More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1287 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_13871  putative inner membrane protein translocase component YidC  96.32 
 
 
380 aa  744    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0838115  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13581  putative inner membrane protein translocase component YidC  91.58 
 
 
379 aa  713    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.13065  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13791  putative inner membrane protein translocase component YidC  96.05 
 
 
380 aa  744    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.429072  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1287  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 
380 aa  763    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.495694  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16601  putative inner membrane protein translocase component YidC  76.18 
 
 
382 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0685745  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0805  putative inner membrane protein translocase component YidC  76.44 
 
 
382 aa  609  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.792706  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1787  putative inner membrane protein translocase component YidC  72.11 
 
 
380 aa  586  1e-166  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.169669  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12731  putative inner membrane protein translocase component YidC  73.58 
 
 
383 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00483232 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06091  putative inner membrane protein translocase component YidC  71.84 
 
 
377 aa  565  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0577  putative inner membrane protein translocase component YidC  70.45 
 
 
376 aa  565  1e-160  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1617  putative inner membrane protein translocase component YidC  54.62 
 
 
392 aa  450  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.281889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0894  putative inner membrane protein translocase component YidC  53.4 
 
 
381 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4099  putative inner membrane protein translocase component YidC  53.28 
 
 
379 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4060  putative inner membrane protein translocase component YidC  53.28 
 
 
379 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0687  YidC/Oxa1 family lipolytic protein  52.49 
 
 
383 aa  417  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.852164  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3435  putative inner membrane protein translocase component YidC  51.71 
 
 
380 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98769  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4710  putative inner membrane protein translocase component YidC  52.48 
 
 
382 aa  410  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.620699  normal  0.652481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5265  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.59 
 
 
396 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.0483383 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.36 
 
 
544 aa  100  3e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  39.09 
 
 
553 aa  89.7  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  39.02 
 
 
268 aa  89.4  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.13 
 
 
526 aa  89.4  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  36.36 
 
 
225 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0136  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.68 
 
 
533 aa  88.2  2e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.170147  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  35.96 
 
 
628 aa  88.6  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2335  60 kDa inner membrane insertion protein  39.29 
 
 
584 aa  88.2  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.30148 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28520  preprotein translocase subunit YidC  38.53 
 
 
257 aa  87.8  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000336467  hitchhiker  0.00141204 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.67 
 
 
554 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.67 
 
 
554 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0522  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.53 
 
 
787 aa  87.4  4e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2561  60 kDa inner membrane insertion protein  39.29 
 
 
587 aa  86.7  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.02 
 
 
555 aa  86.3  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2030  Oxa1/60 kDa IMP family protein  33.63 
 
 
584 aa  86.3  8e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728079  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.89 
 
 
531 aa  86.3  8e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.84 
 
 
553 aa  86.3  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.45 
 
 
530 aa  86.3  9e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14180  preprotein translocase subunit YidC  39.22 
 
 
257 aa  85.9  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.19 
 
 
555 aa  85.9  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2921  60 kDa inner membrane insertion protein  37.5 
 
 
583 aa  85.5  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000870087  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2521  60 kDa inner membrane insertion protein  37.5 
 
 
583 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.39836  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2035  60 kDa inner membrane insertion protein  41.28 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.89 
 
 
607 aa  84.3  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3121  60 kDa inner membrane insertion protein  42.16 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000331776  hitchhiker  0.0000000745371 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  37.3 
 
 
548 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  39.47 
 
 
229 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08476  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.05 
 
 
622 aa  84.3  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0458  protein translocase subunit yidC  41.38 
 
 
592 aa  84  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.836766 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.61 
 
 
530 aa  83.6  0.000000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  38.1 
 
 
539 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0524  putative inner membrane protein translocase component YidC  35 
 
 
536 aa  83.6  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.89 
 
 
610 aa  83.6  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.61 
 
 
528 aa  83.6  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.44 
 
 
518 aa  83.6  0.000000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.89 
 
 
610 aa  83.2  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2014  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  39.25 
 
 
621 aa  83.2  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.121616  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  36.67 
 
 
341 aa  82.8  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  36.28 
 
 
557 aa  82.4  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  39.29 
 
 
547 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  37.61 
 
 
607 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  39.52 
 
 
557 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  36.07 
 
 
559 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0119  60 kDa inner membrane insertion protein  36.94 
 
 
209 aa  81.6  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2129  Oxa1/60 kDa IMP family protein  37.17 
 
 
585 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00488382  normal  0.707448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  37.4 
 
 
223 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1710  60 kDa inner membrane insertion protein  41.28 
 
 
699 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.895554  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2932  60 kDa inner membrane insertion protein  47.06 
 
 
213 aa  81.6  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000772095  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2396  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.2 
 
 
582 aa  81.3  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.74 
 
 
596 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23580  60 kDa inner membrane insertion protein  37.39 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00201404  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1196  60 kDa inner membrane insertion protein  39.81 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000975332  decreased coverage  0.000283466 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.05 
 
 
584 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2322  60 kDa inner membrane insertion protein  41.41 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.92 
 
 
543 aa  80.9  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.75 
 
 
517 aa  80.9  0.00000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2367  protein translocase subunit yidC  38.57 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000622766  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2740  protein translocase subunit yidC  37.5 
 
 
579 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.79 
 
 
567 aa  79.7  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2314  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.05 
 
 
565 aa  79.7  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.17 
 
 
578 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2224  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.05 
 
 
565 aa  79.3  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.176857  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  39.39 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.19 
 
 
554 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1917  60 kDa inner membrane insertion protein  36.99 
 
 
534 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0379054  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.07 
 
 
632 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.17 
 
 
578 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.93 
 
 
575 aa  79  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0217  protein translocase subunit yidC  36.52 
 
 
583 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498573  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.19 
 
 
552 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.25 
 
 
609 aa  79  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.59 
 
 
541 aa  79.3  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.19 
 
 
553 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.19 
 
 
554 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.13 
 
 
544 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.19 
 
 
552 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  38.52 
 
 
556 aa  79  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.36 
 
 
558 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.36 
 
 
558 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.61 
 
 
595 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.36 
 
 
557 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.67 
 
 
600 aa  78.2  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>