More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5712 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5712  general substrate transporter  100 
 
 		 406 aa  792    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2253  general substrate transporter  60 
 
 		 409 aa  360  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3740  major facilitator family transporter  44.28 
 
 		 446 aa  255  8e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3120  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2166  major facilitator transporter  44.03 
 
 		 446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156507  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2023  major facilitator transporter  43.28 
 
 		 446 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1354  major facilitator transporter  40.27 
 
 		 450 aa  233  5e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5692  major facilitator superfamily MFS_1  38.56 
 
 		 445 aa  232  7.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419889  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3815  major facilitator transporter  37.14 
 
 		 446 aa  219  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203479 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64790  putative MFS transporter  43.15 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.518185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5626  MFS family transporter  44.92 
 
 		 487 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441571  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7103  major facilitator superfamily MFS_1  33.63 
 
 		 458 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191279  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0417  major facilitator transporter  36.48 
 
 		 447 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5127  major facilitator transporter  35.46 
 
 		 447 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4594  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 447 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.319083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26060  sugar phosphate permease  33.73 
 
 		 445 aa  186  6e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03944  MFS transporter  35.11 
 
 		 435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1254  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.01739 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 452 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 452 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 453 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  29.9 
 
 		 441 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 453 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  30.24 
 
 		 450 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 453 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1588  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 410 aa  148  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.245234  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  30.22 
 
 		 475 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  29.55 
 
 		 454 aa  146  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  30.22 
 
 		 441 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 438 aa  145  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  29.93 
 
 		 451 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  29.93 
 
 		 451 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 454 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  29.85 
 
 		 451 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  29.85 
 
 		 451 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  29.85 
 
 		 451 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  29.85 
 
 		 451 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 465 aa  142  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.84268 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00307  predicted 3-hydroxyphenylpropionic transporter  31.91 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3253  benzoate transport  31.91 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00311  hypothetical protein  31.91 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3272  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  31.91 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.834924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  29.68 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0428  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  31.91 
 
 		 403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  30.15 
 
 		 458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0377  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  31.91 
 
 		 403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0417  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  31.91 
 
 		 403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0384  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  31.91 
 
 		 403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  30.27 
 
 		 451 aa  141  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  29.9 
 
 		 579 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 449 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 449 aa  139  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 458 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 461 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0804  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 432 aa  134  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 449 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3364  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 		 463 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4063  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 		 461 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 450 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 457 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  29.77 
 
 		 454 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  27.14 
 
 		 455 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  28.93 
 
 		 448 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  29.29 
 
 		 465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  29.52 
 
 		 458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  27.53 
 
 		 465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2748  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.68 
 
 		 450 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 448 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  28.12 
 
 		 448 aa  127  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  27.43 
 
 		 448 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  27.57 
 
 		 448 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 449 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2499  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 465 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728984 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0717  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 530 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320017 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 459 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2055  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  30.19 
 
 		 401 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.205311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2628  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 465 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2604  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 467 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.792684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  28.84 
 
 		 446 aa  124  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5911  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 487 aa  123  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2580  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 467 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4030  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 463 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1969  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 467 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364305  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1556  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 432 aa  122  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  27.32 
 
 		 448 aa  123  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2340  4-hydroxybenzoate transporter  29.78 
 
 		 449 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.934409  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42110  major facilitator superfamily protein  32.43 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.303257  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0273  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  31.27 
 
 		 423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  26.34 
 
 		 448 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4020  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  27.88 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2408  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  31.37 
 
 		 413 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 452 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17300  Major facilitator superfamily transporter  29.22 
 
 		 407 aa  120  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 447 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  27.68 
 
 		 447 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  28.5 
 
 		 455 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3283  MFS family transporter  30.95 
 
 		 450 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170295  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1985  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  33.33 
 
 		 410 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.884683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>