251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_60422 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_60422  Anaphase promoting complex, Cdc20, Cdh1, and Ama1 subunits  100 
 
 
606 aa  1255    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0258517  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00814  cell division cycle protein Cdc20, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14730)  47.04 
 
 
618 aa  357  3.9999999999999996e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04330  cell division control protein, putative  44.37 
 
 
525 aa  342  1e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81799  substrate-specific activator of APC-dependent proteolysis  41.76 
 
 
592 aa  291  3e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0740559  normal  0.327492 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02965  cell cycle regulatory protein (Srw1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08280)  40.22 
 
 
592 aa  281  3e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.76845 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31385  predicted protein  35.07 
 
 
462 aa  281  3e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000357166  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03780  conserved hypothetical protein  40.18 
 
 
695 aa  276  8e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12783  predicted protein  40.29 
 
 
363 aa  268  2.9999999999999995e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_2648  predicted protein  38.25 
 
 
326 aa  238  3e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13210  predicted protein  39.27 
 
 
230 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00422519 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_13512  predicted protein  39.27 
 
 
230 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0186669  hitchhiker  0.0060203 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57298  predicted protein  30.17 
 
 
457 aa  156  9e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  25.16 
 
 
1217 aa  93.2  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45416  predicted protein  26.21 
 
 
632 aa  92.4  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.710238  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  25 
 
 
1236 aa  87.8  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  27.59 
 
 
1652 aa  84.7  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.45 
 
 
1760 aa  84.3  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  26.74 
 
 
1163 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  26.42 
 
 
1363 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01982  cell cycle regulatory protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10570)  28.17 
 
 
818 aa  82  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0011982 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  28.06 
 
 
1443 aa  81.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  29.84 
 
 
1831 aa  79.7  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.08 
 
 
664 aa  79.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  27.36 
 
 
947 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.92 
 
 
608 aa  76.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  28.03 
 
 
696 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  24.3 
 
 
1211 aa  75.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  25.6 
 
 
1221 aa  75.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  23.35 
 
 
919 aa  74.7  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  31.35 
 
 
589 aa  74.7  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  25.5 
 
 
1411 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  24.83 
 
 
1247 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  31.07 
 
 
1858 aa  72.4  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.32 
 
 
698 aa  72  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.66 
 
 
1039 aa  72  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  25.68 
 
 
1196 aa  71.6  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  27.3 
 
 
1208 aa  71.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.36 
 
 
682 aa  71.2  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  24.48 
 
 
1878 aa  70.9  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  24.59 
 
 
1474 aa  70.5  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  23.88 
 
 
1399 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0987  Serine/threonine protein kinase-related protein  23.02 
 
 
842 aa  69.3  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466827  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  23.32 
 
 
742 aa  68.2  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  25.34 
 
 
1364 aa  67.8  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  21.33 
 
 
564 aa  67.8  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  23.89 
 
 
1348 aa  68.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.38 
 
 
792 aa  67.8  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.13 
 
 
636 aa  67.8  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.47 
 
 
1481 aa  67.8  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  24.34 
 
 
1357 aa  67.4  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3114  WD-40 repeat protein  25.35 
 
 
816 aa  67.4  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122668  normal  0.0357376 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  21.83 
 
 
574 aa  67  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  26.6 
 
 
344 aa  66.6  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  24.91 
 
 
405 aa  66.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  22.4 
 
 
1901 aa  66.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  22.02 
 
 
1229 aa  65.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  25.28 
 
 
1188 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.75 
 
 
740 aa  65.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00230  U5 snRNP-specific 40 kDa protein, putative  28.14 
 
 
374 aa  65.1  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.718611  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19210  predicted protein  56.25 
 
 
300 aa  65.5  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.103438  hitchhiker  0.00628492 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17898  predicted protein  56.25 
 
 
300 aa  65.5  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0208361 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  27.13 
 
 
1789 aa  65.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.15 
 
 
677 aa  65.1  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.77 
 
 
676 aa  65.1  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  23.21 
 
 
1553 aa  65.1  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  23.05 
 
 
1510 aa  65.1  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  25.25 
 
 
344 aa  64.7  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.95 
 
 
1262 aa  64.7  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  27.35 
 
 
790 aa  63.9  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.17 
 
 
682 aa  63.9  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  24.64 
 
 
1657 aa  63.9  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  22.98 
 
 
464 aa  63.9  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  27.22 
 
 
1484 aa  63.9  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  26.12 
 
 
434 aa  63.5  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  21.66 
 
 
924 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.54 
 
 
675 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  28.25 
 
 
443 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.64 
 
 
630 aa  63.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  23.18 
 
 
1041 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.43 
 
 
1599 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.27 
 
 
1240 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.47 
 
 
576 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  24.15 
 
 
1190 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  24.07 
 
 
316 aa  62  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.69 
 
 
930 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  24.8 
 
 
1193 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03926  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08380)  25.74 
 
 
522 aa  61.6  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413219  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  21.53 
 
 
1416 aa  61.6  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.73 
 
 
1868 aa  61.2  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  22.12 
 
 
342 aa  61.2  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  25.26 
 
 
608 aa  60.8  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01430  conserved hypothetical protein  23.4 
 
 
712 aa  60.8  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  23.59 
 
 
317 aa  60.5  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.15 
 
 
1557 aa  60.1  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  23.13 
 
 
1454 aa  60.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.04 
 
 
1583 aa  60.1  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07205  ribosome biogenesis protein (Rrb1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10320)  24.72 
 
 
492 aa  59.3  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.13 
 
 
1686 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  25.38 
 
 
578 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01130  ribosome biogenesis-related protein, putative  23.58 
 
 
489 aa  58.9  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0346843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>