112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49897 on replicon NC_011693
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  100 
 
 		 236 aa  486  1e-136  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  64.53 
 
 		 235 aa  315  6e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  59.83 
 
 		 252 aa  284  7e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  51.29 
 
 		 278 aa  253  2.0000000000000002e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  52.46 
 
 		 250 aa  246  2e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  40.87 
 
 		 249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  41.01 
 
 		 259 aa  159  5e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  37.66 
 
 		 249 aa  158  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  38.3 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  39.66 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  40.09 
 
 		 259 aa  155  6e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  37.55 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  38.6 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  39.17 
 
 		 259 aa  153  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  38.6 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  39.63 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  37.93 
 
 		 241 aa  151  7e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  37.23 
 
 		 289 aa  149  4e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  37.55 
 
 		 263 aa  149  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  36.16 
 
 		 258 aa  149  5e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  36.91 
 
 		 240 aa  148  7e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  35.22 
 
 		 239 aa  148  8e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  36.05 
 
 		 251 aa  148  8e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  37.5 
 
 		 271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  35.19 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  35.81 
 
 		 271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  33.91 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.220218 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  39.09 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  35.32 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  37.33 
 
 		 233 aa  144  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  36.09 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  35.22 
 
 		 241 aa  142  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  34.63 
 
 		 247 aa  141  9e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  35.19 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  37.07 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  34.48 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  35.34 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  35.06 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  34.4 
 
 		 256 aa  139  3e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  34.93 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  32.34 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  33.91 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  31.17 
 
 		 246 aa  131  9e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  34.07 
 
 		 270 aa  131  9e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  35.84 
 
 		 241 aa  131  9e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  35.22 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  36.87 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  35.78 
 
 		 250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  32.91 
 
 		 245 aa  129  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  33.33 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  35.55 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  35.02 
 
 		 298 aa  125  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0255334 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  32.22 
 
 		 247 aa  125  4.0000000000000003e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  33.17 
 
 		 231 aa  125  6e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  36.36 
 
 		 245 aa  125  6e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  32.24 
 
 		 254 aa  125  8.000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  33.76 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  39.38 
 
 		 246 aa  121  8e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  34.58 
 
 		 237 aa  121  8e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  30.3 
 
 		 268 aa  121  9e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  33.33 
 
 		 280 aa  117  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  34.69 
 
 		 256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  33.05 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  34.4 
 
 		 299 aa  108  6e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  31.38 
 
 		 269 aa  98.2  9e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  31.38 
 
 		 250 aa  98.2  9e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  31.19 
 
 		 259 aa  94.4  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  33.33 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  34.81 
 
 		 258 aa  91.7  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  29.22 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  29.38 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  29.52 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  28.22 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  26.57 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  27.45 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  26.29 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  27.45 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  25.62 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  27.78 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  26.04 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  24.87 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  28.49 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  28.64 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  26.98 
 
 		 203 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  27.32 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  28.24 
 
 		 237 aa  52.4  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  27.18 
 
 		 196 aa  51.2  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  28.82 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  24.61 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  27.72 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0723  20S proteasome A and B subunits  25.93 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0105986  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  24.88 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  28.08 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38885  predicted protein  28.47 
 
 		 242 aa  48.9  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  25.11 
 
 		 272 aa  48.9  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  25.4 
 
 		 243 aa  48.9  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  26.4 
 
 		 202 aa  48.5  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  23.67 
 
 		 219 aa  48.5  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  23.67 
 
 		 219 aa  48.5  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  27.49 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>