More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0358 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0358  ABC transporter related  100 
 
 		 303 aa  623  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  42.55 
 
 		 284 aa  256  3e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1076  ABC transporter related  41.26 
 
 		 301 aa  246  3e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  43.86 
 
 		 295 aa  246  4e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  40 
 
 		 296 aa  235  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  41.2 
 
 		 293 aa  234  9e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.44 
 
 		 299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1955  ABC transporter, ATP-binding protein  41.64 
 
 		 282 aa  231  1e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1415  ABC transporter related protein  38.3 
 
 		 286 aa  227  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18810  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.79 
 
 		 291 aa  226  5.0000000000000005e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.222917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4876  ABC transporter related protein  40.28 
 
 		 299 aa  226  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1750  ABC transporter, ATP-binding protein  41.99 
 
 		 292 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3995  ABC transporter related  39.1 
 
 		 286 aa  222  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1559  ABC transporter related  41.28 
 
 		 292 aa  221  8e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1588  ABC transporter related  41.28 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2791  ABC transporter related  41.28 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1452  ABC transporter related  40.93 
 
 		 292 aa  219  5e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  38.43 
 
 		 289 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1187  ABC transporter, ATP-binding protein  41.28 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2797  ABC transporter, ATPase subunit  41.78 
 
 		 297 aa  215  7e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1980  ABC transporter related  37.72 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.240272  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1835  ABC transporter related  39.65 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0914  ABC transporter related  38.79 
 
 		 290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  39.86 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0073  ABC transporter related  37.01 
 
 		 292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1168  ABC transporter related protein  38.91 
 
 		 288 aa  211  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5232  ABC transporter related  39.01 
 
 		 300 aa  211  9e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.548962  hitchhiker  0.00635683 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2631  ABC transporter related  36.3 
 
 		 295 aa  210  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0819  ABC transporter related protein  36.14 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.989778  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1458  ABC transporter related  34.49 
 
 		 290 aa  198  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237048  normal  0.276078 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1029  ABC transporter related  37.06 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1094  ABC transporter, ATP-binding protein  37.37 
 
 		 290 aa  189  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0536636  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3435  ABC transporter-like protein  35.89 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2870  ABC transporter related protein  35.35 
 
 		 296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  36.7 
 
 		 369 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  36.04 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  34.75 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  36.19 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  34.09 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  35.21 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  37.39 
 
 		 303 aa  165  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  38.57 
 
 		 339 aa  163  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  34.31 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1168  ABC transporter related  36.63 
 
 		 335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  35.9 
 
 		 331 aa  162  9e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  33.33 
 
 		 317 aa  161  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  34.98 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  36.68 
 
 		 240 aa  160  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  32.04 
 
 		 328 aa  160  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0297  ABC transporter related protein  34.41 
 
 		 289 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  38.07 
 
 		 301 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  33.33 
 
 		 344 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  37.8 
 
 		 301 aa  158  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2039  ABC transporter-like protein protein  37.67 
 
 		 339 aa  158  9e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  31.08 
 
 		 329 aa  158  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  37.16 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  34.09 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2982  ABC transporter related protein  33.69 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  34.06 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  36.61 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2043  ABC transporter related  39.13 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.289791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  37.8 
 
 		 302 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  37.8 
 
 		 302 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  34.68 
 
 		 336 aa  155  6e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  35.87 
 
 		 339 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  38.53 
 
 		 322 aa  155  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  30.25 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  32.43 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  33.98 
 
 		 316 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  32.76 
 
 		 316 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0221  ABC transporter related  35.43 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  32.58 
 
 		 314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  35.87 
 
 		 339 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  35.87 
 
 		 339 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.78 
 
 		 318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.84 
 
 		 301 aa  153  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  38.03 
 
 		 299 aa  153  4e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.11 
 
 		 312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  36.49 
 
 		 308 aa  152  7e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  34.25 
 
 		 319 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  33.62 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  33.33 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  32.88 
 
 		 360 aa  151  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4743  ABC transporter related  33.62 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  33.63 
 
 		 316 aa  151  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  29.97 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  33.48 
 
 		 341 aa  150  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  34.13 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0454  ABC transporter related  33.18 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  32.43 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  34.38 
 
 		 328 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  32.54 
 
 		 311 aa  149  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39000  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  33.47 
 
 		 322 aa  149  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  38.43 
 
 		 327 aa  149  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  34.89 
 
 		 316 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  39.62 
 
 		 320 aa  149  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  39.46 
 
 		 327 aa  149  6e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0094  ABC transporter, ATP-binding protein  37.72 
 
 		 255 aa  149  7e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0351427 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04471  putative multidrug efflux ABC transporter  31.61 
 
 		 337 aa  149  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.797798  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>