54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50617 on replicon NC_011700
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011700  PHATRDRAFT_50616  predicted protein  85.12 
 
 
1015 aa  1393    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00719688  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50617  predicted protein  100 
 
 
859 aa  1780    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00889588  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  22.26 
 
 
1811 aa  118  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  25.34 
 
 
1908 aa  101  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  21.64 
 
 
1064 aa  96.3  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  21.57 
 
 
1112 aa  90.9  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  25.74 
 
 
2051 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  22.86 
 
 
1644 aa  85.5  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  24.11 
 
 
1934 aa  80.9  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.27 
 
 
1805 aa  75.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 
1942 aa  75.1  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50614  predicted protein  23.29 
 
 
1123 aa  74.7  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  22 
 
 
1739 aa  74.7  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  20.88 
 
 
1804 aa  74.3  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49156  predicted protein  26.05 
 
 
1086 aa  72.4  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.402458  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  21.45 
 
 
2017 aa  72.8  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  20.4 
 
 
1774 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  20.92 
 
 
1901 aa  70.1  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  21.56 
 
 
1780 aa  70.1  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  22.64 
 
 
1914 aa  69.3  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  20.57 
 
 
1794 aa  68.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50602  predicted protein  19.71 
 
 
1255 aa  67.8  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.94407  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  21.12 
 
 
1797 aa  64.3  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  20.37 
 
 
1805 aa  64.3  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  19.44 
 
 
2279 aa  63.9  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.34 
 
 
1822 aa  62.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  21.43 
 
 
1932 aa  63.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  20.69 
 
 
1795 aa  63.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  24.12 
 
 
2361 aa  63.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  22.77 
 
 
1922 aa  62.4  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  37.08 
 
 
1808 aa  61.6  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  22.05 
 
 
2272 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  20.54 
 
 
1885 aa  60.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  20.25 
 
 
1780 aa  60.1  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  28.26 
 
 
1871 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  22.87 
 
 
2077 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  22.4 
 
 
2109 aa  59.3  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 
1123 aa  58.5  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  21.32 
 
 
1833 aa  58.5  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  22.57 
 
 
1060 aa  58.2  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  23.84 
 
 
1850 aa  57.8  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.16 
 
 
1885 aa  56.6  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  20.48 
 
 
2303 aa  57  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  39.51 
 
 
1809 aa  55.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  38.67 
 
 
1668 aa  52.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  34.15 
 
 
1744 aa  52  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54547  protein kinase  20.95 
 
 
900 aa  51.6  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  38.67 
 
 
1663 aa  50.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  45.31 
 
 
1837 aa  50.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  24.48 
 
 
1022 aa  47  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  35.85 
 
 
670 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  40.24 
 
 
1845 aa  45.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  33.33 
 
 
1836 aa  44.3  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  23.21 
 
 
1788 aa  44.3  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>