64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_44111 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_44111  predicted protein  100 
 
 
597 aa  1214    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44112  predicted protein  45.76 
 
 
757 aa  479  1e-134  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44222  enhanced disease susceptibility 5-like protein  30.06 
 
 
564 aa  158  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28091  MOP(MATE) family transporter  29.1 
 
 
504 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0057098  normal  0.084674 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54598  predicted protein  26.46 
 
 
530 aa  89.7  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.954409  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49843  predicted protein  22.8 
 
 
675 aa  80.9  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  30.04 
 
 
492 aa  78.6  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31926  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  26.35 
 
 
461 aa  66.6  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  24.36 
 
 
449 aa  65.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  24.84 
 
 
451 aa  65.1  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  29.05 
 
 
448 aa  63.9  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  26.99 
 
 
453 aa  61.6  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  27.19 
 
 
462 aa  60.1  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  31.68 
 
 
436 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  28.91 
 
 
448 aa  57.4  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1233  Na+-driven multidrug efflux pump  30.73 
 
 
481 aa  56.6  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659218  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0729  MATE efflux family protein  37.12 
 
 
449 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1451  MATE efflux family protein  23.9 
 
 
465 aa  55.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.815185 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  25.17 
 
 
438 aa  55.1  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  23.85 
 
 
449 aa  54.7  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  24.34 
 
 
466 aa  53.9  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  25.19 
 
 
434 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  24.43 
 
 
455 aa  52.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  35.16 
 
 
457 aa  53.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  29.85 
 
 
461 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  26.18 
 
 
434 aa  52.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  28.98 
 
 
442 aa  51.6  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  27.02 
 
 
483 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2736  MATE efflux family protein  33.61 
 
 
452 aa  51.2  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  24.05 
 
 
450 aa  51.2  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  29.19 
 
 
441 aa  50.4  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  23.59 
 
 
442 aa  50.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  23.79 
 
 
446 aa  49.3  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  23.78 
 
 
434 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  30.36 
 
 
455 aa  49.3  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2085  MATE efflux family protein  29.82 
 
 
444 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0451278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2131  MATE efflux family protein  29.82 
 
 
444 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0258983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2068  MATE efflux family protein  29.82 
 
 
444 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163332  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  29.55 
 
 
441 aa  48.5  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  28.14 
 
 
468 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3961  MATE efflux family protein  24.54 
 
 
427 aa  48.1  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  24.77 
 
 
445 aa  48.1  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  32.31 
 
 
460 aa  47.4  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  34.34 
 
 
442 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  25.35 
 
 
446 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  31.58 
 
 
467 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  26.96 
 
 
453 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1922  MATE efflux family protein  25 
 
 
456 aa  45.8  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  28.35 
 
 
525 aa  45.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0025  MATE efflux family protein  24.69 
 
 
433 aa  45.8  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00700816  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  33.71 
 
 
460 aa  45.1  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  30.25 
 
 
471 aa  44.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2317  MATE efflux family protein  28.37 
 
 
442 aa  44.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.816192  normal  0.0947968 
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  26.15 
 
 
455 aa  44.3  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  24.3 
 
 
445 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  36.79 
 
 
486 aa  44.3  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  33.71 
 
 
460 aa  44.3  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0569  MATE efflux family protein  24.3 
 
 
445 aa  44.3  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163672  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  27.98 
 
 
446 aa  43.9  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  25.47 
 
 
454 aa  43.9  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0608  MATE efflux family protein  24.3 
 
 
445 aa  43.9  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  29.03 
 
 
467 aa  43.9  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  28.3 
 
 
450 aa  43.5  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  28.1 
 
 
453 aa  43.5  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>