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for query gene PSPTO_2133 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2133  RNA polymerase sigma-70 family protein  100 
 
 
178 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1943  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  97.19 
 
 
178 aa  361  3e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.467339  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3941  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  84.83 
 
 
184 aa  317  6e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.664668  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33260  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  83.82 
 
 
187 aa  310  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268823  normal  0.037283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2827  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  83.82 
 
 
187 aa  309  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3563  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  82.35 
 
 
176 aa  295  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.661708  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3810  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  79.55 
 
 
176 aa  295  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.775772  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4244  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  80.12 
 
 
176 aa  293  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.799752  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1623  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  81.18 
 
 
176 aa  292  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710991  normal  0.111836 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25660  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  69.68 
 
 
159 aa  234  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25290  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  55.7 
 
 
166 aa  176  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1839  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  45.58 
 
 
169 aa  122  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0342847  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4047  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  40.88 
 
 
244 aa  121  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.750975  normal  0.908185 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0517  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  42.58 
 
 
223 aa  120  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2873  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  39.63 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.444727 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1191  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  43.23 
 
 
207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2427  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  43.23 
 
 
237 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.773332  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1931  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  43.23 
 
 
237 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.385484  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0864  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  43.23 
 
 
237 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0195971  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0297  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  43.23 
 
 
237 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.330584  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1917  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  43.23 
 
 
237 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.693788  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2076  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  43.23 
 
 
237 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1634  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  43.23 
 
 
237 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0463569  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4063  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  41.94 
 
 
223 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.806814 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4778  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  38.75 
 
 
218 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310601  normal  0.199717 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1607  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  39.24 
 
 
222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.483087  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1632  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  39.24 
 
 
222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281996  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1152  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  39.24 
 
 
222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0103149  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1550  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  38.75 
 
 
222 aa  111  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.362931  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1529  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  38.75 
 
 
222 aa  111  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.77026  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2781  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  42.04 
 
 
260 aa  110  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.269223 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1606  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  37.97 
 
 
215 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000842587 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3323  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  37.82 
 
 
204 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130474 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2397  sigma-24 (FecI)  38.65 
 
 
179 aa  98.6  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.103635  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2777  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.67 
 
 
171 aa  96.7  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.933443 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3752  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  34.84 
 
 
181 aa  92.8  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401428  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0883  sigma-24 (FecI)  35.06 
 
 
171 aa  90.5  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3737  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.26 
 
 
177 aa  89.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.189895 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5732  sigma factor  34.52 
 
 
207 aa  87  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4804  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  35.03 
 
 
219 aa  85.9  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127624  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1828  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.49 
 
 
169 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.528128  normal  0.28254 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47400  RNA polymerase ECF-subfamily sigma-70 factor  31.85 
 
 
175 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00498189  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2681  sigma-24 (FecI-like)  34.72 
 
 
179 aa  82  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4091  ECF subfamily RNA polymerase sigma-70 factor  31.85 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0844  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.93 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.498181  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1340  fec I like protein  32.48 
 
 
186 aa  79  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06180  RNA polymerase sigma factor  34.62 
 
 
172 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281942  normal  0.0383866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0578  RNA polymerase sigma factor  34.62 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4850  RNA polymerase sigma factor  33.97 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0378  RNA polymerase sigma factor  33.97 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425912  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10480  ECF sigma factor, FecI family  32.72 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.609538  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0352  RNA polymerase sigma factor  33.97 
 
 
172 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4761  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.52 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3079  fec I like protein  34.67 
 
 
170 aa  77  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0380  RNA polymerase sigma factor  33.33 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30331  normal  0.23383 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0704  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  36.3 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1203  RNA polymerase sigma-70 family protein  31.25 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4479  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  37.32 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.768713 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1734  FecI like protein  37.4 
 
 
236 aa  74.3  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.112021 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0858  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.14 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0894  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  37.12 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.588251  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0909  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  30.57 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0619138 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01840  RNA polymerase ECF-subfamily sigma-70 factor  32.91 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.729146 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0227  ECF subfamily RNA polymerase sigma-70 factor  32.91 
 
 
195 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0865  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.57 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622636  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0895  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  30.57 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.248298 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4159  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.21 
 
 
168 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4231  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.21 
 
 
168 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4590  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.41 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3603  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.61 
 
 
173 aa  70.9  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.324027 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4608  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  28.99 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7286  sigma factor  30.08 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3315  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.8 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2883  fec I like protein  35.34 
 
 
172 aa  70.5  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.200402 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1438  sigma-24 (FecI)  33.75 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4366  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.27 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0667  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  30.71 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0929  sigma-24 (FecI)  33.12 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.309096  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4467  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  30.77 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0606  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.41 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4731  RNA polymerase sigma factor  32.69 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.907591 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4313  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.94 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.737925  normal  0.0110749 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3324  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.54 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0856  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.79 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03870  RNA polymerase sigma factor, FecI family  31.13 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.943844  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1978  sigma-24 (FecI-like)  32.28 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.912668  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0738  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.9 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  31.68 
 
 
374 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  31.68 
 
 
374 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1858  RNA polymerase sigma factor  32.7 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.598111  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4015  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  34.33 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.346038 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3959  sigma-70 family RNA polymerase sigma factor  32.24 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.925362  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0737  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.9 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0444  RNA polymerase sigma-70 family protein  32.69 
 
 
172 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_4194  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.41 
 
 
170 aa  67.4  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.746772  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_3786  sigma-24 (FecI)  32.16 
 
 
166 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.682097 
 
 
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NC_012560  Avin_44150  FecI-like iron uptake RNA polymerase sigma factor  35.04 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.155686  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_1816  anti-FecI sigma factor, FecR  31.45 
 
 
374 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256693  normal 
 
 
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NC_011071  Smal_3316  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.1 
 
 
166 aa  67  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.685716 
 
 
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NC_008463  PA14_46660  RNA polymerase ECF-subfamily sigma-70 factor  29.38 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00128883  hitchhiker  0.00000365459 
 
 
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