More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3692 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3692  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 551 aa  1147    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0535  alpha amylase catalytic region  56.47 
 
 		 554 aa  679    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4479  glycoside hydrolase family protein  75.77 
 
 		 552 aa  899    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0536  alpha amylase catalytic region  71.56 
 
 		 552 aa  857    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4273  alpha amylase catalytic region  68.73 
 
 		 543 aa  814    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1302  alpha amylase catalytic region  40.98 
 
 		 541 aa  410  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  36.28 
 
 		 560 aa  302  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2421  glycoside hydrolase family protein  28.79 
 
 		 593 aa  211  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0213  glycoside hydrolase family 13 domain protein  28.5 
 
 		 607 aa  196  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000901025  normal  0.0389775 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2113  alpha amylase, catalytic region  28.36 
 
 		 590 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0413  glycoside hydrolase family 13 domain protein  27.37 
 
 		 637 aa  171  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  26.52 
 
 		 990 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01554  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.24 
 
 		 623 aa  169  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1827  alpha amylase catalytic region  28.29 
 
 		 754 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2574  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.27 
 
 		 610 aa  157  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0923119  normal  0.935867 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3269  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.82 
 
 		 621 aa  155  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2349  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.34 
 
 		 614 aa  151  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.249555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0361  alpha amylase catalytic region  24.71 
 
 		 958 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1880  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.36 
 
 		 587 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4715  alpha amylase catalytic region  26.08 
 
 		 818 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717913 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1809  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.08 
 
 		 618 aa  147  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4621  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.63 
 
 		 608 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00732341 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1428  glycoside hydrolase family protein  24.15 
 
 		 606 aa  146  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2805  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.33 
 
 		 561 aa  146  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.244463  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5116  putative 1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.88 
 
 		 653 aa  146  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.203734 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5461  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.78 
 
 		 587 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1394  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.61 
 
 		 605 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3486  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.46 
 
 		 587 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1428  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.17 
 
 		 605 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0818981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2027  alpha amylase catalytic region  26.51 
 
 		 876 aa  141  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.748072  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5428  alpha amylase catalytic region  26.69 
 
 		 614 aa  140  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5166  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.56 
 
 		 594 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.155383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0117  glycogen branching enzyme  26.25 
 
 		 729 aa  137  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  25.74 
 
 		 850 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1417  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.74 
 
 		 629 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6209  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.92 
 
 		 621 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1127  glycoside hydrolase family 13 protein  24.58 
 
 		 648 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  25.74 
 
 		 852 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3467  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.07 
 
 		 612 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1347  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.19 
 
 		 593 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0359  alpha amylase, catalytic region  26.15 
 
 		 827 aa  134  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0267919  normal  0.617485 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  25.56 
 
 		 848 aa  134  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05045  putative alpha-amylase  36.51 
 
 		 937 aa  133  6.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.408257  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1207  alpha amylase catalytic region  28.31 
 
 		 745 aa  133  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1374  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  22.16 
 
 		 577 aa  133  9e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.816613  normal  0.363157 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2295  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.32 
 
 		 672 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219229  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1226  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.54 
 
 		 606 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014038 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  25.56 
 
 		 852 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4167  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.74 
 
 		 588 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.423754  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1541  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.49 
 
 		 634 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465785  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  25.37 
 
 		 852 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0818  maltooligosyl trehalose trehalohydrolase, putative  29.49 
 
 		 580 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  25.37 
 
 		 852 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1336  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  29.49 
 
 		 580 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.844442  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0617  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  29.49 
 
 		 580 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.357584  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0538  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  29.49 
 
 		 580 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79822  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2358  isoamylase family protein  27.7 
 
 		 630 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330198  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1886  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.43 
 
 		 621 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6084  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.51 
 
 		 623 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800563  normal  0.517513 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1403  alpha amylase, catalytic region  24.46 
 
 		 625 aa  130  6e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  25.23 
 
 		 852 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0342  alpha amylase all-beta  25.42 
 
 		 854 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1464  glycogen branching enzyme  25.44 
 
 		 716 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5397  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.6 
 
 		 596 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334686  hitchhiker  0.00587548 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1334  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.02 
 
 		 623 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0628361  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6495  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.02 
 
 		 623 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0784171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2539  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.16 
 
 		 626 aa  127  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000367182 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2092  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.91 
 
 		 592 aa  127  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1265  glycogen branching enzyme  26.03 
 
 		 642 aa  127  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24267  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1781  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.21 
 
 		 592 aa  127  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  25.05 
 
 		 848 aa  127  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  25.68 
 
 		 755 aa  126  9e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2548  Alpha amylase, catalytic region  26.58 
 
 		 600 aa  126  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.43 
 
 		 785 aa  126  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01252  glycogen branching enzyme  26.45 
 
 		 730 aa  126  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.369495  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1173  alpha amylase domain-containing protein  26.29 
 
 		 592 aa  125  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  25.23 
 
 		 856 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24900  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.71 
 
 		 601 aa  125  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.355935  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  27 
 
 		 713 aa  125  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  24.86 
 
 		 852 aa  125  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001105  1,4-alpha-glucan (glycogen) branching enzyme  24.04 
 
 		 748 aa  124  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  24.4 
 
 		 784 aa  125  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3680  glycogen branching enzyme  24.92 
 
 		 716 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  25.51 
 
 		 755 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3935  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.69 
 
 		 613 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0534162  normal  0.77528 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4048  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.69 
 
 		 613 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  24.4 
 
 		 784 aa  124  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0036  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.09 
 
 		 635 aa  124  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2364  glycogen branching enzyme  25.82 
 
 		 771 aa  124  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.056819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4165  glycogen branching enzyme  24.38 
 
 		 716 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5112  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.55 
 
 		 630 aa  124  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  23.83 
 
 		 770 aa  123  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1735  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.91 
 
 		 634 aa  123  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1280  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.06 
 
 		 599 aa  124  7e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1564  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.91 
 
 		 634 aa  123  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0166062  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1408  alpha amylase, catalytic region  30.53 
 
 		 957 aa  123  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04851  glycogen branching enzyme  23.77 
 
 		 742 aa  123  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1207  glycogen branching enzyme  25.39 
 
 		 716 aa  123  8e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0919  glycogen branching enzyme  26.02 
 
 		 764 aa  123  8e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144042  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  26.71 
 
 		 740 aa  123  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>