More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5186 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5186  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 600 aa  1215    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000148025 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0540  MscS Mechanosensitive ion channel  33.68 
 
 		 582 aa  276  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1803  MscS Mechanosensitive ion channel  32.35 
 
 		 595 aa  273  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  0.895337 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  33.27 
 
 		 538 aa  258  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  30.84 
 
 		 550 aa  256  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  31.72 
 
 		 537 aa  252  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  30.96 
 
 		 528 aa  244  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  30.96 
 
 		 528 aa  244  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  30.96 
 
 		 599 aa  241  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2274  MscS mechanosensitive ion channel  30.6 
 
 		 586 aa  240  5.999999999999999e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1226  MscS Mechanosensitive ion channel  30.16 
 
 		 569 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1197  MscS Mechanosensitive ion channel  30.09 
 
 		 569 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13451  putative mechanosensitive ion channel, MscS family protein  27.04 
 
 		 656 aa  177  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  36.91 
 
 		 350 aa  160  9e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1971  MscS Mechanosensitive ion channel  31.77 
 
 		 716 aa  150  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170847  normal  0.348628 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1790  MscS Mechanosensitive ion channel  31.77 
 
 		 716 aa  150  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.192721 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  33.75 
 
 		 394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  41.62 
 
 		 344 aa  145  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  33.78 
 
 		 454 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  31.42 
 
 		 356 aa  140  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  32.14 
 
 		 787 aa  140  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1456  mechanosensitive ion channel protein  33.19 
 
 		 455 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000389307  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1579  mechanosensitive ion channel family protein  35.47 
 
 		 455 aa  137  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.397271  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1324  MscS mechanosensitive ion channel  35.47 
 
 		 458 aa  137  8e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00452452  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11550  small-conductance mechanosensitive channel  28.12 
 
 		 316 aa  136  9e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4634  MscS Mechanosensitive ion channel  31.4 
 
 		 334 aa  136  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0333987  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  32.89 
 
 		 442 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  28.68 
 
 		 693 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1398  MscS Mechanosensitive ion channel  36.32 
 
 		 266 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 		 336 aa  134  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2401  MscS Mechanosensitive ion channel  32.23 
 
 		 718 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0124939 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  27.74 
 
 		 505 aa  131  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  31.84 
 
 		 335 aa  130  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  35.71 
 
 		 308 aa  128  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  34.72 
 
 		 568 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  32.75 
 
 		 372 aa  127  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3072  MscS mechanosensitive ion channel  31.86 
 
 		 773 aa  127  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.718015  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  32.71 
 
 		 342 aa  127  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  32.89 
 
 		 299 aa  125  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  31.96 
 
 		 719 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  29.37 
 
 		 342 aa  125  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  31.62 
 
 		 337 aa  125  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  32.11 
 
 		 321 aa  124  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4584  MscS mechanosensitive ion channel  32.76 
 
 		 697 aa  124  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.99351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  31.98 
 
 		 337 aa  124  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5772  MscS mechanosensitive ion channel  33.03 
 
 		 705 aa  123  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429261  normal  0.122613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3911  MscS mechanosensitive ion channel  34.58 
 
 		 367 aa  123  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  32.74 
 
 		 370 aa  123  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  31.67 
 
 		 294 aa  123  9e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5133  MscS Mechanosensitive ion channel  32 
 
 		 658 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538778  normal  0.147558 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0940  MscS Mechanosensitive ion channel  26.74 
 
 		 293 aa  122  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.285938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  32.14 
 
 		 299 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  30.29 
 
 		 718 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4049  MscS Mechanosensitive ion channel  32.65 
 
 		 650 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3536  MscS mechanosensitive ion channel  34.51 
 
 		 388 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  28.51 
 
 		 821 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  29.3 
 
 		 336 aa  120  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  31.96 
 
 		 876 aa  120  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  27.71 
 
 		 771 aa  120  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  29.04 
 
 		 879 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  34 
 
 		 767 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  29.57 
 
 		 283 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  32.57 
 
 		 325 aa  119  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  29.2 
 
 		 762 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  28.76 
 
 		 735 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2062  MscS mechanosensitive ion channel  29.37 
 
 		 747 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  30.4 
 
 		 289 aa  118  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  28.76 
 
 		 735 aa  118  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3228  MscS Mechanosensitive ion channel  31.54 
 
 		 704 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6137  hypothetical protein  28.7 
 
 		 725 aa  117  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.119326  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3278  MscS mechanosensitive ion channel  26.58 
 
 		 864 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0186  MscS Mechanosensitive ion channel  29.05 
 
 		 304 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  27.07 
 
 		 288 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1631  MscS mechanosensitive ion channel  27.95 
 
 		 414 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5420  MscS Mechanosensitive ion channel  27.43 
 
 		 889 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4680  MscS mechanosensitive ion channel  27.03 
 
 		 837 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3523  MscS Mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 703 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0609886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  27.03 
 
 		 822 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2980  mechanosensitive ion channel family protein  31.84 
 
 		 286 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  27.03 
 
 		 822 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  27.03 
 
 		 822 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1728  hypothetical protein  31.05 
 
 		 717 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784062  normal  0.0313644 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1320  MscS mechanosensitive ion channel  31.05 
 
 		 717 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3795  MscS mechanosensitive ion channel  29.49 
 
 		 313 aa  115  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.840492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3797  MscS mechanosensitive ion channel  26.13 
 
 		 871 aa  115  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198076  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3991  MscS mechanosensitive ion channel  31.05 
 
 		 715 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0693455  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1181  hypothetical protein  26.96 
 
 		 884 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.40697 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3687  MscS mechanosensitive ion channel  25.16 
 
 		 784 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276928  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2658  mechanosensitive ion channel family protein  31.7 
 
 		 286 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0115442  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 335 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  29.49 
 
 		 327 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5311  MscS mechanosensitive ion channel  26.91 
 
 		 858 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  29.49 
 
 		 327 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  27.46 
 
 		 753 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  29.49 
 
 		 327 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  27.34 
 
 		 773 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1627  MscS mechanosensitive ion channel  27.32 
 
 		 881 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1514  MscS mechanosensitive ion channel  29.6 
 
 		 836 aa  111  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.767095  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5033  MscS mechanosensitive ion channel  28.8 
 
 		 701 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  26.96 
 
 		 549 aa  109  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>