More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0435 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0435  response regulator receiver protein  100 
 
 		 383 aa  786    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1263  response regulator receiver protein  54.1 
 
 		 129 aa  139  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.36 
 
 		 454 aa  119  9e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2489  response regulator receiver protein  26.02 
 
 		 385 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2585  response regulator receiver protein  26.02 
 
 		 385 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1368  response regulator receiver domain-containing protein  25.95 
 
 		 386 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  26.52 
 
 		 457 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3702  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.3 
 
 		 863 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.170309 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 		 977 aa  102  8e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2571  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.73 
 
 		 406 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.156881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1642  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.27 
 
 		 406 aa  99.8  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.905013  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2262  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.99 
 
 		 853 aa  99.4  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0773  response regulator PleD  27.24 
 
 		 458 aa  98.6  2e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 		 1629 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  26.87 
 
 		 457 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  26.97 
 
 		 457 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4746  response regulator PleD  27.91 
 
 		 466 aa  96.7  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0979514  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 		 1362 aa  95.5  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  26.42 
 
 		 460 aa  95.1  2e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0304  response regulator PleD  26.37 
 
 		 458 aa  95.1  2e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0864091  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  26.59 
 
 		 457 aa  94.4  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  26.22 
 
 		 457 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 1758 aa  94  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  27.31 
 
 		 910 aa  94  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  29.15 
 
 		 1361 aa  93.6  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  35.45 
 
 		 1987 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  37.82 
 
 		 2284 aa  93.6  6e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  26.32 
 
 		 457 aa  93.6  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  36.97 
 
 		 2301 aa  93.2  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3583  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 125 aa  93.6  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2174  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  23.77 
 
 		 474 aa  93.2  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  39.84 
 
 		 1388 aa  93.2  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1497  response regulator PleD  26.77 
 
 		 454 aa  93.2  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  36.36 
 
 		 1992 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 130 aa  92.8  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 127 aa  92.4  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1864  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.1 
 
 		 457 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  0.121309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 1647 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 1646 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.44 
 
 		 916 aa  91.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.18 
 
 		 1971 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22620  response regulator receiver protein  42.28 
 
 		 124 aa  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 1646 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  25.19 
 
 		 457 aa  90.9  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 		 796 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1213  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  26.57 
 
 		 457 aa  90.9  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0907  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.74 
 
 		 457 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.401363  normal  0.40647 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  37.14 
 
 		 2301 aa  90.1  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.59 
 
 		 858 aa  89.7  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  25.22 
 
 		 457 aa  89.7  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  37.61 
 
 		 121 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.63 
 
 		 1309 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  29.39 
 
 		 970 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1205  CheY response regulator  39.84 
 
 		 123 aa  89  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.310964  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  38.02 
 
 		 124 aa  89  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  31.37 
 
 		 1355 aa  89.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2022  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.84 
 
 		 589 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.36 
 
 		 791 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  26.48 
 
 		 469 aa  88.6  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.11 
 
 		 798 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  36 
 
 		 385 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  39.2 
 
 		 403 aa  88.2  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.31 
 
 		 1145 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 2212 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4308  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  23.97 
 
 		 552 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 1013 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.17 
 
 		 812 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2080  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  29.63 
 
 		 1158 aa  87.8  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.264996 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2062  response regulator receiver protein  38.06 
 
 		 217 aa  87.8  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0467  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 122 aa  87.4  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.67 
 
 		 803 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  39.45 
 
 		 355 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.17 
 
 		 1166 aa  87.4  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  24.67 
 
 		 792 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  40 
 
 		 961 aa  87  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  25.75 
 
 		 455 aa  87  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.56 
 
 		 1287 aa  87  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.59 
 
 		 1611 aa  87  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 122 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0734  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 127 aa  87  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  37.04 
 
 		 121 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 122 aa  86.7  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  28.14 
 
 		 1200 aa  86.3  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 1725 aa  86.3  9e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 		 870 aa  86.3  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 1725 aa  86.3  9e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  24.25 
 
 		 1177 aa  85.9  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  37.4 
 
 		 133 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 121 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 126 aa  85.9  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 928 aa  85.9  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  38.66 
 
 		 132 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0931  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.25 
 
 		 457 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.104843 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  34.59 
 
 		 1366 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 		 511 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0967  diguanylate cyclase  28.25 
 
 		 457 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.555277  normal  0.0207283 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 131 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 131 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  36.36 
 
 		 2336 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 120 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>