84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3788 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  100 
 
 
518 aa  1071    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  53.55 
 
 
522 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  52.02 
 
 
500 aa  537  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  31.12 
 
 
483 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  29.21 
 
 
508 aa  189  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  30 
 
 
474 aa  184  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  30.1 
 
 
504 aa  184  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  29.04 
 
 
476 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  30.73 
 
 
492 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  32.03 
 
 
504 aa  177  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  30.14 
 
 
482 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  27.36 
 
 
547 aa  169  9e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  27.79 
 
 
489 aa  167  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  28.46 
 
 
479 aa  161  3e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  29.95 
 
 
481 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  27.32 
 
 
546 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  28.11 
 
 
487 aa  158  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  26.63 
 
 
510 aa  153  8.999999999999999e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  28.73 
 
 
525 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  26.01 
 
 
508 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  26.06 
 
 
511 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  26.4 
 
 
506 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  26.89 
 
 
510 aa  139  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  26.94 
 
 
513 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  27.31 
 
 
498 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  25.68 
 
 
514 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  26.11 
 
 
488 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  26.06 
 
 
486 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  26.48 
 
 
540 aa  136  9e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  28.28 
 
 
509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  26.79 
 
 
505 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  25.95 
 
 
531 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  27.84 
 
 
528 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  27.83 
 
 
538 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  26.06 
 
 
515 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  26.02 
 
 
529 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  25.42 
 
 
488 aa  126  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  25.87 
 
 
480 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  25.23 
 
 
498 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  25.68 
 
 
520 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  27.02 
 
 
479 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  23.56 
 
 
515 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  24.6 
 
 
533 aa  116  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  25.37 
 
 
533 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  27.82 
 
 
543 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  24.89 
 
 
534 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  27.45 
 
 
526 aa  110  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  23.98 
 
 
570 aa  110  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  24.09 
 
 
524 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  24.63 
 
 
500 aa  108  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  25.46 
 
 
525 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  26.35 
 
 
487 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  26.68 
 
 
532 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  24.59 
 
 
489 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  26.57 
 
 
541 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  24.54 
 
 
482 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  24.35 
 
 
534 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  26.59 
 
 
526 aa  101  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  25.05 
 
 
499 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  25.38 
 
 
532 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  24.59 
 
 
514 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  25.04 
 
 
536 aa  97.8  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  24.36 
 
 
536 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  27.76 
 
 
517 aa  95.1  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  28.85 
 
 
541 aa  94  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  24.74 
 
 
532 aa  90.9  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  24.6 
 
 
528 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  25.59 
 
 
530 aa  87.8  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  24.15 
 
 
552 aa  87.4  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  24.3 
 
 
478 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  23 
 
 
446 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  24.29 
 
 
525 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  25.23 
 
 
473 aa  73.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  23.78 
 
 
463 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  24.81 
 
 
474 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  23.01 
 
 
492 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  26.41 
 
 
481 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  28.38 
 
 
578 aa  64.3  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  32.28 
 
 
476 aa  63.5  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  28.12 
 
 
472 aa  60.1  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  19.49 
 
 
484 aa  60.1  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  29.06 
 
 
476 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  28.22 
 
 
630 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4130  hypothetical protein  26.84 
 
 
539 aa  50.4  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262197  normal  0.665943 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>