More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0295 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0295  DNA processing protein DprA, putative  100 
 
 		 374 aa  755    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.332984 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  42.74 
 
 		 364 aa  306  6e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0995  DNA protecting protein DprA  39.84 
 
 		 366 aa  299  5e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  43.68 
 
 		 363 aa  298  9e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6935  DNA protecting protein DprA  42.36 
 
 		 378 aa  295  6e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.482636 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0214  DNA protecting protein DprA  41.6 
 
 		 372 aa  288  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000401852  normal  0.0161041 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1444  DNA processing protein  39.56 
 
 		 364 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2383  DNA protecting protein DprA  41.87 
 
 		 370 aa  269  5.9999999999999995e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1230  hypothetical protein  36.8 
 
 		 374 aa  266  5.999999999999999e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0232015 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03515  Smf protein DNA processing chain A  35.95 
 
 		 366 aa  263  3e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  38.11 
 
 		 364 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  37.89 
 
 		 386 aa  199  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  37.29 
 
 		 364 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  33.51 
 
 		 374 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 386 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 		 382 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  34.56 
 
 		 349 aa  195  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  41.72 
 
 		 320 aa  192  9e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  36.9 
 
 		 358 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  35.5 
 
 		 375 aa  191  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  37.13 
 
 		 401 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  32.8 
 
 		 370 aa  188  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  35.71 
 
 		 365 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  37.57 
 
 		 367 aa  187  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  36.9 
 
 		 372 aa  186  7e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  37.3 
 
 		 382 aa  185  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  36.36 
 
 		 408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  34.15 
 
 		 375 aa  184  3e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  36.51 
 
 		 371 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  38.13 
 
 		 385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  35.41 
 
 		 360 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  35.57 
 
 		 373 aa  181  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  36.07 
 
 		 374 aa  182  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  35.46 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  34.83 
 
 		 356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  35.88 
 
 		 336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  37.05 
 
 		 365 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  39.66 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  44.63 
 
 		 362 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  39.59 
 
 		 377 aa  177  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  34.4 
 
 		 406 aa  177  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  36.29 
 
 		 369 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  34.87 
 
 		 387 aa  177  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  33.6 
 
 		 361 aa  177  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  36.11 
 
 		 399 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  39.73 
 
 		 399 aa  177  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  33.61 
 
 		 379 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  28.61 
 
 		 360 aa  176  6e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  34.43 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  33.78 
 
 		 402 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  32.29 
 
 		 395 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  34.38 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1041  DNA protecting protein DprA  37.92 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.367593  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  36.67 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  32.38 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3862  DNA processing protein DprA, putative  33.5 
 
 		 409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3315  DNA protecting protein DprA  35.38 
 
 		 397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451996  normal  0.725027 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  36.44 
 
 		 379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  34.13 
 
 		 370 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  28.61 
 
 		 360 aa  173  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  36.67 
 
 		 394 aa  173  5.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  34.06 
 
 		 337 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  37.57 
 
 		 358 aa  172  6.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3313  DNA protecting protein DprA  38.78 
 
 		 391 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  34.9 
 
 		 382 aa  172  9e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3638  DNA protecting protein DprA  35.14 
 
 		 397 aa  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  33.43 
 
 		 359 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  40.27 
 
 		 364 aa  172  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  42.04 
 
 		 418 aa  172  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  38.71 
 
 		 405 aa  172  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  32.04 
 
 		 369 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  31.54 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  35.56 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  35.56 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  36.48 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  34.32 
 
 		 369 aa  170  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3307  DNA protecting protein DprA  32.79 
 
 		 374 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0474  DNA protecting protein DprA  35.27 
 
 		 403 aa  171  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652717  normal  0.262413 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  33.66 
 
 		 356 aa  170  4e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  29.81 
 
 		 362 aa  169  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  32.32 
 
 		 448 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  34.26 
 
 		 373 aa  169  8e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  32.42 
 
 		 359 aa  169  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  37 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  33.88 
 
 		 388 aa  169  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3515  DNA protecting protein DprA  33.91 
 
 		 397 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  35.71 
 
 		 365 aa  168  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  37.46 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0730  DNA protecting protein DprA  36.17 
 
 		 373 aa  167  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  33.52 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  36.06 
 
 		 748 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2010  SMF protein  34.29 
 
 		 372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  35.56 
 
 		 375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  35 
 
 		 372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  37.68 
 
 		 401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1766  SMF protein  42.04 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.273008 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  37 
 
 		 296 aa  167  4e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  32.16 
 
 		 389 aa  166  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  35.65 
 
 		 362 aa  166  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 		 386 aa  166  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>