140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1608 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  99.53 
 
 		 425 aa  859    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  100 
 
 		 425 aa  863    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  62.61 
 
 		 440 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  47.78 
 
 		 504 aa  331  2e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  45.33 
 
 		 508 aa  320  3e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  51.99 
 
 		 423 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  43.67 
 
 		 468 aa  298  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  48.67 
 
 		 375 aa  279  6e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  43.2 
 
 		 424 aa  267  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  45.51 
 
 		 442 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  35.15 
 
 		 388 aa  216  9e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  37.5 
 
 		 381 aa  200  3.9999999999999996e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  35.04 
 
 		 386 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  34.64 
 
 		 356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0697  putative beta-lactamase  32.05 
 
 		 357 aa  180  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15311  putative beta-lactamase  36.84 
 
 		 357 aa  176  8e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.709796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  27.5 
 
 		 576 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  32.66 
 
 		 353 aa  114  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  29.77 
 
 		 349 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  26.46 
 
 		 274 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  25.62 
 
 		 286 aa  90.1  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  28.51 
 
 		 295 aa  89.7  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  25.97 
 
 		 323 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  24.42 
 
 		 803 aa  87.8  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  26.05 
 
 		 291 aa  87.4  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  26.47 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  27.99 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  27.1 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0183  Beta-lactamase  25.91 
 
 		 306 aa  75.9  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1446  beta-lactamase related protein  24.9 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  26.67 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  32.92 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  28.04 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  28.04 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  30.4 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0725  Beta-lactamase class A-like protein  27.69 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.725916  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0228  twin-arginine translocation pathway signal  30.47 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  24 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  29.41 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.71 
 
 		 422 aa  66.2  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0351  beta-lactamase  27.89 
 
 		 296 aa  62  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.154712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  24.91 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  27.73 
 
 		 383 aa  62.4  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  27.78 
 
 		 271 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2552  Beta-lactamase  25.91 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802917  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  32.8 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03960  hypothetical protein  37.25 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0788  beta-lactamase  24.34 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2728  Beta-lactamase  31.22 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0079236  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  26.98 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4752  putative lipoprotein LpqF  38.1 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4838  putative lipoprotein LpqF  38.1 
 
 		 443 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5138  putative lipoprotein LpqF  38.1 
 
 		 443 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6642  putative beta-lactamase precursor protein  28.51 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33460  hypothetical protein  39.24 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0130  beta-lactamase TEM  27.24 
 
 		 286 aa  57  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1580  beta-lactamase TEM  27.24 
 
 		 286 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.262835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0046  beta-lactamase TEM  27.24 
 
 		 286 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00171312  normal  0.356541 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1529  Beta-lactamase  24.88 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2328  Beta-lactamase  24.88 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3317  beta-lactamase class A-like protein  35.25 
 
 		 429 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.313271  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4021  Beta-lactamase  26.75 
 
 		 296 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0978  Beta-lactamase  28.9 
 
 		 304 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  30.1 
 
 		 327 aa  55.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0446  Beta-lactamase  26.8 
 
 		 297 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5353  beta-lactamase  31.45 
 
 		 454 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1381  class A beta-lactamase  26.58 
 
 		 314 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0489957  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1855  Peptidoglycan-binding LysM  33.57 
 
 		 414 aa  53.5  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0679  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.21 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.877856  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2085  Beta-lactamase  26.34 
 
 		 296 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11921 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1301  class A beta-lactamase  27.03 
 
 		 314 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1541  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.94 
 
 		 265 aa  52.8  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0594  Beta-lactamase  27.81 
 
 		 296 aa  52.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.272363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1390  Beta-lactamase  26.51 
 
 		 289 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585114  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0855  Beta-lactamase  27.44 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689397  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1011  beta-lactamase  28.9 
 
 		 290 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2102  twin-arginine translocation pathway signal  26.79 
 
 		 296 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0733882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2148  Beta-lactamase  26.79 
 
 		 296 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748404  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2352  Beta-lactamase  26.07 
 
 		 297 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445844 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2553  beta-lactamase  26.58 
 
 		 309 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0174  Beta-lactamase  26.27 
 
 		 388 aa  51.6  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1000  putative beta-lactamase  34.44 
 
 		 390 aa  51.6  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0997  Beta-lactamase  27.23 
 
 		 304 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0257  class A beta-lactamase  26.58 
 
 		 314 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0527  class A beta-lactamase  26.58 
 
 		 314 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.29059  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1040  class A beta-lactamase  26.58 
 
 		 314 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.257126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7688  putative beta-lactamase  33.7 
 
 		 458 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1305  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.48 
 
 		 422 aa  50.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00907014  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1283  class A beta-lactamase  26.58 
 
 		 295 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.162345  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2215  beta-lactamase  26.92 
 
 		 290 aa  50.1  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296886  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0596  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.77 
 
 		 427 aa  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.108606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3723  Beta-lactamase class A-like  23.9 
 
 		 255 aa  49.7  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000939313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3441  Beta-lactamase class A-like protein  21.99 
 
 		 347 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2862  beta-lactamase  29.94 
 
 		 314 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0320845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3231  Beta-lactamase  30.91 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2257  hypothetical protein  25.65 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0272  penicillin-binding protein 6  28 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0746018  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3523  Beta-lactamase  23.08 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0636  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.77 
 
 		 427 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.317162 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0809  Beta-lactamase  29.38 
 
 		 315 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>