More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_00001 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  100 
 
 		 388 aa  777    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  76.03 
 
 		 385 aa  600  1e-170  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  76.55 
 
 		 385 aa  595  1e-169  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  66.49 
 
 		 397 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00001  DNA polymerase III subunit beta  62.63 
 
 		 386 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1328  DNA polymerase III subunit beta  62.11 
 
 		 386 aa  508  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  51.79 
 
 		 385 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  51.79 
 
 		 385 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  51.8 
 
 		 385 aa  441  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  52.31 
 
 		 385 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  56.7 
 
 		 390 aa  427  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  51.89 
 
 		 387 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  51.27 
 
 		 382 aa  389  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  49.87 
 
 		 393 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  49.87 
 
 		 393 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  48.48 
 
 		 394 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  46.29 
 
 		 374 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0075  DNA polymerase III beta subunit family protein  34.1 
 
 		 444 aa  223  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.912734 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  33.5 
 
 		 376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  32.66 
 
 		 378 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  32.75 
 
 		 378 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  32.75 
 
 		 378 aa  212  7.999999999999999e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5506  DNA polymerase III, beta subunit  30.71 
 
 		 479 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399861 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  32.64 
 
 		 366 aa  201  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.39 
 
 		 365 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.38 
 
 		 369 aa  192  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.27 
 
 		 375 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  28.87 
 
 		 366 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.44 
 
 		 380 aa  187  3e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  33.08 
 
 		 367 aa  186  8e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.7 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.35 
 
 		 366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.35 
 
 		 366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.44 
 
 		 370 aa  180  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  28.79 
 
 		 374 aa  180  4.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  30.63 
 
 		 377 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.68 
 
 		 367 aa  179  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0008  DNA polymerase III, beta subunit  47.83 
 
 		 200 aa  178  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.28 
 
 		 370 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.26 
 
 		 372 aa  176  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0730917  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.69 
 
 		 375 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.18 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.43 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.74 
 
 		 372 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  30.2 
 
 		 378 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  28.84 
 
 		 376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.49 
 
 		 372 aa  173  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.26 
 
 		 372 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  28.65 
 
 		 377 aa  172  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1513  DNA polymerase III, beta subunit  30.05 
 
 		 381 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000166783  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.23 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  29.92 
 
 		 372 aa  170  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.68 
 
 		 370 aa  171  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  30.28 
 
 		 377 aa  170  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  29.46 
 
 		 367 aa  170  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.72 
 
 		 374 aa  168  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3047  DNA polymerase III subunit beta  30.87 
 
 		 371 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.579013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0351  DNA polymerase III subunit beta  29.92 
 
 		 412 aa  167  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.75 
 
 		 367 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.9 
 
 		 397 aa  166  5e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00789927  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0002  DNA polymerase III subunit beta  28.9 
 
 		 397 aa  166  9e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41342  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.97 
 
 		 372 aa  166  9e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.474691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.26 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.67 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000275643  normal  0.722211 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.41 
 
 		 372 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.142435  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.9 
 
 		 374 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1278  DNA polymerase III subunit beta  30.18 
 
 		 373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  unclonable  2.76035e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9328  DNA-directed DNA polymerase  30.41 
 
 		 365 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.28 
 
 		 377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.28 
 
 		 377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0003  DNA polymerase III, beta subunit  26.87 
 
 		 369 aa  163  6e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000352181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.51 
 
 		 372 aa  162  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  28.76 
 
 		 365 aa  162  9e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3374  DNA polymerase III subunit beta  28.24 
 
 		 372 aa  162  9e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.56 
 
 		 373 aa  162  9e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0861969  hitchhiker  0.000000929484 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  26.13 
 
 		 376 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  0.0000491978 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0004  DNA polymerase III subunit beta  28.83 
 
 		 385 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.638398  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2720  DNA polymerase III, beta subunit  28.43 
 
 		 372 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0003  DNA polymerase III, beta subunit  30.15 
 
 		 396 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.95 
 
 		 373 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0152  DNA polymerase III subunit beta  28.64 
 
 		 372 aa  161  2e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  26.13 
 
 		 376 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.53 
 
 		 367 aa  160  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000348538  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.93 
 
 		 381 aa  159  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0708  DNA polymerase III subunit beta  28.93 
 
 		 371 aa  159  8e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.147601  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.39 
 
 		 373 aa  158  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0003  DNA polymerase III subunit beta  28.9 
 
 		 373 aa  159  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.920378 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0003  DNA polymerase III subunit beta  28.57 
 
 		 373 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  0.512948 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.79 
 
 		 372 aa  158  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.24 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3705  DNA polymerase III subunit beta  29.41 
 
 		 372 aa  157  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0432616 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  28.43 
 
 		 381 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  28.43 
 
 		 381 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0086  DNA polymerase III subunit beta  30.5 
 
 		 379 aa  157  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.35 
 
 		 378 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4592  DNA polymerase III subunit beta  28.97 
 
 		 372 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0352599 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3235  DNA polymerase III, beta subunit  27.04 
 
 		 374 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0867918 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.74 
 
 		 378 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0259305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.66 
 
 		 398 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298765  normal  0.252015 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.92 
 
 		 371 aa  156  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000194465  normal  0.0534413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>