107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0567 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0147  peptidase M50  60.11 
 
 		 698 aa  828    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0670  peptidase M50  59.11 
 
 		 697 aa  785    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726178  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0479  peptidase M50  75.46 
 
 		 701 aa  1060    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0390  peptidase M50  77.36 
 
 		 707 aa  1107    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270715  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0472  peptidase M50  94.16 
 
 		 702 aa  1335    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0567  peptidase M50  100 
 
 		 701 aa  1410    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0681  hypothetical protein  39.86 
 
 		 709 aa  495  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0909  hypothetical protein  40 
 
 		 709 aa  485  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1149  peptidase M50  40.62 
 
 		 714 aa  476  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2056  hypothetical protein  40.06 
 
 		 709 aa  451  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3180  peptidase M50  37.7 
 
 		 688 aa  429  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0300  hypothetical protein  35.33 
 
 		 719 aa  423  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0133976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1674  peptidase M50  34.75 
 
 		 703 aa  418  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.551659 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0417  peptidase M50  36.15 
 
 		 701 aa  403  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3741  HlyD domain-containing protein  35.58 
 
 		 720 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3074  peptidase M50  35.86 
 
 		 696 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.688769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5411  putative membrane Zinc metallopeptidase, M50 family  35.04 
 
 		 699 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000871616  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0372  hypothetical protein  39.45 
 
 		 474 aa  350  4e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.707522  normal  0.611726 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1407  M50 family peptidase  27.67 
 
 		 720 aa  200  7e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3966  peptidase M50  25.95 
 
 		 741 aa  172  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0925  M50 family peptidase  28.16 
 
 		 715 aa  172  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135222  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1342  M50 family peptidase  25.87 
 
 		 714 aa  171  6e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2399  M50 family peptidase  25.5 
 
 		 715 aa  151  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3235  M50 family peptidase  26.62 
 
 		 711 aa  150  9e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.347928 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2358  peptidase, M50 family  26.11 
 
 		 715 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.398035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2176  M50 family peptidase  25.37 
 
 		 721 aa  148  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.510962  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0619  M50 family peptidase  25.3 
 
 		 715 aa  144  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2198  peptidase M50  25.96 
 
 		 720 aa  133  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961426 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0366  peptidase M50  26.33 
 
 		 736 aa  118  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4341  peptidase M50  25.41 
 
 		 367 aa  89.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  33.77 
 
 		 1171 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  31.79 
 
 		 1177 aa  80.5  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0373  hypothetical protein  29.95 
 
 		 205 aa  77  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.5146 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4373  hypothetical protein  37.12 
 
 		 825 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  33.82 
 
 		 1124 aa  75.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3220  sterol-regulatory element binding protein (SREBP) site 2 protease family protein  28.19 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.496668  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2677  hypothetical protein  35.61 
 
 		 847 aa  70.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2722  hypothetical protein  35.61 
 
 		 847 aa  70.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0895227  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2708  hypothetical protein  35.61 
 
 		 844 aa  70.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0921  hypothetical protein  30.22 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2919  hypothetical protein  31.75 
 
 		 824 aa  70.5  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2293  hypothetical protein  34.85 
 
 		 838 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  31.21 
 
 		 948 aa  66.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3579  hypothetical protein  23.16 
 
 		 350 aa  66.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00448549  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33960  hypothetical protein  32.26 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13940  Zn-dependent protease  30.56 
 
 		 379 aa  60.5  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.909069 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3233  hypothetical protein  34.17 
 
 		 812 aa  57.4  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1596  hypothetical protein  33.09 
 
 		 497 aa  56.2  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3142  hypothetical protein  26.67 
 
 		 761 aa  55.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154209  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2470  hypothetical protein  25.86 
 
 		 176 aa  55.1  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1951  hypothetical protein  28.5 
 
 		 1097 aa  53.5  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00270024  hitchhiker  0.000836755 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5410  hypothetical protein  27.78 
 
 		 449 aa  51.2  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288703  normal  0.36048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3073  hypothetical protein  24.84 
 
 		 448 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  24.15 
 
 		 285 aa  50.8  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  24.15 
 
 		 285 aa  50.8  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0418  membrane-fusion protein  23.27 
 
 		 436 aa  49.3  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1539  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  26.04 
 
 		 286 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.338335  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  23.67 
 
 		 285 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1552  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  26.04 
 
 		 286 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1612  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  26.04 
 
 		 286 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.473839 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1732  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  26.04 
 
 		 286 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0446824  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1901  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  26.04 
 
 		 286 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  23.67 
 
 		 285 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  23.67 
 
 		 285 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.05 
 
 		 372 aa  48.5  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  23.67 
 
 		 285 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0747  secretion protein HlyD  24.26 
 
 		 357 aa  48.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.554021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  23.67 
 
 		 285 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  23.67 
 
 		 285 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  23.67 
 
 		 285 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2055  hypothetical protein  25.9 
 
 		 442 aa  47.8  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4014  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.92 
 
 		 362 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181773  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3834  RND family efflux transporter MFP subunit  32.67 
 
 		 383 aa  46.2  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3851  RND family efflux transporter MFP subunit  32.67 
 
 		 383 aa  46.2  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1919  RND family efflux transporter MFP subunit  32.67 
 
 		 383 aa  46.2  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  23.61 
 
 		 357 aa  46.6  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  25.47 
 
 		 351 aa  45.8  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.97 
 
 		 351 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0173  secretion protein HlyD  26.63 
 
 		 295 aa  45.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0480  RND family efflux transporter MFP subunit  26.87 
 
 		 363 aa  45.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  25.47 
 
 		 351 aa  45.4  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2833  secretion protein HlyD family protein  30.91 
 
 		 383 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121026  normal  0.828234 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00325  cation efflux system protein  26.32 
 
 		 244 aa  45.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.888841  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0478  hypothetical protein  21.96 
 
 		 436 aa  45.4  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2514  acriflavin resistance protein B  22.86 
 
 		 371 aa  45.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.825279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2750  secretion protein HlyD family protein  49.02 
 
 		 337 aa  45.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00705  cation efflux system protein  29.57 
 
 		 371 aa  45.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333087  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1570  hypothetical protein  38.57 
 
 		 365 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0569959  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1329  membrane metalloprotease  38.57 
 
 		 365 aa  44.7  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1465  hypothetical protein  38.57 
 
 		 365 aa  44.7  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00633  membrane fusion protein  32.23 
 
 		 350 aa  44.7  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1538  hypothetical protein  38.57 
 
 		 365 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000573699 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1355  hypothetical protein  38.57 
 
 		 365 aa  44.3  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0926  GAF domain-containing protein  24.46 
 
 		 614 aa  44.3  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  24.45 
 
 		 330 aa  44.7  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2685  RND family efflux transporter MFP subunit  32 
 
 		 383 aa  44.3  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.133522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3740  HlyD family secretion protein  25.14 
 
 		 441 aa  44.3  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1394  RND family efflux transporter MFP subunit  22.94 
 
 		 337 aa  44.3  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000175067  unclonable  0.0000000000192575 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1447  RND family efflux transporter MFP subunit  22.94 
 
 		 337 aa  44.3  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000819965  unclonable  0.000000000091848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0019  RND family efflux transporter MFP subunit  29.75 
 
 		 382 aa  44.3  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>