162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46565 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_46565  predicted protein  100 
 
 
1545 aa  3186    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400003  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46562  predicted protein  99.55 
 
 
1545 aa  3172    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.252798  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  37.95 
 
 
1092 aa  284  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3081  peptidase S41  36.29 
 
 
1094 aa  270  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00024555  hitchhiker  0.00566406 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1232  peptidase S41  36.49 
 
 
1094 aa  269  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000524055  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3315  peptidase S41  37.3 
 
 
1097 aa  269  4e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000987383 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2415  protease, putative  37.99 
 
 
1084 aa  268  5e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.779539  normal  0.819629 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1276  peptidase S41  36.29 
 
 
1094 aa  268  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000396794  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1339  peptidase S41  35.21 
 
 
1094 aa  268  7e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115783  normal  0.655881 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1309  peptidase S41  36.08 
 
 
1094 aa  266  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00413627  normal  0.677768 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2731  peptidase S41  36.32 
 
 
1094 aa  264  8.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  33.64 
 
 
1104 aa  264  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3411  protease, putative  35.98 
 
 
1094 aa  263  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1214  peptidase S41  35.05 
 
 
1093 aa  263  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126026  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1144  peptidase S41  35.98 
 
 
1093 aa  263  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00183878  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1143  peptidase S41  34.85 
 
 
1093 aa  262  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1080  peptidase S41  33.02 
 
 
1094 aa  257  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000759167  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1092  peptidase S41  29.08 
 
 
1104 aa  197  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.588085  normal  0.0332466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4892  peptidase S41  30.16 
 
 
1089 aa  196  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  28.59 
 
 
1079 aa  191  7e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  30.18 
 
 
1167 aa  181  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2799  peptidase S41  30.25 
 
 
1117 aa  180  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.38727  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4060  hypothetical protein  32.03 
 
 
1059 aa  172  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00663013  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  27.6 
 
 
1075 aa  172  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0668  peptidase S41  31.52 
 
 
1069 aa  164  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1766  peptidase S41  28.7 
 
 
1065 aa  163  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1608  peptidase S41  29.13 
 
 
1183 aa  162  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766197  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1602  peptidase S41  28.23 
 
 
1181 aa  160  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000100901 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26649  predicted protein  38.13 
 
 
1484 aa  160  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  28.15 
 
 
1016 aa  148  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7083  peptidase S41  28.15 
 
 
1147 aa  146  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194144  normal  0.204696 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30960  Tol biopolymer transport system, periplasmic component-related protein  27.91 
 
 
1186 aa  140  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1676  hypothetical protein  27.96 
 
 
1051 aa  135  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.665877 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2811  peptidase S41  27.92 
 
 
1008 aa  131  9.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.16663  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7084  peptidase S41  27.31 
 
 
1107 aa  124  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974034  normal  0.25867 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  27.4 
 
 
1193 aa  121  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  26 
 
 
1097 aa  120  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  26.56 
 
 
1067 aa  112  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  27.63 
 
 
1082 aa  107  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  25.77 
 
 
1125 aa  107  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33125  predicted protein  23.8 
 
 
1354 aa  103  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.517999  normal  0.0400566 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  24.32 
 
 
1090 aa  101  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  23.24 
 
 
1084 aa  99.8  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  23.01 
 
 
1076 aa  75.1  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  22.95 
 
 
428 aa  72.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  25.61 
 
 
483 aa  72.4  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  24.68 
 
 
418 aa  72  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  22.58 
 
 
425 aa  72  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  23.8 
 
 
465 aa  62.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  26.4 
 
 
377 aa  61.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  20.48 
 
 
447 aa  60.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  25.06 
 
 
428 aa  59.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4739  carboxyl-terminal protease  26.39 
 
 
395 aa  59.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  26.18 
 
 
453 aa  59.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  24.48 
 
 
444 aa  58.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  25.33 
 
 
484 aa  58.9  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  24.71 
 
 
431 aa  58.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  24.07 
 
 
427 aa  58.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1479  carboxyl-terminal protease  26.55 
 
 
449 aa  57.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  22.13 
 
 
472 aa  57.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  25.57 
 
 
383 aa  57.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  24.59 
 
 
432 aa  57.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  24.25 
 
 
389 aa  57  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  22.52 
 
 
427 aa  57  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  25.46 
 
 
423 aa  56.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  28.75 
 
 
444 aa  55.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  24.48 
 
 
444 aa  55.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  23.87 
 
 
505 aa  55.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  22.2 
 
 
427 aa  54.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  23.75 
 
 
379 aa  54.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  23.52 
 
 
407 aa  55.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07501  carboxyl-terminal processing protease  24.55 
 
 
433 aa  54.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07301  carboxyl-terminal processing protease  23.78 
 
 
444 aa  55.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1420  carboxyl-terminal protease  25.88 
 
 
440 aa  55.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  21.5 
 
 
430 aa  53.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  25 
 
 
457 aa  54.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0290  carboxyl-terminal protease  25.1 
 
 
488 aa  53.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  23.91 
 
 
507 aa  53.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  23.51 
 
 
401 aa  52.8  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0168  C-terminal processing peptidase  22.1 
 
 
564 aa  52.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0813  peptidase S41A, C-terminal protease  24.8 
 
 
551 aa  52.8  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.338188  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  26.95 
 
 
449 aa  52.4  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  23.34 
 
 
429 aa  52.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1022  peptidase S41A, C-terminal protease  24.11 
 
 
707 aa  52.4  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000400969  normal  0.0227897 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3539  peptidase S41  30.1 
 
 
298 aa  52.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0412069  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0408  carboxyl-terminal protease  23.91 
 
 
438 aa  52  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  21.27 
 
 
434 aa  52.4  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3700  carboxyl-terminal protease  23.1 
 
 
401 aa  51.2  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1304  C-terminal processing peptidase-1  23.51 
 
 
680 aa  51.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  24.44 
 
 
430 aa  51.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  23.26 
 
 
383 aa  51.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_308  carboxyl-terminal protease  23.68 
 
 
377 aa  51.2  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000103744  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2514  carboxyl-terminal protease  26.07 
 
 
506 aa  51.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  21.98 
 
 
428 aa  50.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  24.44 
 
 
430 aa  51.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  24.79 
 
 
402 aa  50.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  23.85 
 
 
482 aa  50.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  24.79 
 
 
402 aa  50.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  23.26 
 
 
446 aa  50.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1366  carboxyl-terminal protease  24.16 
 
 
687 aa  50.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>