261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_17191 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  100 
 
 
396 aa  777    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  47.95 
 
 
440 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  44.39 
 
 
435 aa  261  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  36.55 
 
 
436 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  39.85 
 
 
421 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  37.95 
 
 
413 aa  227  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  45.43 
 
 
393 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  35.34 
 
 
400 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1460  sodium/hydrogen exchanger  38.96 
 
 
430 aa  199  6e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261039 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0416  sodium/hydrogen exchanger  36.84 
 
 
406 aa  183  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  30.98 
 
 
403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  32.66 
 
 
400 aa  157  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  32.01 
 
 
415 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4547  sodium/hydrogen exchanger  30.41 
 
 
410 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4634  sodium/hydrogen exchanger  30.41 
 
 
410 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4930  sodium/hydrogen exchanger  30.41 
 
 
410 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  34.05 
 
 
412 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  32.35 
 
 
460 aa  138  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  31.71 
 
 
408 aa  133  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4701  sodium/hydrogen exchanger  30.83 
 
 
408 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3078  Na(+)/H(+) antiporter  38.31 
 
 
173 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00966198  normal  0.34465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  32.11 
 
 
393 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  27.68 
 
 
420 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  26.25 
 
 
432 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  27.46 
 
 
413 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  26.42 
 
 
415 aa  99.8  7e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  25.97 
 
 
415 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  21.52 
 
 
478 aa  89  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  26.93 
 
 
418 aa  87.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  26.36 
 
 
413 aa  87  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  26.28 
 
 
429 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  27.86 
 
 
486 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  25.45 
 
 
419 aa  83.6  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  26.59 
 
 
429 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  26.92 
 
 
413 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  26.92 
 
 
413 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  26.07 
 
 
449 aa  81.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  27.75 
 
 
483 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  25.68 
 
 
453 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  24.69 
 
 
410 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  22.56 
 
 
481 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  24.8 
 
 
597 aa  78.6  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  27.93 
 
 
424 aa  76.6  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  27.68 
 
 
491 aa  76.6  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  26.85 
 
 
408 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  26.09 
 
 
608 aa  75.5  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0160  potassium/proton antiporter  28.67 
 
 
498 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  23.2 
 
 
576 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.33 
 
 
598 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  25.85 
 
 
496 aa  73.9  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  26.67 
 
 
444 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  22.75 
 
 
626 aa  73.9  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  27 
 
 
580 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  25.52 
 
 
597 aa  73.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  31.16 
 
 
505 aa  73.2  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  25.24 
 
 
442 aa  72.8  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  24.71 
 
 
616 aa  72  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  23.2 
 
 
477 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  23.68 
 
 
406 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0746  potassium/proton antiporter  28.31 
 
 
498 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  24.68 
 
 
414 aa  70.9  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  28.07 
 
 
464 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  27.6 
 
 
597 aa  70.1  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  25 
 
 
581 aa  70.1  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0650  sodium/hydrogen exchanger  25.33 
 
 
492 aa  69.7  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.939557  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  25.13 
 
 
497 aa  69.7  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  27.53 
 
 
424 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0611  sodium/hydrogen exchanger  23.71 
 
 
531 aa  68.9  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00744487  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5941  sodium/hydrogen exchanger  26.36 
 
 
418 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111352  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  25.36 
 
 
423 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  25.99 
 
 
580 aa  67.8  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2477  sodium/hydrogen exchanger  24.05 
 
 
457 aa  67.4  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  20.33 
 
 
612 aa  67  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5829  sodium/hydrogen exchanger  25.69 
 
 
593 aa  67  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626917  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  27.08 
 
 
596 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3823  sodium/hydrogen exchanger  26.65 
 
 
417 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2399  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 
530 aa  67  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00231654 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  25.78 
 
 
581 aa  67  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  26.84 
 
 
448 aa  66.2  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.01 
 
 
448 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1079  potassium/proton antiporter  25.98 
 
 
610 aa  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  24.65 
 
 
485 aa  65.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1985  sodium/hydrogen exchanger  25.37 
 
 
406 aa  65.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5869  sodium/hydrogen exchanger  26.01 
 
 
418 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360041  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  30.05 
 
 
420 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  27.27 
 
 
441 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  23.14 
 
 
445 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3190  sodium/hydrogen exchanger  27.06 
 
 
498 aa  64.3  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  27.06 
 
 
451 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1109  sodium/hydrogen exchanger  24.93 
 
 
402 aa  63.5  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  26.89 
 
 
598 aa  62.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3583  sodium/hydrogen exchanger  23.71 
 
 
402 aa  62.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3692  potassium/proton antiporter  25.65 
 
 
500 aa  62.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000164721  normal  0.675965 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  28.03 
 
 
419 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  22.25 
 
 
498 aa  62  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0112  sodium/hydrogen exchanger  23.76 
 
 
527 aa  61.6  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2361  potassium/proton antiporter  24.22 
 
 
577 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325914  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0122  sodium/hydrogen exchanger  24.62 
 
 
570 aa  61.6  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1999  potassium/proton antiporter  23.37 
 
 
577 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.861236  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  32.53 
 
 
443 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>