		 319 aa  93.2  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2177  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids NatD  27.27 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.801545 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1420  inner-membrane translocator  28.81 
 
 		 289 aa  89.7  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1940  inner-membrane translocator  28.62 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1111  inner-membrane translocator  32.3 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  28.33 
 
 		 301 aa  87  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4485  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 295 aa  87  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19585  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1258  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 291 aa  85.9  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241594  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  28.3 
 
 		 652 aa  85.9  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2888  inner-membrane translocator  30.22 
 
 		 446 aa  85.1  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0686  inner-membrane translocator  29.33 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1979  putative branched-chain amino acid transport system / permease component  28.48 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2164  inner-membrane translocator  28.3 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  26.47 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3966  inner-membrane translocator  29.02 
 
 		 382 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4470  inner-membrane translocator  32.55 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1740  inner-membrane translocator  27.03 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2926  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.34 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.686459  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  29.26 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3086  inner-membrane translocator  29.35 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2753  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  27.48 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110353  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0601  inner-membrane translocator  28.68 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1571  inner-membrane translocator  31.34 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.350199  normal  0.598455 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2006  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.81 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.766894  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4423  inner-membrane translocator  30.84 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  27.48 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5994  branched chain amino acid ABC transporter permease  29.89 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717664 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  28.9 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  28.95 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  28.24 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2082  inner-membrane translocator  26.62 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.5 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1438  inner-membrane translocator  27.65 
 
 		 288 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  28.52 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2425  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  27.27 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674149  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1231  inner-membrane translocator  30.5 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000126142 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1622  inner-membrane translocator  26.32 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.937087 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3800  inner-membrane translocator  28.48 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.469116  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1158  inner-membrane translocator  31.48 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.546012  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.34 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.23 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3492  inner-membrane translocator  28.48 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1533  inner-membrane translocator  27.27 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575934  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  29.37 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1212  inner-membrane translocator  28.1 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273488  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  26.16 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0923  inner-membrane translocator  32.46 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161069  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3010  inner-membrane translocator  25.93 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000508141  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1182  branched-chain amino acid ABC-type transport system permease components  29.37 
 
 		 481 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.729657  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  28.06 
 
 		 603 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.06 
 
 		 603 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.9 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.1 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  28.06 
 
 		 603 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0862  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  27.52 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0185519  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3874  inner-membrane translocator  27.15 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  27.87 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2204  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2203  inner-membrane translocator  29.93 
 
 		 492 aa  76.6  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0550  inner-membrane translocator  29.04 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  27.45 
 
 		 603 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  27.74 
 
 		 603 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.26 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  28.52 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0534  inner-membrane translocator  27.56 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000179103 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0896  inner-membrane translocator  24.66 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  28.43 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  26.37 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  26.71 
 
 		 287 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3646  inner-membrane translocator  27.47 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362219  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3292  hypothetical protein  27.48 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518243 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  28.74 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  27 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1096  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  24.07 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3836  inner-membrane translocator  26.29 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2501  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1091  inner-membrane translocator  31.64 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1794  inner-membrane translocator  30.8 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385321  hitchhiker  0.00053204 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3399  inner-membrane translocator  26.07 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>