71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1423 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  461  1e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  95.65 
 
 
231 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  69.96 
 
 
224 aa  302  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1589  hypothetical protein  36.94 
 
 
222 aa  149  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3646  hypothetical protein  40.72 
 
 
222 aa  148  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  38.86 
 
 
220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001425  predicted membrane protein  41.23 
 
 
223 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00453173  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  44.5 
 
 
222 aa  140  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2095  hypothetical protein  42.41 
 
 
225 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00423191  normal  0.636208 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0240  membrane protein  37.93 
 
 
220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06310  hypothetical protein  43.87 
 
 
215 aa  122  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1379  hypothetical protein  37.18 
 
 
214 aa  90.1  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  33.16 
 
 
227 aa  83.2  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  31.25 
 
 
259 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  31.84 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  33 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  30.04 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0124  hypothetical protein  32.06 
 
 
254 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  33.77 
 
 
248 aa  62  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  28.81 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  32.5 
 
 
386 aa  59.7  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4780  protein of unknown function DUF1275  29.91 
 
 
247 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3703  protein of unknown function DUF1275  29.91 
 
 
247 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257244  normal  0.181196 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  27.75 
 
 
209 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3877  hypothetical protein  32.5 
 
 
268 aa  58.5  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  28.57 
 
 
234 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  26.34 
 
 
283 aa  56.6  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  26.42 
 
 
252 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  26.42 
 
 
252 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  29.72 
 
 
233 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0107  protein of unknown function DUF1275  28.97 
 
 
241 aa  55.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  31.85 
 
 
233 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00757  hypothetical protein  30.17 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0577476 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  29.72 
 
 
233 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  36.42 
 
 
386 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6559  hypothetical protein  26.94 
 
 
252 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1272  hypothetical protein  26.94 
 
 
252 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6165  hypothetical protein  28.27 
 
 
252 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0183639 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  31.21 
 
 
228 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  25.24 
 
 
252 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7065  hypothetical protein  28.27 
 
 
252 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  28.77 
 
 
233 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5857  hypothetical protein  30.84 
 
 
247 aa  52.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0910  hypothetical protein  29.56 
 
 
270 aa  52.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  25.76 
 
 
250 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3694  hypothetical protein  27.62 
 
 
264 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  30 
 
 
233 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1534  hypothetical protein  32.37 
 
 
257 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1619  hypothetical protein  32.37 
 
 
257 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0111  hypothetical protein  32.37 
 
 
257 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  27.72 
 
 
241 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1535  protein of unknown function DUF1275  31.65 
 
 
250 aa  50.1  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.297465 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  28.84 
 
 
260 aa  49.7  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6265  hypothetical protein  28.27 
 
 
252 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1260  hypothetical protein  33.17 
 
 
257 aa  49.3  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6551  hypothetical protein  27.85 
 
 
252 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0167  hypothetical protein  29.7 
 
 
265 aa  49.3  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0185  protein of unknown function DUF1275  29.7 
 
 
265 aa  49.3  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0567993  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6146  membrane protein  31.2 
 
 
250 aa  49.3  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0092  hypothetical protein  32.35 
 
 
224 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4446  hypothetical protein  28.1 
 
 
242 aa  48.5  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4078  protein of unknown function DUF1275  24.56 
 
 
231 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.316044 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0243  hypothetical protein  29.7 
 
 
256 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44305  predicted protein  26.42 
 
 
291 aa  46.2  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0648478  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0318  protein of unknown function DUF1275  30.23 
 
 
213 aa  45.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  31.6 
 
 
254 aa  46.2  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2916  protein of unknown function DUF1275  35.29 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  28.28 
 
 
225 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4752  hypothetical protein  27.19 
 
 
244 aa  42.7  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4051  protein of unknown function DUF1275  27.06 
 
 
240 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0591  hypothetical protein  37.88 
 
 
232 aa  41.6  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>