More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3528 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3528  tRNA pseudouridine synthase A  100 
 
 		 268 aa  543  1e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  40.83 
 
 		 244 aa  184  9e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  39.75 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0540  tRNA pseudouridine synthase A  44.49 
 
 		 259 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.999285  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3695  tRNA pseudouridine synthase A  44.9 
 
 		 245 aa  179  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.817214  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3066  tRNA pseudouridine synthase A  44.08 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301608  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5141  tRNA pseudouridine synthase A  43.32 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0391  tRNA pseudouridine synthase A  46.75 
 
 		 247 aa  172  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16094  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  41.22 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1666  tRNA pseudouridine synthase A  41.8 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0056205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  40.33 
 
 		 247 aa  169  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  38.93 
 
 		 245 aa  169  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0059  tRNA pseudouridine synthase A  43.61 
 
 		 268 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.933928  normal  0.0174964 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0076  tRNA pseudouridine synthase A  42.11 
 
 		 272 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2426  tRNA pseudouridine synthase A  43.09 
 
 		 246 aa  169  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000220887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0911  tRNA pseudouridine synthase A  39.75 
 
 		 250 aa  168  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000123783  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0717  tRNA pseudouridine synthase A  40.08 
 
 		 282 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000371927  normal  0.874871 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3352  pseudouridylate synthase  40.71 
 
 		 278 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  40.24 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  37.76 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  40.24 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2071  tRNA pseudouridine synthase A  42.26 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.179151  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1729  tRNA pseudouridine synthase A  42.26 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0992895  hitchhiker  0.00555362 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0321  tRNA pseudouridine synthase A  41.53 
 
 		 264 aa  165  8e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000566898  hitchhiker  1.98611e-17 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  40.16 
 
 		 247 aa  165  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000251416  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0263  tRNA pseudouridine synthase A  40.08 
 
 		 246 aa  165  9e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  35.1 
 
 		 248 aa  165  9e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  35.1 
 
 		 248 aa  165  9e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4830  tRNA pseudouridine synthase A  37.19 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0152439  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1033  tRNA pseudouridine synthase A  41.94 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0492  tRNA pseudouridine synthase A  37.19 
 
 		 245 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138657  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0974  tRNA pseudouridine synthase A  41.94 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0491  tRNA pseudouridine synthase A  39.76 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1150  tRNA pseudouridine synthase A  40.65 
 
 		 251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00189497  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2251  tRNA pseudouridine synthase A  45.63 
 
 		 246 aa  162  7e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218051  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0543  tRNA pseudouridine synthase A  36.78 
 
 		 245 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  36.36 
 
 		 244 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0401  tRNA pseudouridine synthase A  36.36 
 
 		 245 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0473  tRNA pseudouridine synthase A  36.36 
 
 		 245 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0407  tRNA pseudouridine synthase A  36.36 
 
 		 245 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  36.36 
 
 		 244 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2585  tRNA pseudouridine synthase A  40 
 
 		 275 aa  160  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0056  tRNA pseudouridine synthase A  41.53 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478074 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1346  tRNA pseudouridine synthase A  40.73 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  38.78 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0421  tRNA pseudouridine synthase A  36.25 
 
 		 260 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417493  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0462  tRNA pseudouridine synthase A  36.36 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0487  tRNA pseudouridine synthase A  36.36 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1130  tRNA pseudouridine synthase A  43.72 
 
 		 248 aa  160  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.131343 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0165  tRNA pseudouridine synthase A  38.71 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0543  tRNA pseudouridine synthase A  36.36 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.432297  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1048  tRNA pseudouridine synthase A  41.08 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000774285  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  41.37 
 
 		 252 aa  159  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0405  tRNA pseudouridine synthase A  36.36 
 
 		 245 aa  159  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4567  tRNA pseudouridine synthase A  40.56 
 
 		 249 aa  159  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2299  pseudouridylate synthase  38.68 
 
 		 249 aa  158  7e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000390138  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0807  tRNA pseudouridine synthase A  43.27 
 
 		 245 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2287  tRNA pseudouridine synthase A  37.71 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0252642  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2246  tRNA pseudouridine synthase A  37.71 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000374145  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0228  tRNA pseudouridine synthase A  35.69 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3729  tRNA pseudouridine synthase A  37.7 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0389  tRNA pseudouridine synthase A  42.29 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2681  tRNA pseudouridine synthase A  41.22 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0556679  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2098  tRNA pseudouridine synthase A  39.02 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0498  tRNA pseudouridine synthase A  43.55 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.276937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3303  tRNA pseudouridine synthase A  40.08 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0316618  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4191  tRNA pseudouridine synthase A  41.46 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0226  tRNA pseudouridine synthase A  40.5 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0605  tRNA pseudouridine synthase A  39.83 
 
 		 256 aa  156  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709788  hitchhiker  0.00819756 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  38.37 
 
 		 252 aa  156  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0675  tRNA pseudouridine synthase A  43.87 
 
 		 245 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0223  tRNA pseudouridine synthase A  40.5 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00472694  normal  0.027676 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  38.78 
 
 		 247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0410  tRNA pseudouridine synthase A  41.63 
 
 		 245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0409  tRNA pseudouridine synthase A  41.63 
 
 		 245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.816199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  38.37 
 
 		 252 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1318  tRNA pseudouridine synthase A  38.49 
 
 		 282 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620089  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1452  tRNA pseudouridine synthase A  37.75 
 
 		 256 aa  155  8e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000896278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  38.52 
 
 		 252 aa  155  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176686  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0255  tRNA pseudouridine synthase A  40.73 
 
 		 250 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00104612  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3634  tRNA pseudouridine synthase A  37.55 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0381  tRNA pseudouridine synthase A  41.63 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0248  tRNA pseudouridine synthase A  40.41 
 
 		 246 aa  154  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.262775 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2139  tRNA pseudouridine synthase A  39.58 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357252  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2877  tRNA pseudouridine synthase A  39 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00616108  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4238  tRNA pseudouridine synthase A  43.03 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146243 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  37.96 
 
 		 252 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2893  tRNA pseudouridine synthase A  37.05 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  37.96 
 
 		 247 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000419417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  37.96 
 
 		 247 aa  152  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0135  tRNA pseudouridine synthase A  37.96 
 
 		 247 aa  152  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000154872  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2111  tRNA pseudouridine synthase A  40.49 
 
 		 254 aa  152  5e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.110217 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  37.96 
 
 		 247 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000771013  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0937  tRNA pseudouridine synthase ACD  37.3 
 
 		 244 aa  152  7e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1685  tRNA pseudouridine synthase A  36.02 
 
 		 244 aa  151  8.999999999999999e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1985  tRNA pseudouridine synthase A  39.09 
 
 		 274 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0136  tRNA pseudouridine synthase A  38 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000296429  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2883  tRNA pseudouridine synthase A  39.83 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101662  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7335  tRNA pseudouridine synthase A  42.86 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1815  tRNA pseudouridine synthase A  38.75 
 
 		 274 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>