More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_02071 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_02071  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 455 aa  915    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.828373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1556  tRNA modification GTPase TrmE  58.62 
 
 		 464 aa  564  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  61.93 
 
 		 450 aa  561  1.0000000000000001e-159  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02641  tRNA modification GTPase TrmE  58.19 
 
 		 464 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2136  tRNA modification GTPase TrmE  59.63 
 
 		 451 aa  555  1e-157  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27541  tRNA modification GTPase TrmE  61.35 
 
 		 465 aa  552  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  49.56 
 
 		 463 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  48.29 
 
 		 464 aa  442  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  49.12 
 
 		 460 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  48.68 
 
 		 460 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  47.36 
 
 		 458 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02181  tRNA modification GTPase TrmE  44.84 
 
 		 461 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02071  tRNA modification GTPase TrmE  46.09 
 
 		 460 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.214831  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02091  tRNA modification GTPase TrmE  45.87 
 
 		 460 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.146144  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  49.34 
 
 		 462 aa  414  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0191  tRNA modification GTPase TrmE  45.87 
 
 		 460 aa  405  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.377202  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  46.25 
 
 		 467 aa  404  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  47.48 
 
 		 460 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  41.59 
 
 		 461 aa  323  5e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  39.43 
 
 		 458 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  38.2 
 
 		 463 aa  320  3.9999999999999996e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  39.87 
 
 		 458 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  39.45 
 
 		 462 aa  318  1e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  39.65 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  39.43 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  39.87 
 
 		 458 aa  316  6e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  39.65 
 
 		 458 aa  316  6e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  39.43 
 
 		 458 aa  315  9e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  39.43 
 
 		 458 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  39.43 
 
 		 458 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  39.43 
 
 		 458 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  39.43 
 
 		 458 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  38.83 
 
 		 458 aa  314  2.9999999999999996e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  40.09 
 
 		 455 aa  311  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  38.31 
 
 		 461 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  40.09 
 
 		 455 aa  307  2.0000000000000002e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  39.91 
 
 		 460 aa  306  6e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  39.96 
 
 		 454 aa  305  7e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49818  predicted protein  41.43 
 
 		 525 aa  306  7e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  39.48 
 
 		 460 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  37.86 
 
 		 461 aa  303  4.0000000000000003e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  38.01 
 
 		 461 aa  302  9e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  38.76 
 
 		 461 aa  301  1e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  38.06 
 
 		 459 aa  298  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  38.29 
 
 		 455 aa  297  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  38.74 
 
 		 462 aa  296  7e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  38.01 
 
 		 459 aa  296  7e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  37.64 
 
 		 455 aa  294  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  39.83 
 
 		 458 aa  293  5e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  39.83 
 
 		 458 aa  293  6e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  38.41 
 
 		 462 aa  291  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  36.46 
 
 		 459 aa  288  2e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  37.94 
 
 		 456 aa  286  5.999999999999999e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3161  tRNA modification GTPase TrmE  38.49 
 
 		 471 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.258894  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  37.06 
 
 		 458 aa  283  5.000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  39.48 
 
 		 459 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  35.97 
 
 		 457 aa  280  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  37.84 
 
 		 459 aa  280  3e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  35.47 
 
 		 459 aa  277  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  35.47 
 
 		 459 aa  277  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0070  tRNA modification GTPase TrmE  39.61 
 
 		 444 aa  277  3e-73  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.868206  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  36.23 
 
 		 456 aa  276  4e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  35.84 
 
 		 461 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3086  tRNA modification GTPase TrmE  38.29 
 
 		 458 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.924716  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0008  tRNA modification GTPase TrmE  38.25 
 
 		 453 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185087  hitchhiker  0.000721309 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  35.82 
 
 		 447 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  39.78 
 
 		 455 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  39.25 
 
 		 448 aa  273  6e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  37.53 
 
 		 464 aa  271  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4615  tRNA modification GTPase TrmE  37.72 
 
 		 454 aa  271  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  36.88 
 
 		 475 aa  271  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4310  tRNA modification GTPase TrmE  36.6 
 
 		 460 aa  271  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671502  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  39.52 
 
 		 456 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  34.79 
 
 		 450 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  36.46 
 
 		 455 aa  270  4e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  35.82 
 
 		 452 aa  270  5.9999999999999995e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  34.97 
 
 		 458 aa  268  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3317  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 		 446 aa  268  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  38.66 
 
 		 465 aa  267  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4245  tRNA modification GTPase TrmE  37.74 
 
 		 454 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00411948  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4928  tRNA modification GTPase TrmE  37.34 
 
 		 453 aa  268  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0035842  hitchhiker  0.00000248868 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4183  tRNA modification GTPase TrmE  37.74 
 
 		 454 aa  267  2.9999999999999995e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000380111  normal  0.0649437 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  34.87 
 
 		 441 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4158  tRNA modification GTPase TrmE  37.74 
 
 		 454 aa  267  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  34.41 
 
 		 460 aa  266  5e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4520  tRNA modification GTPase TrmE  36.99 
 
 		 453 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30842  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0027  tRNA modification GTPase TrmE  36.85 
 
 		 454 aa  266  7e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4292  tRNA modification GTPase TrmE  36.85 
 
 		 454 aa  266  7e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2515  tRNA modification GTPase TrmE  37.96 
 
 		 464 aa  265  8.999999999999999e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310293  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  39.7 
 
 		 456 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0314  tRNA modification GTPase TrmE  35.93 
 
 		 450 aa  264  2e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00576337  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0001  tRNA modification GTPase TrmE  37.74 
 
 		 453 aa  265  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.201746  hitchhiker  0.00000000323985 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0643  tRNA modification GTPase TrmE  40.04 
 
 		 452 aa  265  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.461676 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3939  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 		 453 aa  265  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114268 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4378  tRNA modification GTPase TrmE  36.77 
 
 		 453 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0292979  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2775  tRNA modification GTPase TrmE  37.34 
 
 		 452 aa  264  3e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4324  tRNA modification GTPase TrmE  36.77 
 
 		 453 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0616134  unclonable  0.00000000000430527 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4001  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 		 453 aa  264  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.73411  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4256  tRNA modification GTPase TrmE  38.03 
 
 		 453 aa  263  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257081  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  34.93 
 
 		 450 aa  263  4e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>