More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4275 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4275  major facilitator transporter  100 
 
 		 470 aa  885    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1322  major facilitator superfamily transporter  41.78 
 
 		 457 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723677 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  28.61 
 
 		 473 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.6 
 
 		 505 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5411  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 		 521 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.423231 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2300  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 455 aa  114  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1058  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 471 aa  114  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.111803  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2436  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 455 aa  114  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.51 
 
 		 545 aa  113  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5717  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 455 aa  113  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 555 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.9 
 
 		 457 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 		 491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0899  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0142459 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1779  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 455 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2391  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 455 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3013  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.66 
 
 		 457 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.79 
 
 		 521 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1267  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.66 
 
 		 457 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3036  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.66 
 
 		 457 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.66 
 
 		 457 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3304  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.66 
 
 		 457 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.028238  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.49 
 
 		 509 aa  110  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3341  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.89 
 
 		 517 aa  109  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 488 aa  109  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.62 
 
 		 512 aa  109  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.72 
 
 		 493 aa  109  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3665  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 466 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.61 
 
 		 504 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.97 
 
 		 478 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3481  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.15 
 
 		 485 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0762295 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.36 
 
 		 520 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4320  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 446 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1107  transport protein YebQ  30.24 
 
 		 457 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.75 
 
 		 522 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.69 
 
 		 457 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2768  MFS family transporter  28.74 
 
 		 464 aa  107  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2166  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 498 aa  106  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4542  major facilitator superfamily transporter  31.54 
 
 		 490 aa  107  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.061139  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.58 
 
 		 504 aa  106  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5967  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2143  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 480 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172092  hitchhiker  0.000390012 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2203  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.09 
 
 		 455 aa  105  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190205  normal  0.434224 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3816  major facilitator transporter  31.42 
 
 		 491 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524764  normal  0.933625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 490 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2396  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 455 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124422 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.94 
 
 		 609 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3605  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 472 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.42 
 
 		 529 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1197  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.57 
 
 		 532 aa  103  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.365296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.45 
 
 		 480 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4444  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 453 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.54 
 
 		 540 aa  102  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3923  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 453 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2415  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.99 
 
 		 517 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.08 
 
 		 515 aa  101  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.64 
 
 		 529 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.52 
 
 		 479 aa  101  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 463 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  24.78 
 
 		 490 aa  100  5e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.96 
 
 		 541 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.85 
 
 		 520 aa  100  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.03 
 
 		 502 aa  99.8  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3300  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 497 aa  99.8  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.471538 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.5 
 
 		 515 aa  99.8  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.99 
 
 		 534 aa  99.4  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.64 
 
 		 558 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.59 
 
 		 529 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3129  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 459 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0660329 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.15 
 
 		 471 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  28.68 
 
 		 467 aa  98.2  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.56 
 
 		 537 aa  97.8  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3450  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 459 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.21 
 
 		 523 aa  98.2  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2718  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.51 
 
 		 467 aa  98.2  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815638  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.46 
 
 		 627 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4020  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.49 
 
 		 518 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.23 
 
 		 558 aa  97.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0256  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.1 
 
 		 522 aa  97.1  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.12 
 
 		 520 aa  97.1  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1455  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 443 aa  97.1  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.41 
 
 		 478 aa  97.1  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3127  major facilitator family transporter  22.71 
 
 		 463 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000190248  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.22 
 
 		 473 aa  96.7  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00107879  normal  0.0501756 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.15 
 
 		 510 aa  96.7  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.12 
 
 		 458 aa  96.7  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.21 
 
 		 486 aa  96.7  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.59 
 
 		 521 aa  96.7  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.917815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.68 
 
 		 478 aa  96.3  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5842  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 456 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.8 
 
 		 508 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.46 
 
 		 500 aa  95.9  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
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NC_010681  Bphyt_2022  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.35 
 
 		 520 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00497968 
 
 
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NC_008578  Acel_1673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.71 
 
 		 530 aa  95.1  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.472299  hitchhiker  0.00171027 
 
 
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NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.37 
 
 		 515 aa  94.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010571  Oter_3918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.73 
 
 		 495 aa  94.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.28 
 
 		 505 aa  94.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
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NC_010086  Bmul_4661  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 468 aa  94.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.58 
 
 		 527 aa  94.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 		 466 aa  94.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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