More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1411 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_1411  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  100 
 
 
892 aa  1842    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1720  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  45.12 
 
 
885 aa  727    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95463  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1814  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  92.15 
 
 
892 aa  1716    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4086  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  51.15 
 
 
783 aa  791    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20010  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  45.68 
 
 
891 aa  737    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0486368  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3894  TonB-dependent heme receptor HasR  51.15 
 
 
830 aa  791    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0130  TonB-dependent heme receptor HasR  51.02 
 
 
830 aa  790    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1935  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.32 
 
 
722 aa  214  5.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3446  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.27 
 
 
717 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494808  decreased coverage  0.00031135 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5620  putative extracellular heme-binding protein  24.39 
 
 
930 aa  191  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253718  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4591  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.07 
 
 
743 aa  188  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880102  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64710  putative extracellular heme-binding protein  23.86 
 
 
989 aa  187  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.572363  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2415  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.9 
 
 
779 aa  187  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3623  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.27 
 
 
669 aa  184  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2354  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  25.73 
 
 
778 aa  184  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548378  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.67 
 
 
734 aa  183  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0162  TonB-dependent iron siderophore receptor  25.77 
 
 
778 aa  179  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2303  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 
982 aa  178  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243733  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.27 
 
 
1186 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1973  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  27.2 
 
 
783 aa  169  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41369  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3314  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 
973 aa  163  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1440  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.64 
 
 
685 aa  152  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0111178  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.16 
 
 
661 aa  145  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.93 
 
 
696 aa  142  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.3 
 
 
696 aa  140  7e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  26.68 
 
 
660 aa  139  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  27.21 
 
 
660 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2389  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 
823 aa  135  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.687523  normal  0.211986 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.5 
 
 
695 aa  135  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.61 
 
 
696 aa  134  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.95 
 
 
676 aa  132  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.63 
 
 
696 aa  132  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2169  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.48 
 
 
694 aa  129  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108589 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0115  tonB-dependent receptor  23.95 
 
 
753 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.46 
 
 
696 aa  128  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3189  TonB-dependent receptor  22.72 
 
 
728 aa  126  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  23.58 
 
 
697 aa  125  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3466  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 
747 aa  124  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.5 
 
 
688 aa  124  9e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3889  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.27 
 
 
676 aa  124  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000356309  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3801  TonB-dependent hemin receptor HmuR  26.27 
 
 
676 aa  124  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0122148  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  22.98 
 
 
690 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0650  hemin receptor precursor  26.27 
 
 
676 aa  123  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.332086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.32 
 
 
861 aa  120  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.24 
 
 
859 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  23.83 
 
 
857 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.87 
 
 
681 aa  118  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0171  TonB-dependent colicin receptor protein, putative  23.63 
 
 
755 aa  116  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.38 
 
 
867 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.76 
 
 
862 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1017  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.49 
 
 
704 aa  109  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0112436  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4301  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 
1018 aa  108  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.15211 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4195  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.28 
 
 
849 aa  108  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.58 
 
 
862 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1523  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 
1045 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2679  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 
1054 aa  101  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47380  putative heme utilization protein precursor  22.86 
 
 
851 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0440985  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1051  TonB-dependent outer membrane receptor  24.88 
 
 
757 aa  99.8  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2186  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 
1040 aa  99.8  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.996858  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4089  putative heme utilization protein precursor  22.85 
 
 
851 aa  99  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1912  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.14 
 
 
697 aa  97.4  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0672  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.28 
 
 
694 aa  95.1  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41127  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0566  heme receptor HasR  23.57 
 
 
784 aa  94.7  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.72 
 
 
862 aa  92  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1519  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.68 
 
 
677 aa  92  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3124  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 
791 aa  83.6  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  31.42 
 
 
807 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1239  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.28 
 
 
646 aa  80.1  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  21.74 
 
 
764 aa  77.8  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  25.51 
 
 
815 aa  77.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0796  TonB-dependent receptor  22.72 
 
 
649 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0550386  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  21.92 
 
 
759 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  32 
 
 
821 aa  73.9  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  21.71 
 
 
764 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  26.71 
 
 
812 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  28.62 
 
 
817 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  26.25 
 
 
778 aa  73.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  27.94 
 
 
809 aa  72.4  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  27.54 
 
 
809 aa  72.4  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2132  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  20.53 
 
 
689 aa  71.2  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100193  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  27.54 
 
 
809 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 
809 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  30.26 
 
 
863 aa  70.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0855  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.1 
 
 
714 aa  69.7  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.842782 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0435  heavy metal transport/detoxification protein  23.24 
 
 
668 aa  68.6  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.46 
 
 
750 aa  68.2  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4201  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.48 
 
 
686 aa  68.2  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.325691  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  27.73 
 
 
782 aa  67.8  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 
778 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  24.75 
 
 
824 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  27.57 
 
 
784 aa  67.4  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  24.58 
 
 
828 aa  67  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3030  putaive Fe-regulated protein B precursor  29.15 
 
 
693 aa  65.9  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000310305  hitchhiker  0.000241006 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2296  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  21.24 
 
 
734 aa  65.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.234344 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0181  TonB-dependent outer membrane receptor  23.28 
 
 
915 aa  65.9  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  24.58 
 
 
775 aa  65.1  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1603  TonB-dependent receptor, plug  28 
 
 
771 aa  65.1  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0535477  unclonable  0.000000514373 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  27.51 
 
 
782 aa  65.1  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  24.15 
 
 
828 aa  65.1  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  22.6 
 
 
822 aa  64.7  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>