More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_27420 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  100 
 
 		 354 aa  702    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  95.76 
 
 		 352 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  60.12 
 
 		 356 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  60.06 
 
 		 353 aa  361  9e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  60.88 
 
 		 367 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  60.47 
 
 		 367 aa  349  3e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  61.18 
 
 		 353 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  55.94 
 
 		 358 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  55.14 
 
 		 358 aa  341  1e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  60.46 
 
 		 360 aa  329  5.0000000000000004e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  52.28 
 
 		 358 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  49.41 
 
 		 358 aa  323  2e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  55.32 
 
 		 358 aa  322  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  55.56 
 
 		 383 aa  322  6e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46390  secretion protein  62.42 
 
 		 354 aa  321  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4999  secretion protein HlyD family protein  56.73 
 
 		 358 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399677  normal  0.336423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1696  secretion protein HlyD family protein  54.41 
 
 		 358 aa  315  8e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  51.34 
 
 		 413 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  55.18 
 
 		 342 aa  311  7.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  53.53 
 
 		 385 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  46.51 
 
 		 349 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  51.93 
 
 		 396 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  53.71 
 
 		 394 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  52.49 
 
 		 394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  46.76 
 
 		 380 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  46.76 
 
 		 375 aa  278  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  48.51 
 
 		 344 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  44.84 
 
 		 380 aa  276  3e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  44.21 
 
 		 392 aa  266  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  47.58 
 
 		 373 aa  266  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1819  secretion protein HlyD family protein  47.54 
 
 		 383 aa  262  6e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  45.59 
 
 		 390 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2921  secretion protein HlyD family protein  47.32 
 
 		 344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  42.68 
 
 		 414 aa  250  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  39.6 
 
 		 364 aa  250  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  44.25 
 
 		 372 aa  246  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  42.42 
 
 		 393 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  43.13 
 
 		 390 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  44.24 
 
 		 378 aa  243  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  47.76 
 
 		 377 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  39.52 
 
 		 404 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  43.7 
 
 		 373 aa  232  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  38.53 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  37.28 
 
 		 352 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  43.99 
 
 		 372 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  36.99 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  45.75 
 
 		 363 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  39.88 
 
 		 366 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  36.99 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  36.99 
 
 		 352 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  36.09 
 
 		 352 aa  226  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  40.48 
 
 		 375 aa  226  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  38.76 
 
 		 411 aa  223  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  40.88 
 
 		 365 aa  223  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  43.25 
 
 		 344 aa  223  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  45.81 
 
 		 374 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  45.81 
 
 		 374 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  37.28 
 
 		 351 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  45.81 
 
 		 374 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  42.44 
 
 		 350 aa  222  6e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  37.28 
 
 		 351 aa  222  7e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  41.56 
 
 		 390 aa  222  8e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  45.34 
 
 		 371 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  39.59 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  39.34 
 
 		 413 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  43.2 
 
 		 373 aa  220  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0207  secretion protein HlyD  44.28 
 
 		 371 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  37.28 
 
 		 351 aa  220  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  41.64 
 
 		 363 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  37.98 
 
 		 351 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  40.97 
 
 		 393 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  40.3 
 
 		 355 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  45.23 
 
 		 372 aa  216  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  40.42 
 
 		 354 aa  216  7e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  40 
 
 		 344 aa  216  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  41.32 
 
 		 363 aa  215  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  42.16 
 
 		 346 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  40.94 
 
 		 402 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  40.06 
 
 		 348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  43.06 
 
 		 381 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  36.39 
 
 		 352 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  36.01 
 
 		 351 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48280  putative multidrug resistance efflux pump  46.6 
 
 		 383 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0160418  normal  0.0591644 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  40.18 
 
 		 374 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  37.65 
 
 		 387 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  34.5 
 
 		 368 aa  211  1e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  42.5 
 
 		 381 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  41.61 
 
 		 364 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  41.61 
 
 		 364 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  41.61 
 
 		 364 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  37.65 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  39.94 
 
 		 411 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  41.01 
 
 		 363 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  39.09 
 
 		 355 aa  210  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  42.17 
 
 		 400 aa  209  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  40.89 
 
 		 349 aa  209  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  40.69 
 
 		 364 aa  209  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  40.82 
 
 		 397 aa  208  9e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0859  secretion protein HlyD family protein  41.84 
 
 		 358 aa  208  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  40.94 
 
 		 401 aa  207  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>