119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0504 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0504  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 176 aa  350  5.9999999999999994e-96  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.21026 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0003  MarR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4421  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.636596  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3929  transcriptional regulator, MarR family  32.24 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000837661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  34.93 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3063  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565179  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0213  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 270 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3344  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 270 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4012  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4084  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574763  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3392  MarR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1624  MarR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2977  MarR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2918  MarR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1206  MarR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3251  MarR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  29.87 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2985  MarR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0529502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0070  MarR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0088  MarR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0070  MarR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0061  MarR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0069  MarR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4139  MarR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3267  transcriptional regulator, MarR family  32.47 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  36.56 
 
 		 141 aa  52.4  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 146 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 146 aa  51.2  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 146 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 146 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 160 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 160 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 160 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 157 aa  48.5  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6320  regulatory protein, MarR  36.47 
 
 		 187 aa  47.8  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2911  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 		 218 aa  48.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.233066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 170 aa  47.8  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1858  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.642234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  30.1 
 
 		 143 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  31.45 
 
 		 175 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  34.96 
 
 		 296 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 141 aa  45.4  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0281  regulatory protein MarR  30.13 
 
 		 187 aa  45.1  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0469  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 147 aa  44.7  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1172  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 156 aa  44.3  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0004084  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 167 aa  44.3  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  40.38 
 
 		 156 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 157 aa  44.3  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 157 aa  44.3  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  27.2 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  29.13 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  35.44 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2248  transcriptional regulator, TrmB  31.01 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  30.36 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  28.89 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0987  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 167 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4010  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 180 aa  42.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6080  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  34.67 
 
 		 319 aa  42.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.67 
 
 		 490 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1241  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 151 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 158 aa  42  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 146 aa  42.4  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 148 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  35.44 
 
 		 159 aa  42  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3545  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 161 aa  42  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359326  normal  0.253547 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  31.21 
 
 		 174 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 		 165 aa  41.6  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4320  MarR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 345 aa  41.6  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 151 aa  42  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 318 aa  41.6  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 153 aa  41.6  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 145 aa  41.6  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0803  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 213 aa  41.6  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 156 aa  41.2  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>