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for query gene PSPA7_0227 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0227  ECF subfamily RNA polymerase sigma-70 factor  100 
 
 
195 aa  384  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01840  RNA polymerase ECF-subfamily sigma-70 factor  96.69 
 
 
181 aa  344  4e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.729146 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10480  ECF sigma factor, FecI family  70.59 
 
 
194 aa  230  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.609538  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0929  sigma-24 (FecI)  69.94 
 
 
188 aa  223  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.309096  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4467  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  63.33 
 
 
194 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4608  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  64.53 
 
 
191 aa  215  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4590  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  65.14 
 
 
191 aa  214  8e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0856  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  70.97 
 
 
165 aa  207  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4275  sigma24, FecI  44.83 
 
 
165 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4119  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  44.83 
 
 
165 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2777  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  39.88 
 
 
171 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.933443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2633  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  37.2 
 
 
173 aa  97.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2303  fec I like protein  37.42 
 
 
166 aa  97.8  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.709829 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1629  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  38.56 
 
 
175 aa  97.1  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4216  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  37.01 
 
 
170 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1008  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  36.36 
 
 
170 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.719302  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1045  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.36 
 
 
170 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162254  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1007  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.36 
 
 
170 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4391  sigma-24 (FecI-like)  38.06 
 
 
166 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.934112  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19990  RNA polymerase ECF-subfamily sigma-70 factor  40.52 
 
 
171 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0223745  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1717  ECF subfamily RNA polymerase sigma-70 factor  39.61 
 
 
171 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1107  sigma-70 region 2  35.67 
 
 
187 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4377  sigma-24 (FecI)  33.55 
 
 
172 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316099  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2681  sigma-24 (FecI-like)  37.93 
 
 
179 aa  86.7  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4508  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.08 
 
 
173 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2648  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  37.58 
 
 
190 aa  85.5  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03870  RNA polymerase sigma factor, FecI family  34.39 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.943844  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1529  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  35.57 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.77026  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47400  RNA polymerase ECF-subfamily sigma-70 factor  35.29 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00498189  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3316  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  35.95 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00587435 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25290  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  33.12 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0699  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  39.1 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.390031  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0909  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.24 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0619138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1218  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  34.27 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1438  sigma-24 (FecI)  35.42 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0951  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  38.12 
 
 
218 aa  80.1  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.941158  normal  0.954881 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2598  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  37.65 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4091  ECF subfamily RNA polymerase sigma-70 factor  36.99 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4780  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.45 
 
 
194 aa  79  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6284  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  34.21 
 
 
227 aa  79  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1550  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  35.05 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.362931  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2918  putative extracytoplasmic function sigma factor (IRON-regulated) transcription regulator protein  35.26 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.611118 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4063  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  34.48 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.806814 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02747  putative RNA polymerase sigma-70 factor FecI  30.72 
 
 
210 aa  77.8  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4313  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.06 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.737925  normal  0.0110749 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1607  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  33.72 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.483087  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3786  sigma-24 (FecI)  34.18 
 
 
166 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1152  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  33.72 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0103149  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1606  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  34.27 
 
 
215 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000842587 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0895  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.26 
 
 
165 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.248298 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1632  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  33.72 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281996  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1150  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.32 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.188745  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0865  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  35.26 
 
 
161 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622636  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4778  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  33.72 
 
 
218 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310601  normal  0.199717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4981  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.05 
 
 
193 aa  77  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000475224 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2873  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.94 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.444727 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3701  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.94 
 
 
176 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.266091  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2075  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  41.13 
 
 
173 aa  77  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  35.22 
 
 
444 aa  75.9  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468182  normal  0.167582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3045  fec I like protein  34.97 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.688858  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1521  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  39.29 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0517  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  34.22 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2265  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.87 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33260  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  31.64 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268823  normal  0.037283 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0048  transcriptional regulator, LuxR family  36.71 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.426983  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4299  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.08 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2529  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.94 
 
 
202 aa  74.7  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3941  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  32.28 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.664668  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2618  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  37.57 
 
 
201 aa  74.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2774  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.33 
 
 
167 aa  73.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21550  ECF sigma factor, FecI family  34.31 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2428  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.87 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0553683  normal  0.487095 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2827  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  31.84 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1450  anti-FecI sigma factor, FecR  38.22 
 
 
440 aa  72.8  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1495  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.72 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.420653  normal  0.312522 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3324  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.23 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4715  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.28 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.722326  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3603  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.41 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.324027 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2133  RNA polymerase sigma-70 family protein  32.91 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1943  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  32.91 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.467339  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1858  RNA polymerase sigma factor  33.58 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.598111  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1286  RNA polymerase sigma-70 family protein  34.94 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4159  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  35.25 
 
 
168 aa  72  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4231  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.25 
 
 
168 aa  72  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4366  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.25 
 
 
168 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0243  putative RNA polymerase sigma-70 factor FecI  28.32 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1623  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  31.71 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710991  normal  0.111836 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1413  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  34.64 
 
 
169 aa  71.2  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.70955  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3796  sigma-24 (FecI)  34.48 
 
 
196 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0950269  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40940  RNA polymerase sigma factor, FecI family  33.8 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1203  RNA polymerase sigma-70 family protein  28.32 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4533  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.24 
 
 
170 aa  70.9  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36335 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3810  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  31.1 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.775772  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0704  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  34.78 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3563  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  31.1 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.661708  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2388  sigma-24 (FecI-like)  29.93 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0412661  hitchhiker  0.0000504088 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0737  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.06 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4479  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.23 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.768713 
 
 
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NC_010322  PputGB1_0738  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.86 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007912  Sde_1442  sigma-24 (FecI-like)  26.62 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.558792  normal 
 
 
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